RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560587.1

ZNF280D-215, Transcript of zinc finger protein 280D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZNF280D, Length 1,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF280D-215ENST00000560587 KDM5DQ9BY66 1539 aa38.36■■■■□ 3.73
ZNF280D-215ENST00000560587 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP38.35■■■■□ 3.73
ZNF280D-215ENST00000560587 HSPA2P54652 639 aa38.34■■■■□ 3.73
ZNF280D-215ENST00000560587 KIF15Q9NS87 1388 aa38.34■■■■□ 3.73
ZNF280D-215ENST00000560587 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP38.33■■■■□ 3.73
ZNF280D-215ENST00000560587 ERBINQ96RT1 1412 aa38.27■■■■□ 3.72
ZNF280D-215ENST00000560587 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa38.26■■■■□ 3.72
ZNF280D-215ENST00000560587 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.26■■■■□ 3.72
ZNF280D-215ENST00000560587 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa38.26■■■■□ 3.72
ZNF280D-215ENST00000560587 PTPRKQ15262 1439 aa38.25■■■■□ 3.71
ZNF280D-215ENST00000560587 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa38.24■■■■□ 3.71
ZNF280D-215ENST00000560587 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP38.24■■■■□ 3.71
ZNF280D-215ENST00000560587 CHIC2Q9UKJ5 165 aa38.23■■■■□ 3.71
ZNF280D-215ENST00000560587 MROH1Q8NDA8 1641 aa38.21■■■■□ 3.71
ZNF280D-215ENST00000560587 ADGRL2O95490 1459 aa38.21■■■■□ 3.71
ZNF280D-215ENST00000560587 MYO3AQ8NEV4 1616 aa38.19■■■■□ 3.7
ZNF280D-215ENST00000560587 NCOA1Q15788 1441 aa38.19■■■■□ 3.7
ZNF280D-215ENST00000560587 PZPP20742 1482 aa38.18■■■■□ 3.7
ZNF280D-215ENST00000560587 ABCC3O15438 1527 aa38.17■■■■□ 3.7
ZNF280D-215ENST00000560587 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
ZNF280D-215ENST00000560587 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP38.13■■■■□ 3.7
ZNF280D-215ENST00000560587 DEPDC5O75140 1603 aa38.11■■■■□ 3.69
ZNF280D-215ENST00000560587 CEP152O94986 1710 aa38.1■■■■□ 3.69
ZNF280D-215ENST00000560587 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP38.08■■■■□ 3.69
ZNF280D-215ENST00000560587 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP38.07■■■■□ 3.69
ZNF280D-215ENST00000560587 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa38.06■■■■□ 3.68
ZNF280D-215ENST00000560587 STRCQ7RTU9 1775 aa38.05■■■■□ 3.68
ZNF280D-215ENST00000560587 TNRQ92752 1358 aa38.04■■■■□ 3.68
ZNF280D-215ENST00000560587 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP38.03■■■■□ 3.68
ZNF280D-215ENST00000560587 KANK1Q14678 1352 aa38■■■■□ 3.67
ZNF280D-215ENST00000560587 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.99■■■■□ 3.67
ZNF280D-215ENST00000560587 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.98■■■■□ 3.67
ZNF280D-215ENST00000560587 ROCK1Q13464 1354 aa37.98■■■■□ 3.67
ZNF280D-215ENST00000560587 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.97■■■■□ 3.67
ZNF280D-215ENST00000560587 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.97■■■■□ 3.67
ZNF280D-215ENST00000560587 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.95■■■■□ 3.67
ZNF280D-215ENST00000560587 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.94■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.93■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 ERVK-7P63135 1459 aa37.93■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 ITGAEP38570 1179 aa37.93■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 NLRP1Q9C000 1473 aa37.91■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.91■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 PLA2R1Q13018 1463 aa37.91■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.9■■■■□ 3.66
ZNF280D-215ENST00000560587 PTPRTO14522 1441 aa37.85■■■■□ 3.65
ZNF280D-215ENST00000560587 UNC13BO14795 1591 aa37.82■■■■□ 3.65
ZNF280D-215ENST00000560587 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.65
ZNF280D-215ENST00000560587 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.81■■■■□ 3.64
ZNF280D-215ENST00000560587 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.81■■■■□ 3.64
ZNF280D-215ENST00000560587 PKD2Q13563 968 aa37.77■■■■□ 3.64
ZNF280D-215ENST00000560587 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.75■■■■□ 3.63
ZNF280D-215ENST00000560587 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
ZNF280D-215ENST00000560587 TET3O43151 1660 aa37.72■■■■□ 3.63
ZNF280D-215ENST00000560587 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.71■■■■□ 3.63
ZNF280D-215ENST00000560587 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.68■■■■□ 3.62
ZNF280D-215ENST00000560587 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
ZNF280D-215ENST00000560587 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.66■■■■□ 3.62
ZNF280D-215ENST00000560587 UBR1Q8IWV7 1749 aa37.66■■■■□ 3.62
ZNF280D-215ENST00000560587 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.63■■■■□ 3.61
ZNF280D-215ENST00000560587 SYNMO15061 1565 aa37.62■■■■□ 3.61
ZNF280D-215ENST00000560587 NOS1P29475 1434 aa37.62■■■■□ 3.61
ZNF280D-215ENST00000560587 PIK3C2BO00750 1634 aa37.61■■■■□ 3.61
ZNF280D-215ENST00000560587 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
ZNF280D-215ENST00000560587 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.6■■■■□ 3.61
ZNF280D-215ENST00000560587 NUP155O75694 1391 aa37.58■■■■□ 3.61
ZNF280D-215ENST00000560587 NAIPQ13075 1403 aa37.57■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 CERKQ8TCT0 537 aa37.56■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP37.55■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 E9PCH4 1651 aa37.55■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.52■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 HFM1A2PYH4 1435 aa37.52■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 FBXO41Q8TF61 875 aa37.52■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 MED14O60244 1454 aa37.51■■■■□ 3.6
ZNF280D-215ENST00000560587 SLIT1O75093 1534 aa37.5■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 IDI1Q13907 227 aa37.48■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 STAG3Q9UJ98 1225 aa37.48■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 ARHGAP23Q9P227 1491 aa37.48■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 IQGAP1P46940 1657 aa37.48■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 SLC52A1Q9NWF4 448 aa37.47■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 ADGRB3O60242 1522 aa37.47■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP37.45■■■■□ 3.59
ZNF280D-215ENST00000560587 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.44■■■■□ 3.58
ZNF280D-215ENST00000560587 TMEM2Q9UHN6 1383 aa37.41■■■■□ 3.58
ZNF280D-215ENST00000560587 EID1Q9Y6B2 187 aa37.36■■■■□ 3.57
ZNF280D-215ENST00000560587 TXNDC2Q86VQ3 553 aa37.36■■■■□ 3.57
ZNF280D-215ENST00000560587 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.35■■■■□ 3.57
ZNF280D-215ENST00000560587 LTKP29376 864 aa37.34■■■■□ 3.57
ZNF280D-215ENST00000560587 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa37.32■■■■□ 3.56
ZNF280D-215ENST00000560587 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa37.31■■■■□ 3.56
ZNF280D-215ENST00000560587 MYO5BQ9ULV0 1848 aa37.3■■■■□ 3.56
ZNF280D-215ENST00000560587 TRIM52Q96A61 297 aa37.27■■■■□ 3.56
ZNF280D-215ENST00000560587 CPS1P31327 1500 aa37.27■■■■□ 3.56
ZNF280D-215ENST00000560587 CHGAP10645 457 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
ZNF280D-215ENST00000560587 ZFYVE9O95405 1425 aa37.19■■■■□ 3.54
ZNF280D-215ENST00000560587 TRPM2O94759 1503 aa37.18■■■■□ 3.54
ZNF280D-215ENST00000560587 RIMS2Q9UQ26 1411 aa37.17■■■■□ 3.54
ZNF280D-215ENST00000560587 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
ZNF280D-215ENST00000560587 STRCP1A6NGW2 1772 aa37.14■■■■□ 3.54
ZNF280D-215ENST00000560587 HDGFP51858 240 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms