RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555949.2

SLC25A29-213, Transcript of solute carrier family 25 member 29, human

TSL 4

Gene SLC25A29, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC25A29-213	ENST00000555949	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	43.73	■■■■■ 4.59
SLC25A29-213	ENST00000555949	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		43.72	■■■■■ 4.59
SLC25A29-213	ENST00000555949	DAPK1	P53355	1430 aa		43.7	■■■■■ 4.59
SLC25A29-213	ENST00000555949	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	43.69	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	43.66	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		43.66	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		43.66	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		43.65	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		43.65	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	43.64	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		43.63	■■■■■ 4.58
SLC25A29-213	ENST00000555949	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		43.63	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	KIF15	Q9NS87	1388 aa		43.63	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	43.62	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	CEP152	O94986	1710 aa		43.6	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	43.59	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		43.59	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	PZP	P20742	1482 aa		43.58	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	43.58	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		43.58	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	NCOA1	Q15788	1441 aa		43.57	■■■■■ 4.57
SLC25A29-213	ENST00000555949	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
SLC25A29-213	ENST00000555949	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	43.55	■■■■■ 4.56
SLC25A29-213	ENST00000555949	ABCC3	O15438	1527 aa		43.54	■■■■■ 4.56
SLC25A29-213	ENST00000555949	TNR	Q92752	1358 aa		43.53	■■■■■ 4.56
SLC25A29-213	ENST00000555949	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		43.49	■■■■■ 4.55
SLC25A29-213	ENST00000555949	FBXO41	Q8TF61	875 aa		43.49	■■■■■ 4.55
SLC25A29-213	ENST00000555949	PTPRT	O14522	1441 aa		43.48	■■■■■ 4.55
SLC25A29-213	ENST00000555949	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		43.47	■■■■■ 4.55
SLC25A29-213	ENST00000555949	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		43.47	■■■■■ 4.55
SLC25A29-213	ENST00000555949	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		43.47	■■■■■ 4.55
SLC25A29-213	ENST00000555949	CERK	Q8TCT0	537 aa		43.43	■■■■■ 4.54
SLC25A29-213	ENST00000555949	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	43.43	■■■■■ 4.54
SLC25A29-213	ENST00000555949	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.54
SLC25A29-213	ENST00000555949	PLA2R1	Q13018	1463 aa		43.38	■■■■■ 4.53
SLC25A29-213	ENST00000555949	DEPDC5	O75140	1603 aa		43.37	■■■■■ 4.53
SLC25A29-213	ENST00000555949	ADGRL2	O95490	1459 aa		43.32	■■■■■ 4.53
SLC25A29-213	ENST00000555949	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		43.31	■■■■■ 4.52
SLC25A29-213	ENST00000555949	ERVK-7	P63135	1459 aa		43.31	■■■■■ 4.52
SLC25A29-213	ENST00000555949	PKD2	Q13563	968 aa		43.3	■■■■■ 4.52
SLC25A29-213	ENST00000555949	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	43.3	■■■■■ 4.52
SLC25A29-213	ENST00000555949	NLRP1	Q9C000	1473 aa		43.28	■■■■■ 4.52
SLC25A29-213	ENST00000555949	KANK1	Q14678	1352 aa		43.26	■■■■■ 4.52
SLC25A29-213	ENST00000555949	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SLC25A29-213	ENST00000555949	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	43.22	■■■■■ 4.51
SLC25A29-213	ENST00000555949	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SLC25A29-213	ENST00000555949	ITGAE	P38570	1179 aa		43.19	■■■■■ 4.5
SLC25A29-213	ENST00000555949	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	43.18	■■■■■ 4.5
SLC25A29-213	ENST00000555949	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SLC25A29-213	ENST00000555949	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SLC25A29-213	ENST00000555949	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	43.15	■■■■■ 4.5
SLC25A29-213	ENST00000555949	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SLC25A29-213	ENST00000555949	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SLC25A29-213	ENST00000555949	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SLC25A29-213	ENST00000555949	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		43.1	■■■■■ 4.49
SLC25A29-213	ENST00000555949	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SLC25A29-213	ENST00000555949	PIK3C2B	O00750	1634 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SLC25A29-213	ENST00000555949	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		43.02	■■■■■ 4.48
SLC25A29-213	ENST00000555949	ROCK1	Q13464	1354 aa		42.99	■■■■■ 4.47
SLC25A29-213	ENST00000555949	IQGAP1	P46940	1657 aa		42.96	■■■■■ 4.47
SLC25A29-213	ENST00000555949	UNC13B	O14795	1591 aa		42.96	■■■■■ 4.47
SLC25A29-213	ENST00000555949	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
SLC25A29-213	ENST00000555949	SYNM	O15061	1565 aa		42.95	■■■■■ 4.47
SLC25A29-213	ENST00000555949	TET3	O43151	1660 aa		42.93	■■■■■ 4.46
SLC25A29-213	ENST00000555949	MED14	O60244	1454 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SLC25A29-213	ENST00000555949	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		42.91	■■■■■ 4.46
SLC25A29-213	ENST00000555949	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SLC25A29-213	ENST00000555949	IDI1	Q13907	227 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SLC25A29-213	ENST00000555949	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SLC25A29-213	ENST00000555949	NOS1	P29475	1434 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SLC25A29-213	ENST00000555949	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
SLC25A29-213	ENST00000555949	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.45
SLC25A29-213	ENST00000555949	LTK	P29376	864 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SLC25A29-213	ENST00000555949	SLIT1	O75093	1534 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949		E9PCH4	1651 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		42.81	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		42.8	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	42.79	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		42.78	■■■■■ 4.44
SLC25A29-213	ENST00000555949	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.75	■■■■■ 4.43
SLC25A29-213	ENST00000555949	EID1	Q9Y6B2	187 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SLC25A29-213	ENST00000555949	NUP155	O75694	1391 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SLC25A29-213	ENST00000555949	CPS1	P31327	1500 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SLC25A29-213	ENST00000555949	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		42.73	■■■■■ 4.43
SLC25A29-213	ENST00000555949	ADGRB3	O60242	1522 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SLC25A29-213	ENST00000555949	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		42.71	■■■■■ 4.43
SLC25A29-213	ENST00000555949	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		42.69	■■■■■ 4.42
SLC25A29-213	ENST00000555949	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
SLC25A29-213	ENST00000555949	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
SLC25A29-213	ENST00000555949	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		42.58	■■■■■ 4.41
SLC25A29-213	ENST00000555949	NAIP	Q13075	1403 aa		42.57	■■■■■ 4.41
SLC25A29-213	ENST00000555949	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	42.5	■■■■■ 4.39
SLC25A29-213	ENST00000555949	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SLC25A29-213	ENST00000555949	BCAN	Q96GW7	911 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SLC25A29-213	ENST00000555949	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		42.5	■■■■■ 4.39
SLC25A29-213	ENST00000555949	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SLC25A29-213	ENST00000555949	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		42.46	■■■■■ 4.39

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms