RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565787.1

CHTF18-216, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 607 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-216ENST00000565787 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CHTF18-216ENST00000565787 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.7■■■■□ 3.47
CHTF18-216ENST00000565787 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.69■■■■□ 3.46
CHTF18-216ENST00000565787 PTPRKQ15262 1439 aa36.66■■■■□ 3.46
CHTF18-216ENST00000565787 KIF15Q9NS87 1388 aa36.65■■■■□ 3.46
CHTF18-216ENST00000565787 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.61■■■■□ 3.45
CHTF18-216ENST00000565787 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CHTF18-216ENST00000565787 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.59■■■■□ 3.45
CHTF18-216ENST00000565787 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.58■■■■□ 3.45
CHTF18-216ENST00000565787 ERBINQ96RT1 1412 aa36.58■■■■□ 3.45
CHTF18-216ENST00000565787 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.58■■■■□ 3.45
CHTF18-216ENST00000565787 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
CHTF18-216ENST00000565787 STRCQ7RTU9 1775 aa36.56■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.55■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.55■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 ADGRL2O95490 1459 aa36.55■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 PZPP20742 1482 aa36.55■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.54■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 ABCC3O15438 1527 aa36.54■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 NCOA1Q15788 1441 aa36.53■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
CHTF18-216ENST00000565787 CEP152O94986 1710 aa36.5■■■■□ 3.43
CHTF18-216ENST00000565787 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.49■■■■□ 3.43
CHTF18-216ENST00000565787 DEPDC5O75140 1603 aa36.48■■■■□ 3.43
CHTF18-216ENST00000565787 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.48■■■■□ 3.43
CHTF18-216ENST00000565787 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.44■■■■□ 3.42
CHTF18-216ENST00000565787 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.44■■■■□ 3.42
CHTF18-216ENST00000565787 TNRQ92752 1358 aa36.41■■■■□ 3.42
CHTF18-216ENST00000565787 A2ML1A8K2U0 1454 aa36.38■■■■□ 3.41
CHTF18-216ENST00000565787 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.414e-8■□□□□ 10
CHTF18-216ENST00000565787 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36.35■■■■□ 3.41
CHTF18-216ENST00000565787 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
CHTF18-216ENST00000565787 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.33■■■■□ 3.41
CHTF18-216ENST00000565787 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.32■■■■□ 3.41
CHTF18-216ENST00000565787 ERVK-7P63135 1459 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 PLA2R1Q13018 1463 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.31■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.44e-7■■■□□ 16.1
CHTF18-216ENST00000565787 PTPRTO14522 1441 aa36.3■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 ROCK1Q13464 1354 aa36.29■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 KANK1Q14678 1352 aa36.29■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.29■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 NLRP1Q9C000 1473 aa36.29■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.28■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
CHTF18-216ENST00000565787 ITGAEP38570 1179 aa36.2■■■■□ 3.39
CHTF18-216ENST00000565787 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa36.19■■■■□ 3.38
CHTF18-216ENST00000565787 UGGT1Q9NYU2 1555 aa36.19■■■■□ 3.38
CHTF18-216ENST00000565787 PKD2Q13563 968 aa36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-216ENST00000565787 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-216ENST00000565787 UNC13BO14795 1591 aa36.18■■■■□ 3.38
CHTF18-216ENST00000565787 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
CHTF18-216ENST00000565787 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.16■■■■□ 3.38
CHTF18-216ENST00000565787 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.1■■■■□ 3.37
CHTF18-216ENST00000565787 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
CHTF18-216ENST00000565787 TET3O43151 1660 aa36.09■■■■□ 3.37
CHTF18-216ENST00000565787 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.08■■■■□ 3.37
CHTF18-216ENST00000565787 CERKQ8TCT0 537 aa36.06■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.06■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 SYNMO15061 1565 aa36.04■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 FBXO41Q8TF61 875 aa36.03■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 LTBP4Q8N2S1 1624 aa36.03■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 NOS1P29475 1434 aa36.02■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 PIK3C2BO00750 1634 aa36.02■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.02■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
CHTF18-216ENST00000565787 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.99■■■■□ 3.35
CHTF18-216ENST00000565787 MED14O60244 1454 aa35.96■■■■□ 3.35
CHTF18-216ENST00000565787 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
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CHTF18-216ENST00000565787 SLIT1O75093 1534 aa35.92■■■■□ 3.34
CHTF18-216ENST00000565787 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.92■■■■□ 3.34
CHTF18-216ENST00000565787 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.91■■■■□ 3.34
CHTF18-216ENST00000565787 NAIPQ13075 1403 aa35.91■■■■□ 3.34
CHTF18-216ENST00000565787 NUP155O75694 1391 aa35.9■■■■□ 3.34
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CHTF18-216ENST00000565787 IQGAP1P46940 1657 aa35.9■■■■□ 3.34
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CHTF18-216ENST00000565787 ADGRB3O60242 1522 aa35.85■■■■□ 3.33
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CHTF18-216ENST00000565787 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.84■■■■□ 3.33
CHTF18-216ENST00000565787 HFM1A2PYH4 1435 aa35.83■■■■□ 3.33
CHTF18-216ENST00000565787 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.81■■■■□ 3.32
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CHTF18-216ENST00000565787 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.8■■■■□ 3.32
CHTF18-216ENST00000565787 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.79■■■■□ 3.32
CHTF18-216ENST00000565787 LTKP29376 864 aa35.78■■■■□ 3.32
CHTF18-216ENST00000565787 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.76■■■■□ 3.32
CHTF18-216ENST00000565787 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.73■■■■□ 3.31
CHTF18-216ENST00000565787 EID1Q9Y6B2 187 aa35.73■■■■□ 3.31
CHTF18-216ENST00000565787 CPS1P31327 1500 aa35.71■■■■□ 3.31
CHTF18-216ENST00000565787 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.71■■■■□ 3.31
CHTF18-216ENST00000565787 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.67■■■■□ 3.3
CHTF18-216ENST00000565787 ZFYVE9O95405 1425 aa35.62■■■■□ 3.29
CHTF18-216ENST00000565787 RIMS2Q9UQ26 1411 aa35.57■■■■□ 3.29
CHTF18-216ENST00000565787 TRIM52Q96A61 297 aa35.57■■■■□ 3.28
CHTF18-216ENST00000565787 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
CHTF18-216ENST00000565787 TRPM2O94759 1503 aa35.54■■■■□ 3.28
CHTF18-216ENST00000565787 CLTCL1P53675 1640 aa35.51■■■■□ 3.28
CHTF18-216ENST00000565787 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.49■■■■□ 3.27
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