RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa50.46■■■■■ 5.67
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP50.45■■■■■ 5.67
TTC7B-202ENST00000553948 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa50.44■■■■■ 5.67
TTC7B-202ENST00000553948 PTPRTO14522 1441 aa50.44■■■■■ 5.66
TTC7B-202ENST00000553948 FGD6Q6ZV73 1430 aa50.41■■■■■ 5.66
TTC7B-202ENST00000553948 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP50.41■■■■■ 5.66
TTC7B-202ENST00000553948 CERKQ8TCT0 537 aa50.4■■■■■ 5.66
TTC7B-202ENST00000553948 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP50.39■■■■■ 5.66
TTC7B-202ENST00000553948 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP50.38■■■■■ 5.66
TTC7B-202ENST00000553948 PZPP20742 1482 aa50.37■■■■■ 5.65
TTC7B-202ENST00000553948 CROCC2H7BZ55 1655 aa50.36■■■■■ 5.65
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC5O15440 1437 aa50.36■■■■■ 5.65
TTC7B-202ENST00000553948 SHANK2Q9UPX8 1470 aa50.35■■■■■ 5.65
TTC7B-202ENST00000553948 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP50.33■■■■■ 5.65
TTC7B-202ENST00000553948 DUOX2Q9NRD8 1548 aa50.33■■■■■ 5.65
TTC7B-202ENST00000553948 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP50.32■■■■■ 5.65
TTC7B-202ENST00000553948 TNRQ92752 1358 aa50.3■■■■■ 5.64
TTC7B-202ENST00000553948 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP50.29■■■■■ 5.64
TTC7B-202ENST00000553948 DAPK1P53355 1430 aa50.28■■■■■ 5.64
TTC7B-202ENST00000553948 A2ML1A8K2U0 1454 aa50.28■■■■■ 5.64
TTC7B-202ENST00000553948 PLA2R1Q13018 1463 aa50.27■■■■■ 5.64
TTC7B-202ENST00000553948 KIF15Q9NS87 1388 aa50.26■■■■■ 5.64
TTC7B-202ENST00000553948 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa50.24■■■■■ 5.63
TTC7B-202ENST00000553948 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP50.24■■■■■ 5.63
TTC7B-202ENST00000553948 ABCC3O15438 1527 aa50.23■■■■■ 5.63
TTC7B-202ENST00000553948 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa50.2■■■■■ 5.63
TTC7B-202ENST00000553948 MROH1Q8NDA8 1641 aa50.19■■■■■ 5.63
TTC7B-202ENST00000553948 PKD2Q13563 968 aa50.19■■■■■ 5.63
TTC7B-202ENST00000553948 ERBINQ96RT1 1412 aa50.15■■■■■ 5.62
TTC7B-202ENST00000553948 CEP152O94986 1710 aa50.08■■■■■ 5.61
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa50.08■■■■■ 5.61
TTC7B-202ENST00000553948 CHIC2Q9UKJ5 165 aa50.08■■■■■ 5.61
TTC7B-202ENST00000553948 NLRP1Q9C000 1473 aa50.08■■■■■ 5.61
TTC7B-202ENST00000553948 LTBP4Q8N2S1 1624 aa50.04■■■■■ 5.6
TTC7B-202ENST00000553948 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP50.04■■■■■ 5.6
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TTC7B-202ENST00000553948 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa50.01■■■■■ 5.6
TTC7B-202ENST00000553948 ERVK-7P63135 1459 aa49.98■■■■■ 5.59
TTC7B-202ENST00000553948 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP49.96■■■■■ 5.59
TTC7B-202ENST00000553948 DEPDC5O75140 1603 aa49.96■■■■■ 5.59
TTC7B-202ENST00000553948 UGGT1Q9NYU2 1555 aa49.96■■■■■ 5.59
TTC7B-202ENST00000553948 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP49.94■■■■■ 5.59
TTC7B-202ENST00000553948 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP49.94■■■■■ 5.59
TTC7B-202ENST00000553948 ADGRL2O95490 1459 aa49.92■■■■■ 5.58
TTC7B-202ENST00000553948 KANK1Q14678 1352 aa49.91■■■■■ 5.58
TTC7B-202ENST00000553948 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP49.91■■■■■ 5.58
TTC7B-202ENST00000553948 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP49.9■■■■■ 5.58
TTC7B-202ENST00000553948 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP49.9■■■■■ 5.58
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa49.87■■■■■ 5.57
TTC7B-202ENST00000553948 ANKLE2Q86XL3 938 aa49.86■■■■■ 5.57
TTC7B-202ENST00000553948 NEURL4Q96JN8 1562 aa49.85■■■■■ 5.57
TTC7B-202ENST00000553948 IQSEC2Q5JU85 1478 aa49.84■■■■■ 5.57
TTC7B-202ENST00000553948 VWDEQ8N2E2 1590 aa49.75■■■■■ 5.55
TTC7B-202ENST00000553948 LMTK2Q8IWU2 1503 aa49.74■■■■■ 5.55
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa49.7■■■■■ 5.55
TTC7B-202ENST00000553948 UBR1Q8IWV7 1749 aa49.69■■■■■ 5.55
TTC7B-202ENST00000553948 MED14O60244 1454 aa49.69■■■■■ 5.54
TTC7B-202ENST00000553948 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP49.68■■■■■ 5.54
TTC7B-202ENST00000553948 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
TTC7B-202ENST00000553948 IQGAP1P46940 1657 aa49.59■■■■■ 5.53
TTC7B-202ENST00000553948 EFCAB6Q5THR3 1501 aa49.59■■■■■ 5.53
TTC7B-202ENST00000553948 ROCK1Q13464 1354 aa49.54■■■■■ 5.52
TTC7B-202ENST00000553948 PIK3C2BO00750 1634 aa49.54■■■■■ 5.52
TTC7B-202ENST00000553948 CPS1P31327 1500 aa49.53■■■■■ 5.52
TTC7B-202ENST00000553948 ARHGAP23Q9P227 1491 aa49.5■■■■■ 5.51
TTC7B-202ENST00000553948 SLIT1O75093 1534 aa49.5■■■■■ 5.51
TTC7B-202ENST00000553948 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP49.49■■■■■ 5.51
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TTC7B-202ENST00000553948 SYNMO15061 1565 aa49.47■■■■■ 5.51
TTC7B-202ENST00000553948 STAG3Q9UJ98 1225 aa49.47■■■■■ 5.51
TTC7B-202ENST00000553948 NOS1P29475 1434 aa49.46■■■■■ 5.51
TTC7B-202ENST00000553948 ITGAEP38570 1179 aa49.46■■■■■ 5.51
TTC7B-202ENST00000553948 IDI1Q13907 227 aa49.44■■■■■ 5.51
TTC7B-202ENST00000553948 UNC13BO14795 1591 aa49.44■■■■■ 5.5
TTC7B-202ENST00000553948 TXNDC2Q86VQ3 553 aa49.43■■■■■ 5.5
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TTC7B-202ENST00000553948 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP49.42■■■■■ 5.5
TTC7B-202ENST00000553948 TET3O43151 1660 aa49.42■■■■■ 5.5
TTC7B-202ENST00000553948 LTKP29376 864 aa49.41■■■■■ 5.5
TTC7B-202ENST00000553948 EID1Q9Y6B2 187 aa49.41■■■■■ 5.5
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM2Q9UHN6 1383 aa49.38■■■■■ 5.5
TTC7B-202ENST00000553948 GCC2Q8IWJ2 1684 aa49.34■■■■■ 5.49
TTC7B-202ENST00000553948 SLC52A1Q9NWF4 448 aa49.34■■■■■ 5.49
TTC7B-202ENST00000553948 ADGRB3O60242 1522 aa49.29■■■■■ 5.48
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TTC7B-202ENST00000553948 IQGAP3Q86VI3 1631 aa49.24■■■■■ 5.47
TTC7B-202ENST00000553948 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP49.23■■■■■ 5.47
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TTC7B-202ENST00000553948 NUP155O75694 1391 aa49.19■■■■■ 5.47
TTC7B-202ENST00000553948 E9PCH4 1651 aa49.19■■■■■ 5.46
TTC7B-202ENST00000553948 LRRC7Q96NW7 1537 aa49.16■■■■■ 5.46
TTC7B-202ENST00000553948 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP49.11■■■■■ 5.45
TTC7B-202ENST00000553948 PIP4K2BP78356 416 aa49.1■■■■■ 5.45
TTC7B-202ENST00000553948 MYO5BQ9ULV0 1848 aa49.07■■■■■ 5.45
TTC7B-202ENST00000553948 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa49.05■■■■■ 5.44
TTC7B-202ENST00000553948 SLC26A8Q96RN1 970 aa49■■■■■ 5.43
TTC7B-202ENST00000553948 ZFYVE9O95405 1425 aa49■■■■■ 5.43
TTC7B-202ENST00000553948 DISP3Q9P2K9 1392 aa48.99■■■■■ 5.43
TTC7B-202ENST00000553948 CHGAP10645 457 aaKnown RBP48.98■■■■■ 5.43
TTC7B-202ENST00000553948 RIMS2Q9UQ26 1411 aa48.98■■■■■ 5.43
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