RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579417.1

PLXDC1-217, Transcript of plexin domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene PLXDC1, Length 568 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1-217ENST00000579417 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.61■■□□□ 1.69
PLXDC1-217ENST00000579417 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PLXDC1-217ENST00000579417 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.61■■□□□ 1.69
PLXDC1-217ENST00000579417 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
PLXDC1-217ENST00000579417 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.59■■□□□ 1.69
PLXDC1-217ENST00000579417 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
PLXDC1-217ENST00000579417 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.57■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 KIF15Q9NS87 1388 aa25.56■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.55■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.55■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.54■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 REREQ9P2R6 1566 aa25.54■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.53■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 ATP7AQ04656 1500 aa25.53■■□□□ 1.68
PLXDC1-217ENST00000579417 ABCA6Q8N139 1617 aa25.51■■□□□ 1.67
PLXDC1-217ENST00000579417 AGLP35573 1532 aa25.5■■□□□ 1.67
PLXDC1-217ENST00000579417 ERBINQ96RT1 1412 aa25.48■■□□□ 1.67
PLXDC1-217ENST00000579417 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.48■■□□□ 1.67
PLXDC1-217ENST00000579417 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PLXDC1-217ENST00000579417 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.44■■□□□ 1.66
PLXDC1-217ENST00000579417 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.43■■□□□ 1.66
PLXDC1-217ENST00000579417 UNC13BO14795 1591 aa25.41■■□□□ 1.66
PLXDC1-217ENST00000579417 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
PLXDC1-217ENST00000579417 C3P01024 1663 aa25.4■■□□□ 1.66
PLXDC1-217ENST00000579417 STRCQ7RTU9 1775 aa25.38■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 ZMYM3Q14202 1370 aa25.37■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 TRIM52Q96A61 297 aa25.37■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 PTPRTO14522 1441 aa25.36■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 PZPP20742 1482 aa25.34■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 GGT6Q6P531 493 aa25.34■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 DEPDC5O75140 1603 aa25.34■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.33■■□□□ 1.65
PLXDC1-217ENST00000579417 A2MP01023 1474 aa25.31■■□□□ 1.64
PLXDC1-217ENST00000579417 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.3■■□□□ 1.64
PLXDC1-217ENST00000579417 NPATQ14207 1427 aa25.3■■□□□ 1.64
PLXDC1-217ENST00000579417 NUP155O75694 1391 aa25.29■■□□□ 1.64
PLXDC1-217ENST00000579417 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.26■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.26■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 MROH2AA6NES4 1674 aa25.23■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.23■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.22■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.21■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.21■■□□□ 1.63
PLXDC1-217ENST00000579417 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.19■■□□□ 1.62
PLXDC1-217ENST00000579417 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PLXDC1-217ENST00000579417 PKD2Q13563 968 aa25.18■■□□□ 1.62
PLXDC1-217ENST00000579417 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.18■■□□□ 1.62
PLXDC1-217ENST00000579417 KANK1Q14678 1352 aa25.16■■□□□ 1.62
PLXDC1-217ENST00000579417 KIF3BO15066 747 aa25.15■■□□□ 1.62
PLXDC1-217ENST00000579417 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.15■■□□□ 1.62
PLXDC1-217ENST00000579417 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.14■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 TET3O43151 1660 aa25.13■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.13■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.1■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.09■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 PLA2R1Q13018 1463 aa25.09■■□□□ 1.61
PLXDC1-217ENST00000579417 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.08■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.07■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 E9PCH4 1651 aa25.05■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 FOXD1Q16676 465 aa25.05■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.03■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.02■■□□□ 1.6
PLXDC1-217ENST00000579417 CEP152O94986 1710 aa25.01■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 NEUROD1Q13562 356 aa25.01■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 TNRQ92752 1358 aa25.01■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 ILDR2Q71H61 639 aa25■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 ABCC3O15438 1527 aa25■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 TONSLQ96HA7 1378 aa24.99■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.97■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
PLXDC1-217ENST00000579417 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1-217ENST00000579417 TRPM2O94759 1503 aa24.95■■□□□ 1.58
PLXDC1-217ENST00000579417 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.94■■□□□ 1.58
PLXDC1-217ENST00000579417 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.92■■□□□ 1.58
PLXDC1-217ENST00000579417 SOCS7O14512 581 aa24.9■■□□□ 1.58
PLXDC1-217ENST00000579417 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
PLXDC1-217ENST00000579417 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.88■■□□□ 1.57
PLXDC1-217ENST00000579417 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1-217ENST00000579417 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.86■■□□□ 1.57
PLXDC1-217ENST00000579417 NLRP1Q9C000 1473 aa24.85■■□□□ 1.57
PLXDC1-217ENST00000579417 TOM1O60784 492 aa24.85■■□□□ 1.57
PLXDC1-217ENST00000579417 PIP4K2BP78356 416 aa24.84■■□□□ 1.57
PLXDC1-217ENST00000579417 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.84■■□□□ 1.57
PLXDC1-217ENST00000579417 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.82■■□□□ 1.56
PLXDC1-217ENST00000579417 NOS1P29475 1434 aa24.81■■□□□ 1.56
PLXDC1-217ENST00000579417 CLTCL1P53675 1640 aa24.81■■□□□ 1.56
PLXDC1-217ENST00000579417 CPS1P31327 1500 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms