RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559020.1

CERS2-211, Transcript of ceramide synthase 2, humanhuman

TSL 4

Gene CERS2, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS2-211ENST00000559020 ZMYM3Q14202 1370 aa22.62■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.6■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 PLA2R1Q13018 1463 aa22.6■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.59■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.59■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 PTPRKQ15262 1439 aa22.58■■□□□ 1.21
CERS2-211ENST00000559020 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CERS2-211ENST00000559020 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.57■■□□□ 1.2
CERS2-211ENST00000559020 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CERS2-211ENST00000559020 SOCS7O14512 581 aa22.52■■□□□ 1.2
CERS2-211ENST00000559020 ABCC5O15440 1437 aa22.51■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.51■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.5■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.49■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 GGT6Q6P531 493 aa22.48■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 DAPK1P53355 1430 aa22.47■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.47■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 KIF3BO15066 747 aa22.46■■□□□ 1.19
CERS2-211ENST00000559020 PKD2Q13563 968 aa22.44■■□□□ 1.18
CERS2-211ENST00000559020 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.44■■□□□ 1.18
CERS2-211ENST00000559020 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.43■■□□□ 1.18
CERS2-211ENST00000559020 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.41■■□□□ 1.18
CERS2-211ENST00000559020 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.41■■□□□ 1.18
CERS2-211ENST00000559020 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.18
CERS2-211ENST00000559020 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
CERS2-211ENST00000559020 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.38■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 PZPP20742 1482 aa22.38■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 KIF15Q9NS87 1388 aa22.38■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 ADGRL2O95490 1459 aa22.36■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.36■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 ERBINQ96RT1 1412 aa22.36■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.35■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.35■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 DEPDC5O75140 1603 aa22.35■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.34■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.34■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 CPS1P31327 1500 aa22.34■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 ALKQ9UM73 1620 aa22.34■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.33■■□□□ 1.17
CERS2-211ENST00000559020 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 IQGAP1P46940 1657 aa22.31■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 TNRQ92752 1358 aa22.31■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 CEP152O94986 1710 aa22.28■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.27■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.27■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 MED14O60244 1454 aa22.27■■□□□ 1.16
CERS2-211ENST00000559020 ROCK1Q13464 1354 aa22.26■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 NLRP1Q9C000 1473 aa22.26■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.24■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 ABCC3O15438 1527 aa22.24■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.22■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 SYNMO15061 1565 aa22.21■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 KANK1Q14678 1352 aa22.21■■□□□ 1.15
CERS2-211ENST00000559020 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.2■■□□□ 1.14
CERS2-211ENST00000559020 HSPA1LP34931 641 aa22.19■■□□□ 1.14
CERS2-211ENST00000559020 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CERS2-211ENST00000559020 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.16■■□□□ 1.14
CERS2-211ENST00000559020 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.16■■□□□ 1.14
CERS2-211ENST00000559020 ERVK-7P63135 1459 aa22.15■■□□□ 1.14
CERS2-211ENST00000559020 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.14■■□□□ 1.13
CERS2-211ENST00000559020 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.12■■□□□ 1.13
CERS2-211ENST00000559020 ITGAEP38570 1179 aa22.12■■□□□ 1.13
CERS2-211ENST00000559020 PIP4K2BP78356 416 aa22.12■■□□□ 1.13
CERS2-211ENST00000559020 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CERS2-211ENST00000559020 TOM1O60784 492 aa22.11■■□□□ 1.13
CERS2-211ENST00000559020 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CERS2-211ENST00000559020 SLIT1O75093 1534 aa22.06■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 UNC13BO14795 1591 aa22.05■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.05■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 PIK3C2BO00750 1634 aa22.05■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.02■■□□□ 1.12
CERS2-211ENST00000559020 NOS1P29475 1434 aa22.01■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 TET3O43151 1660 aa22■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 NAIPQ13075 1403 aa21.99■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.98■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 NUP155O75694 1391 aa21.98■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.97■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 HFM1A2PYH4 1435 aa21.97■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.96■■□□□ 1.11
CERS2-211ENST00000559020 IDI1Q13907 227 aa21.94■■□□□ 1.1
CERS2-211ENST00000559020 LTKP29376 864 aa21.93■■□□□ 1.1
CERS2-211ENST00000559020 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.93■■□□□ 1.1
CERS2-211ENST00000559020 E9PCH4 1651 aa21.88■■□□□ 1.09
CERS2-211ENST00000559020 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa21.88■■□□□ 1.09
CERS2-211ENST00000559020 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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