RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565483.1

STX4-215, Transcript of syntaxin 4, human

TSL 5

Gene STX4, Length 846 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STX4-215	ENST00000565483	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	34.31	■■■■□ 3.08
STX4-215	ENST00000565483	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		34.3	■■■■□ 3.08
STX4-215	ENST00000565483	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	34.3	■■■■□ 3.08
STX4-215	ENST00000565483	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		34.3	■■■■□ 3.08
STX4-215	ENST00000565483	MIA2	Q96PC5	1412 aa		34.3	■■■■□ 3.08
STX4-215	ENST00000565483	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		34.26	■■■■□ 3.07
STX4-215	ENST00000565483	TNR	Q92752	1358 aa		34.23	■■■■□ 3.07
STX4-215	ENST00000565483	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		34.21	■■■■□ 3.07
STX4-215	ENST00000565483	PZP	P20742	1482 aa		34.21	■■■■□ 3.07
STX4-215	ENST00000565483	PLA2R1	Q13018	1463 aa		34.2	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		34.19	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		34.19	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	PKD2	Q13563	968 aa		34.17	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	34.16	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	34.16	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	34.15	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		34.15	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	34.14	■■■■□ 3.06
STX4-215	ENST00000565483	ABCC5	O15440	1437 aa		34.13	■■■■□ 3.05
STX4-215	ENST00000565483	ABCC3	O15438	1527 aa		34.11	■■■■□ 3.05
STX4-215	ENST00000565483	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	34.09	■■■■□ 3.05
STX4-215	ENST00000565483	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		34.09	■■■■□ 3.05
STX4-215	ENST00000565483	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		34.09	■■■■□ 3.05
STX4-215	ENST00000565483	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		34.08	■■■■□ 3.05
STX4-215	ENST00000565483	KIF15	Q9NS87	1388 aa		34.08	■■■■□ 3.05
STX4-215	ENST00000565483	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		34.07	■■■■□ 3.04
STX4-215	ENST00000565483	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		34.06	■■■■□ 3.04
STX4-215	ENST00000565483	DAPK1	P53355	1430 aa		34.04	■■■■□ 3.04
STX4-215	ENST00000565483	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		34.04	■■■■□ 3.04
STX4-215	ENST00000565483	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	34.03	■■■■□ 3.04	3e-8	■□□□□ 8.2
STX4-215	ENST00000565483	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	34.02	■■■■□ 3.04
STX4-215	ENST00000565483	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		34.01	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	CEP152	O94986	1710 aa		34.01	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	NLRP1	Q9C000	1473 aa		34.01	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		33.98	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	33.98	■■■■□ 3.03	4e-7	■■■□□ 15.6
STX4-215	ENST00000565483	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	33.97	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		33.97	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	33.96	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	ERVK-7	P63135	1459 aa		33.96	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		33.96	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.96	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		33.95	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		33.95	■■■■□ 3.03
STX4-215	ENST00000565483	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	33.91	■■■■□ 3.02
STX4-215	ENST00000565483	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	33.9	■■■■□ 3.02
STX4-215	ENST00000565483	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	33.9	■■■■□ 3.02
STX4-215	ENST00000565483	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.89	■■■■□ 3.02
STX4-215	ENST00000565483	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		33.88	■■■■□ 3.01
STX4-215	ENST00000565483	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	33.85	■■■■□ 3.01
STX4-215	ENST00000565483	KANK1	Q14678	1352 aa		33.82	■■■■□ 3
STX4-215	ENST00000565483	DEPDC5	O75140	1603 aa		33.82	■■■■□ 3
STX4-215	ENST00000565483	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		33.79	■■■■□ 3
STX4-215	ENST00000565483	MED14	O60244	1454 aa		33.78	■■■■□ 3
STX4-215	ENST00000565483	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		33.76	■■■□□ 2.99
STX4-215	ENST00000565483	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		33.76	■■■□□ 2.99
STX4-215	ENST00000565483	ADGRL2	O95490	1459 aa		33.74	■■■□□ 2.99
STX4-215	ENST00000565483	IQGAP1	P46940	1657 aa		33.74	■■■□□ 2.99
STX4-215	ENST00000565483	CPS1	P31327	1500 aa		33.74	■■■□□ 2.99
STX4-215	ENST00000565483	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		33.71	■■■□□ 2.99
STX4-215	ENST00000565483	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	33.68	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		33.68	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	LTK	P29376	864 aa		33.67	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	33.67	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	PIK3C2B	O00750	1634 aa		33.66	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		33.66	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		33.65	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	PIP4K2B	P78356	416 aa		33.65	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		33.65	■■■□□ 2.98
STX4-215	ENST00000565483	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		33.63	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		33.62	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	IDI1	Q13907	227 aa		33.61	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	SLIT1	O75093	1534 aa		33.61	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	SYNM	O15061	1565 aa		33.6	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	EID1	Q9Y6B2	187 aa		33.59	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		33.59	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	TOM1	O60784	492 aa		33.58	■■■□□ 2.97
STX4-215	ENST00000565483	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		33.57	■■■□□ 2.96
STX4-215	ENST00000565483	ITGAE	P38570	1179 aa		33.56	■■■□□ 2.96
STX4-215	ENST00000565483	NOS1	P29475	1434 aa		33.54	■■■□□ 2.96
STX4-215	ENST00000565483	ILDR2	Q71H61	639 aa		33.53	■■■□□ 2.96
STX4-215	ENST00000565483	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		33.53	■■■□□ 2.96
STX4-215	ENST00000565483	HSPA1L	P34931	641 aa		33.51	■■■□□ 2.95
STX4-215	ENST00000565483	ADGRB3	O60242	1522 aa		33.47	■■■□□ 2.95
STX4-215	ENST00000565483	ALK	Q9UM73	1620 aa		33.46	■■■□□ 2.95
STX4-215	ENST00000565483	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	33.45	■■■□□ 2.95
STX4-215	ENST00000565483	ROCK1	Q13464	1354 aa		33.45	■■■□□ 2.94
STX4-215	ENST00000565483	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		33.44	■■■□□ 2.94
STX4-215	ENST00000565483	TET3	O43151	1660 aa		33.44	■■■□□ 2.94
STX4-215	ENST00000565483	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
STX4-215	ENST00000565483	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
STX4-215	ENST00000565483	UNC13B	O14795	1591 aa		33.43	■■■□□ 2.94
STX4-215	ENST00000565483	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		33.41	■■■□□ 2.94
STX4-215	ENST00000565483	BCAN	Q96GW7	911 aa		33.37	■■■□□ 2.93
STX4-215	ENST00000565483	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		33.36	■■■□□ 2.93
STX4-215	ENST00000565483	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	33.34	■■■□□ 2.93
STX4-215	ENST00000565483	NUP155	O75694	1391 aa		33.33	■■■□□ 2.93
STX4-215	ENST00000565483		E9PCH4	1651 aa		33.32	■■■□□ 2.92
STX4-215	ENST00000565483	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		33.3	■■■□□ 2.92

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