RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552180.5

GPN3-210, Transcript of GPN-loop GTPase 3, humanhuman

TSL 3

Gene GPN3, Length 640 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3-210ENST00000552180 NCOA1Q15788 1441 aa29.87■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.86■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 ADGRL2O95490 1459 aa29.84■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.83■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.83■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 PTPRKQ15262 1439 aa29.83■■■□□ 2.37
GPN3-210ENST00000552180 NPATQ14207 1427 aa29.82■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.82■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 HSPA2P54652 639 aa29.82■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 ERBINQ96RT1 1412 aa29.81■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.81■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.81■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.8■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.78■■■□□ 2.36
GPN3-210ENST00000552180 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
GPN3-210ENST00000552180 ABCC3O15438 1527 aa29.73■■■□□ 2.35
GPN3-210ENST00000552180 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
GPN3-210ENST00000552180 PZPP20742 1482 aa29.71■■■□□ 2.35
GPN3-210ENST00000552180 ROCK1Q13464 1354 aa29.69■■■□□ 2.34
GPN3-210ENST00000552180 DEPDC5O75140 1603 aa29.69■■■□□ 2.34
GPN3-210ENST00000552180 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
GPN3-210ENST00000552180 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
GPN3-210ENST00000552180 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.66■■■□□ 2.34
GPN3-210ENST00000552180 ITGAEP38570 1179 aa29.65■■■□□ 2.34
GPN3-210ENST00000552180 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.64■■■□□ 2.34
GPN3-210ENST00000552180 CEP152O94986 1710 aa29.63■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.61■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.61■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 TNRQ92752 1358 aa29.61■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.59■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 KANK1Q14678 1352 aa29.58■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.58■■■□□ 2.33
GPN3-210ENST00000552180 STRCQ7RTU9 1775 aa29.57■■■□□ 2.32
GPN3-210ENST00000552180 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
GPN3-210ENST00000552180 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.56■■■□□ 2.32
GPN3-210ENST00000552180 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.55■■■□□ 2.32
GPN3-210ENST00000552180 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.54■■■□□ 2.32
GPN3-210ENST00000552180 ERVK-7P63135 1459 aa29.53■■■□□ 2.32
GPN3-210ENST00000552180 NLRP1Q9C000 1473 aa29.48■■■□□ 2.31
GPN3-210ENST00000552180 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
GPN3-210ENST00000552180 UNC13BO14795 1591 aa29.47■■■□□ 2.31
GPN3-210ENST00000552180 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.46■■■□□ 2.31
GPN3-210ENST00000552180 PLA2R1Q13018 1463 aa29.44■■■□□ 2.3
GPN3-210ENST00000552180 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.43■■■□□ 2.3
GPN3-210ENST00000552180 PTPRTO14522 1441 aa29.42■■■□□ 2.3
GPN3-210ENST00000552180 NAIPQ13075 1403 aa29.41■■■□□ 2.3
GPN3-210ENST00000552180 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.41■■■□□ 2.3
GPN3-210ENST00000552180 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.39■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 PKD2Q13563 968 aa29.38■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 NOS1P29475 1434 aa29.37■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 TET3O43151 1660 aa29.37■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 NUP155O75694 1391 aa29.36■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.35■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 HFM1A2PYH4 1435 aa29.35■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
GPN3-210ENST00000552180 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.32■■■□□ 2.28
GPN3-210ENST00000552180 SYNMO15061 1565 aa29.32■■■□□ 2.28
GPN3-210ENST00000552180 IDI1Q13907 227 aa29.3■■■□□ 2.28
GPN3-210ENST00000552180 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.3■■■□□ 2.28
GPN3-210ENST00000552180 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.27■■■□□ 2.28
GPN3-210ENST00000552180 E9PCH4 1651 aa29.26■■■□□ 2.27
GPN3-210ENST00000552180 PIK3C2BO00750 1634 aa29.26■■■□□ 2.27
GPN3-210ENST00000552180 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.26■■■□□ 2.27
GPN3-210ENST00000552180 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.25■■■□□ 2.27
GPN3-210ENST00000552180 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.23■■■□□ 2.27
GPN3-210ENST00000552180 MED14O60244 1454 aa29.21■■■□□ 2.27
GPN3-210ENST00000552180 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.21■■■□□ 2.27
GPN3-210ENST00000552180 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 SLIT1O75093 1534 aa29.2■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 CERKQ8TCT0 537 aa29.18■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.16■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 LTKP29376 864 aa29.16■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.15■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.15■■■□□ 2.26
GPN3-210ENST00000552180 ADGRB3O60242 1522 aa29.14■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.12■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 TRIM52Q96A61 297 aa29.12■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.08■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 IQGAP1P46940 1657 aa29.08■■■□□ 2.25
GPN3-210ENST00000552180 FBXO41Q8TF61 875 aa29.07■■■□□ 2.24
GPN3-210ENST00000552180 EID1Q9Y6B2 187 aa29.07■■■□□ 2.24
GPN3-210ENST00000552180 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.05■■■□□ 2.24
GPN3-210ENST00000552180 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.04■■■□□ 2.24
GPN3-210ENST00000552180 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
GPN3-210ENST00000552180 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.04■■■□□ 2.24
GPN3-210ENST00000552180 ZFYVE9O95405 1425 aa29.02■■■□□ 2.24
GPN3-210ENST00000552180 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
GPN3-210ENST00000552180 TRPM2O94759 1503 aa28.98■■■□□ 2.23
GPN3-210ENST00000552180 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.96■■■□□ 2.23
GPN3-210ENST00000552180 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
GPN3-210ENST00000552180 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.95■■■□□ 2.22
GPN3-210ENST00000552180 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.95■■■□□ 2.22
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