RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS1-211ENST00000568829 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS1-211ENST00000568829 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS1-211ENST00000568829 PLA2R1Q13018 1463 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-211ENST00000568829 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS1-211ENST00000568829 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SPNS1-211ENST00000568829 PZPP20742 1482 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
SPNS1-211ENST00000568829 TNRQ92752 1358 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS1-211ENST00000568829 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.85■■□□□ 1.73
SPNS1-211ENST00000568829 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.82■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.8■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 KIF15Q9NS87 1388 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 NLRP1Q9C000 1473 aa25.77■■□□□ 1.72
SPNS1-211ENST00000568829 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.75■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC5O15440 1437 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 ERBINQ96RT1 1412 aa25.74■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 DAPK1P53355 1430 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.73■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 ABCC3O15438 1527 aa25.72■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 KANK1Q14678 1352 aa25.7■■□□□ 1.71
SPNS1-211ENST00000568829 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.69■■□□□ 1.7
SPNS1-211ENST00000568829 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.67■■□□□ 1.7
SPNS1-211ENST00000568829 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.67■■□□□ 1.7
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
SPNS1-211ENST00000568829 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SPNS1-211ENST00000568829 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.64■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.63■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 ERVK-7P63135 1459 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.62■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.6■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
SPNS1-211ENST00000568829 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 CEP152O94986 1710 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 MED14O60244 1454 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.54■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRL2O95490 1459 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 CPS1P31327 1500 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 DEPDC5O75140 1603 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.53■■□□□ 1.68
SPNS1-211ENST00000568829 EID1Q9Y6B2 187 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-211ENST00000568829 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.51■■□□□ 1.67
SPNS1-211ENST00000568829 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.48■■□□□ 1.67
SPNS1-211ENST00000568829 TOM1O60784 492 aa25.47■■□□□ 1.67
SPNS1-211ENST00000568829 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.44■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 IQGAP1P46940 1657 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.42■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 SLIT1O75093 1534 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 ROCK1Q13464 1354 aa25.4■■□□□ 1.66
SPNS1-211ENST00000568829 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.38■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 IDI1Q13907 227 aa25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 LTKP29376 864 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 NOS1P29475 1434 aa25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 PIK3C2BO00750 1634 aa25.33■■□□□ 1.65
SPNS1-211ENST00000568829 PIP4K2BP78356 416 aa25.31■■□□□ 1.64
SPNS1-211ENST00000568829 ITGAEP38570 1179 aa25.3■■□□□ 1.64
SPNS1-211ENST00000568829 SYNMO15061 1565 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-211ENST00000568829 TET3O43151 1660 aa25.27■■□□□ 1.64
SPNS1-211ENST00000568829 BCANQ96GW7 911 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 ADGRB3O60242 1522 aa25.26■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 UNC13BO14795 1591 aa25.25■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 NUP155O75694 1391 aa25.23■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
SPNS1-211ENST00000568829 KCNA6P17658 529 aa25.19■■□□□ 1.62
SPNS1-211ENST00000568829 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-211ENST00000568829 HSPA1LP34931 641 aa25.18■■□□□ 1.62
SPNS1-211ENST00000568829 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-211ENST00000568829 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.16■■□□□ 1.62
SPNS1-211ENST00000568829 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms