RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571386.1

SPNS2-204, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 5

Gene SPNS2, Length 846 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-204ENST00000571386 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS2-204ENST00000571386 MBD5Q9P267 1494 aa26.1■■□□□ 1.77
SPNS2-204ENST00000571386 GGT6Q6P531 493 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS2-204ENST00000571386 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS2-204ENST00000571386 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.08■■□□□ 1.77
SPNS2-204ENST00000571386 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS2-204ENST00000571386 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SPNS2-204ENST00000571386 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS2-204ENST00000571386 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
SPNS2-204ENST00000571386 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.06■■□□□ 1.76
SPNS2-204ENST00000571386 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS2-204ENST00000571386 CPS1P31327 1500 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS2-204ENST00000571386 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.99■■□□□ 1.75
SPNS2-204ENST00000571386 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SPNS2-204ENST00000571386 MIA2Q96PC5 1412 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS2-204ENST00000571386 TSPY4P0CV99 314 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS2-204ENST00000571386 TSPY10P0CW01 314 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS2-204ENST00000571386 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS2-204ENST00000571386 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 HSPA1LP34931 641 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.95■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 PZPP20742 1482 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 PIP4K2BP78356 416 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 TNRQ92752 1358 aa25.94■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 TOM1O60784 492 aa25.89■■□□□ 1.74
SPNS2-204ENST00000571386 DEPDC5O75140 1603 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 ALKQ9UM73 1620 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 IQGAP1P46940 1657 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 NLRP1Q9C000 1473 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 KIF3BO15066 747 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.84■■□□□ 1.73
SPNS2-204ENST00000571386 MED14O60244 1454 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 SYNMO15061 1565 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.79■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS2-204ENST00000571386 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS2-204ENST00000571386 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
SPNS2-204ENST00000571386 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS2-204ENST00000571386 ABCC5O15440 1437 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-204ENST00000571386 ABCC3O15438 1527 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-204ENST00000571386 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-204ENST00000571386 DAPK1P53355 1430 aa25.71■■□□□ 1.71
SPNS2-204ENST00000571386 KIF15Q9NS87 1388 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 CEP152O94986 1710 aa25.68■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.68■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 ERVK-7P63135 1459 aa25.66■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.65■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.64■■□□□ 1.7
SPNS2-204ENST00000571386 ERBINQ96RT1 1412 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS2-204ENST00000571386 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
SPNS2-204ENST00000571386 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
SPNS2-204ENST00000571386 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.59■■□□□ 1.69
SPNS2-204ENST00000571386 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SPNS2-204ENST00000571386 SLIT1O75093 1534 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS2-204ENST00000571386 KANK1Q14678 1352 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-204ENST00000571386 ADGRL2O95490 1459 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.52■■□□□ 1.68
SPNS2-204ENST00000571386 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
SPNS2-204ENST00000571386 PIK3C2BO00750 1634 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS2-204ENST00000571386 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
SPNS2-204ENST00000571386 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
SPNS2-204ENST00000571386 LTKP29376 864 aa25.45■■□□□ 1.66
SPNS2-204ENST00000571386 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS2-204ENST00000571386 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-204ENST00000571386 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-204ENST00000571386 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS2-204ENST00000571386 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
SPNS2-204ENST00000571386 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 EID1Q9Y6B2 187 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 ROCK1Q13464 1354 aa25.36■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.36■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.36■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 ITGAEP38570 1179 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 TMEM94Q12767 1356 aa25.34■■□□□ 1.65
SPNS2-204ENST00000571386 NWD1Q149M9 1564 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS2-204ENST00000571386 POTEAQ6S8J7 498 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS2-204ENST00000571386 TET3O43151 1660 aa25.29■■□□□ 1.64
SPNS2-204ENST00000571386 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SPNS2-204ENST00000571386 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.28■■□□□ 1.64
SPNS2-204ENST00000571386 PHLPP1O60346 1717 aa25.28■■□□□ 1.64
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