RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
SPNS1-209ENST00000567771 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.98■■■■□ 3.99
SPNS1-209ENST00000567771 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
SPNS1-209ENST00000567771 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa39.97■■■■□ 3.99
SPNS1-209ENST00000567771 FAM135AQ9P2D6 1515 aa39.96■■■■□ 3.99
SPNS1-209ENST00000567771 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.95■■■■□ 3.99
SPNS1-209ENST00000567771 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
SPNS1-209ENST00000567771 PZPP20742 1482 aa39.9■■■■□ 3.98
SPNS1-209ENST00000567771 PLA2R1Q13018 1463 aa39.89■■■■□ 3.98
SPNS1-209ENST00000567771 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.88■■■■□ 3.97
SPNS1-209ENST00000567771 TNRQ92752 1358 aa39.87■■■■□ 3.97
SPNS1-209ENST00000567771 PKD2Q13563 968 aa39.85■■■■□ 3.97
SPNS1-209ENST00000567771 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.83■■■■□ 3.97
SPNS1-209ENST00000567771 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
SPNS1-209ENST00000567771 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
SPNS1-209ENST00000567771 PTPN23Q9H3S7 1636 aa39.83■■■■□ 3.97
SPNS1-209ENST00000567771 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.82■■■■□ 3.96
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC5O15440 1437 aa39.81■■■■□ 3.96
SPNS1-209ENST00000567771 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP39.8■■■■□ 3.96
SPNS1-209ENST00000567771 FGD6Q6ZV73 1430 aa39.77■■■■□ 3.96
SPNS1-209ENST00000567771 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.76■■■■□ 3.96
SPNS1-209ENST00000567771 ABCC3O15438 1527 aa39.75■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.75■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 MROH1Q8NDA8 1641 aa39.73■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.73■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 DAPK1P53355 1430 aa39.73■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 KIF15Q9NS87 1388 aa39.72■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.71■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.71■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
SPNS1-209ENST00000567771 NLRP1Q9C000 1473 aa39.67■■■■□ 3.94
SPNS1-209ENST00000567771 ERBINQ96RT1 1412 aa39.64■■■■□ 3.94
SPNS1-209ENST00000567771 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.62■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.62■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.62■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 CEP152O94986 1710 aa39.62■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP39.61■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.61■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 UGGT1Q9NYU2 1555 aa39.6■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 ERVK-7P63135 1459 aa39.59■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.58■■■■□ 3.93
SPNS1-209ENST00000567771 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP39.57■■■■□ 3.92
SPNS1-209ENST00000567771 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.56■■■■□ 3.92
SPNS1-209ENST00000567771 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP39.55■■■■□ 3.92
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.55■■■■□ 3.92
SPNS1-209ENST00000567771 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.53■■■■□ 3.92
SPNS1-209ENST00000567771 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP39.49■■■■□ 3.91
SPNS1-209ENST00000567771 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa39.48■■■■□ 3.91
SPNS1-209ENST00000567771 DEPDC5O75140 1603 aa39.47■■■■□ 3.91
SPNS1-209ENST00000567771 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP39.43■■■■□ 3.9
SPNS1-209ENST00000567771 KANK1Q14678 1352 aa39.43■■■■□ 3.9
SPNS1-209ENST00000567771 MED14O60244 1454 aa39.43■■■■□ 3.9
SPNS1-209ENST00000567771 ADGRL2O95490 1459 aa39.42■■■■□ 3.9
SPNS1-209ENST00000567771 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.38■■■■□ 3.89
SPNS1-209ENST00000567771 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.35■■■■□ 3.89
SPNS1-209ENST00000567771 VWDEQ8N2E2 1590 aa39.34■■■■□ 3.89
SPNS1-209ENST00000567771 LMTK2Q8IWU2 1503 aa39.34■■■■□ 3.89
SPNS1-209ENST00000567771 CPS1P31327 1500 aa39.32■■■■□ 3.89
SPNS1-209ENST00000567771 IQGAP1P46940 1657 aa39.3■■■■□ 3.88
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.27■■■■□ 3.88
SPNS1-209ENST00000567771 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.24■■■■□ 3.87
SPNS1-209ENST00000567771 LTKP29376 864 aa39.23■■■■□ 3.87
SPNS1-209ENST00000567771 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.23■■■■□ 3.87
SPNS1-209ENST00000567771 PIK3C2BO00750 1634 aa39.22■■■■□ 3.87
SPNS1-209ENST00000567771 SLIT1O75093 1534 aa39.22■■■■□ 3.87
SPNS1-209ENST00000567771 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.21■■■■□ 3.87
SPNS1-209ENST00000567771 IDI1Q13907 227 aa39.2■■■■□ 3.87
SPNS1-209ENST00000567771 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.19■■■■□ 3.86
SPNS1-209ENST00000567771 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.19■■■■□ 3.86
SPNS1-209ENST00000567771 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.18■■■■□ 3.86
SPNS1-209ENST00000567771 NOS1P29475 1434 aa39.16■■■■□ 3.86
SPNS1-209ENST00000567771 SYNMO15061 1565 aa39.16■■■■□ 3.86
SPNS1-209ENST00000567771 EID1Q9Y6B2 187 aa39.14■■■■□ 3.86
SPNS1-209ENST00000567771 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.13■■■■□ 3.85
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.13■■■■□ 3.85
SPNS1-209ENST00000567771 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.12■■■■□ 3.85
SPNS1-209ENST00000567771 TOM1O60784 492 aa39.11■■■■□ 3.85
SPNS1-209ENST00000567771 ROCK1Q13464 1354 aa39.08■■■■□ 3.85
SPNS1-209ENST00000567771 PIP4K2BP78356 416 aa39.08■■■■□ 3.85
SPNS1-209ENST00000567771 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.08■■■■□ 3.85
SPNS1-209ENST00000567771 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
SPNS1-209ENST00000567771 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.05■■■■□ 3.84
SPNS1-209ENST00000567771 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.05■■■■□ 3.84
SPNS1-209ENST00000567771 ITGAEP38570 1179 aa39.05■■■■□ 3.84
SPNS1-209ENST00000567771 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.05■■■■□ 3.84
SPNS1-209ENST00000567771 UNC13BO14795 1591 aa39.02■■■■□ 3.84
SPNS1-209ENST00000567771 TET3O43151 1660 aa39.02■■■■□ 3.84
SPNS1-209ENST00000567771 ADGRB3O60242 1522 aa39■■■■□ 3.83
SPNS1-209ENST00000567771 ALKQ9UM73 1620 aa38.97■■■■□ 3.83
SPNS1-209ENST00000567771 HSPA1LP34931 641 aa38.96■■■■□ 3.83
SPNS1-209ENST00000567771 GCC2Q8IWJ2 1684 aa38.94■■■■□ 3.82
SPNS1-209ENST00000567771 ILDR2Q71H61 639 aa38.92■■■■□ 3.82
SPNS1-209ENST00000567771 SLC26A8Q96RN1 970 aa38.88■■■■□ 3.81
SPNS1-209ENST00000567771 IQGAP3Q86VI3 1631 aa38.87■■■■□ 3.81
SPNS1-209ENST00000567771 NUP155O75694 1391 aa38.86■■■■□ 3.81
SPNS1-209ENST00000567771 E9PCH4 1651 aa38.86■■■■□ 3.81
SPNS1-209ENST00000567771 ZFYVE9O95405 1425 aa38.81■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 KCNA6P17658 529 aa38.81■■■■□ 3.8
SPNS1-209ENST00000567771 MYO5BQ9ULV0 1848 aa38.81■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.9 ms