RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563185.6

NAE1-209, Transcript of NEDD8 activating enzyme E1 subunit 1, human

TSL 5

Gene NAE1, Length 401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NAE1-209	ENST00000563185	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		33.12	■■■□□ 2.89
NAE1-209	ENST00000563185	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		33.11	■■■□□ 2.89
NAE1-209	ENST00000563185	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
NAE1-209	ENST00000563185	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		33.1	■■■□□ 2.89
NAE1-209	ENST00000563185	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		33.09	■■■□□ 2.89
NAE1-209	ENST00000563185	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		33.08	■■■□□ 2.89
NAE1-209	ENST00000563185	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		33.08	■■■□□ 2.89
NAE1-209	ENST00000563185	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		33.06	■■■□□ 2.88
NAE1-209	ENST00000563185	PTPRK	Q15262	1439 aa		33.04	■■■□□ 2.88
NAE1-209	ENST00000563185	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
NAE1-209	ENST00000563185	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		33.02	■■■□□ 2.88
NAE1-209	ENST00000563185	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
NAE1-209	ENST00000563185	NCOA1	Q15788	1441 aa		32.99	■■■□□ 2.87
NAE1-209	ENST00000563185	ADGRL2	O95490	1459 aa		32.94	■■■□□ 2.86
NAE1-209	ENST00000563185	PZP	P20742	1482 aa		32.93	■■■□□ 2.86
NAE1-209	ENST00000563185	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
NAE1-209	ENST00000563185	ABCC3	O15438	1527 aa		32.91	■■■□□ 2.86
NAE1-209	ENST00000563185	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86
NAE1-209	ENST00000563185	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.89	■■■□□ 2.86
NAE1-209	ENST00000563185	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.89	■■■□□ 2.86
NAE1-209	ENST00000563185	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.88	■■■□□ 2.85
NAE1-209	ENST00000563185	TNR	Q92752	1358 aa		32.88	■■■□□ 2.85
NAE1-209	ENST00000563185	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.87	■■■□□ 2.85
NAE1-209	ENST00000563185	KANK1	Q14678	1352 aa		32.86	■■■□□ 2.85
NAE1-209	ENST00000563185	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		32.84	■■■□□ 2.85
NAE1-209	ENST00000563185	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.84	■■■□□ 2.85
NAE1-209	ENST00000563185	ITGAE	P38570	1179 aa		32.82	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		32.82	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	32.81	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	ROCK1	Q13464	1354 aa		32.8	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		32.8	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	32.78	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.78	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.77	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.77	■■■□□ 2.84
NAE1-209	ENST00000563185	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	CEP152	O94986	1710 aa		32.74	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.74	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	NLRP1	Q9C000	1473 aa		32.74	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	PTPRT	O14522	1441 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	ERVK-7	P63135	1459 aa		32.72	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	PKD2	Q13563	968 aa		32.71	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.71	■■■□□ 2.83
NAE1-209	ENST00000563185	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		32.7	■■■□□ 2.82
NAE1-209	ENST00000563185	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		32.69	■■■□□ 2.82
NAE1-209	ENST00000563185	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.68	■■■□□ 2.82
NAE1-209	ENST00000563185	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
NAE1-209	ENST00000563185	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.67	■■■□□ 2.82
NAE1-209	ENST00000563185	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.62	■■■□□ 2.81
NAE1-209	ENST00000563185	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
NAE1-209	ENST00000563185	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		32.57	■■■□□ 2.8
NAE1-209	ENST00000563185	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
NAE1-209	ENST00000563185	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.56	■■■□□ 2.8
NAE1-209	ENST00000563185	CERK	Q8TCT0	537 aa		32.55	■■■□□ 2.8
NAE1-209	ENST00000563185	UNC13B	O14795	1591 aa		32.53	■■■□□ 2.8
NAE1-209	ENST00000563185	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.51	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	NUP155	O75694	1391 aa		32.5	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		32.48	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	NOS1	P29475	1434 aa		32.48	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		32.46	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	TET3	O43151	1660 aa		32.46	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	IDI1	Q13907	227 aa		32.45	■■■□□ 2.79
NAE1-209	ENST00000563185	NAIP	Q13075	1403 aa		32.43	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.41	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		32.41	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	SYNM	O15061	1565 aa		32.4	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.4	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	MED14	O60244	1454 aa		32.39	■■■□□ 2.78
NAE1-209	ENST00000563185	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		32.38	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	HFM1	A2PYH4	1435 aa		32.38	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	PIK3C2B	O00750	1634 aa		32.37	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	EID1	Q9Y6B2	187 aa		32.37	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		32.36	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		32.36	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	SLIT1	O75093	1534 aa		32.35	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		32.34	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		32.34	■■■□□ 2.77
NAE1-209	ENST00000563185	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
NAE1-209	ENST00000563185	LTK	P29376	864 aa		32.32	■■■□□ 2.76
NAE1-209	ENST00000563185		E9PCH4	1651 aa		32.31	■■■□□ 2.76
NAE1-209	ENST00000563185	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
NAE1-209	ENST00000563185	ADGRB3	O60242	1522 aa		32.28	■■■□□ 2.76
NAE1-209	ENST00000563185	TRIM52	Q96A61	297 aa		32.27	■■■□□ 2.76
NAE1-209	ENST00000563185	IQGAP1	P46940	1657 aa		32.26	■■■□□ 2.75
NAE1-209	ENST00000563185	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		32.23	■■■□□ 2.75
NAE1-209	ENST00000563185	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
NAE1-209	ENST00000563185	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	32.2	■■■□□ 2.75
NAE1-209	ENST00000563185	CPS1	P31327	1500 aa		32.16	■■■□□ 2.74
NAE1-209	ENST00000563185	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
NAE1-209	ENST00000563185	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		32.14	■■■□□ 2.74
NAE1-209	ENST00000563185	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		32.12	■■■□□ 2.73
NAE1-209	ENST00000563185	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.12	■■■□□ 2.73
NAE1-209	ENST00000563185	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	32.11	■■■□□ 2.73
NAE1-209	ENST00000563185	BCAN	Q96GW7	911 aa		32.11	■■■□□ 2.73
NAE1-209	ENST00000563185	ZFYVE9	O95405	1425 aa		32.1	■■■□□ 2.73
NAE1-209	ENST00000563185	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73

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