RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561277.5

TSPAN3-210, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN3, Length 1,592 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-210ENST00000561277 PPP6R1Q9UPN7 881 aa30.49■■■□□ 2.47
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TSPAN3-210ENST00000561277 LMTK3Q96Q04 1460 aa30.48■■■□□ 2.47
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TSPAN3-210ENST00000561277 HFM1A2PYH4 1435 aa30.05■■■□□ 2.4
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TSPAN3-210ENST00000561277 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.82■■■□□ 2.36
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TSPAN3-210ENST00000561277 CLTCL1P53675 1640 aa29.62■■■□□ 2.33
TSPAN3-210ENST00000561277 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.62■■■□□ 2.33
TSPAN3-210ENST00000561277 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.62■■■□□ 2.33
TSPAN3-210ENST00000561277 CERKQ8TCT0 537 aa29.61■■■□□ 2.33
TSPAN3-210ENST00000561277 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.59■■■□□ 2.33
TSPAN3-210ENST00000561277 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
TSPAN3-210ENST00000561277 ZFYVE9O95405 1425 aa29.58■■■□□ 2.33
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