RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567895.5

TRAPPC2L-213, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, human

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 854 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.62	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.62	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NPAT	Q14207	1427 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.59	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	HSPA2	P54652	639 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.8
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ABCC3	O15438	1527 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PZP	P20742	1482 aa		32.48	■■■□□ 2.79
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ITGAE	P38570	1179 aa		32.46	■■■□□ 2.79
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.44	■■■□□ 2.78
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.44	■■■□□ 2.78	2e-6	■■■□□ 19.1
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KANK1	Q14678	1352 aa		32.4	■■■□□ 2.78
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TNR	Q92752	1358 aa		32.38	■■■□□ 2.77
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.34	■■■□□ 2.77
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.33	■■■□□ 2.77
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.32	■■■□□ 2.77
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CEP152	O94986	1710 aa		32.32	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.31	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.3	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.29	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.28	■■■□□ 2.76
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.26	■■■□□ 2.75
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.25	■■■□□ 2.75
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.24	■■■□□ 2.75
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	UNC13B	O14795	1591 aa		32.19	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PKD2	Q13563	968 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PTPRT	O14522	1441 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.16	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NAIP	Q13075	1403 aa		32.15	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.14	■■■□□ 2.74
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NUP155	O75694	1391 aa		32.13	■■■□□ 2.73
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.12	■■■□□ 2.73
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NOS1	P29475	1434 aa		32.09	■■■□□ 2.73
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TET3	O43151	1660 aa		32.08	■■■□□ 2.73
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.06	■■■□□ 2.72
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	IDI1	Q13907	227 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.04	■■■□□ 2.72
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.02	■■■□□ 2.72
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SYNM	O15061	1565 aa		32.01	■■■□□ 2.71
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		31.96	■■■□□ 2.71
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895		E9PCH4	1651 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MED14	O60244	1454 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TRIM52	Q96A61	297 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SLIT1	O75093	1534 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	LTK	P29376	864 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	EID1	Q9Y6B2	187 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.84	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	31.84	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		31.82	■■■□□ 2.69
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	FBXO41	Q8TF61	875 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.68
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		31.68	■■■□□ 2.66
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	TRPM2	O94759	1503 aa		31.67	■■■□□ 2.66
TRAPPC2L-213	ENST00000567895	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		31.66	■■■□□ 2.66

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