RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563443.1

PRMT7-208, Transcript of protein arginine methyltransferase 7, human

TSL 3

Gene PRMT7, Length 540 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRMT7-208	ENST00000563443	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		14.15	□□□□□ -0.14
PRMT7-208	ENST00000563443	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		14.15	□□□□□ -0.14
PRMT7-208	ENST00000563443	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	14.14	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	NCOA1	Q15788	1441 aa		14.14	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		14.13	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		14.13	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	KIF3B	O15066	747 aa		14.13	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	PKD2	Q13563	968 aa		14.13	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	APLP2	Q06481	763 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	PTPRK	Q15262	1439 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	KCNA4	P22459	653 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		14.11	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	MAP3K1	Q13233	1512 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	PLA2R1	Q13018	1463 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PRMT7-208	ENST00000563443	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		14.08	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	14.07	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	MIA2	Q96PC5	1412 aa		14.07	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	TNR	Q92752	1358 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		14.04	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	PZP	P20742	1482 aa		14.04	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	14.03	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	14.03	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		14.03	□□□□□ -0.16
PRMT7-208	ENST00000563443	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	14.02	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		14.02	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		14.01	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	NLRP1	Q9C000	1473 aa		14	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	14	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	14	□□□□□ -0.17	4e-7	■■■■□ 23.1
PRMT7-208	ENST00000563443	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PRMT7-208	ENST00000563443	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.96	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	13.95	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	ABCC3	O15438	1527 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	KANK1	Q14678	1352 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	CPS1	P31327	1500 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	TOM1	O60784	492 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	SOCS7	O14512	581 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	ABCC5	O15440	1437 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	MED14	O60244	1454 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PRMT7-208	ENST00000563443	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.9	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		13.9	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	DAPK1	P53355	1430 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	EID1	Q9Y6B2	187 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	CEP152	O94986	1710 aa		13.86	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	PIP4K2B	P78356	416 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	IQGAP1	P46940	1657 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
PRMT7-208	ENST00000563443	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	ILDR2	Q71H61	639 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	SLIT1	O75093	1534 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	ADGRL2	O95490	1459 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	LTK	P29376	864 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	HSPA1L	P34931	641 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PRMT7-208	ENST00000563443	IDI1	Q13907	227 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PRMT7-208	ENST00000563443		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PRMT7-208	ENST00000563443	SYNM	O15061	1565 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PRMT7-208	ENST00000563443	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.76	□□□□□ -0.21

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