RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549462.1

ITGB7-208, Transcript of integrin subunit beta 7, humanhuman

TSL 2

Gene ITGB7, Length 1,526 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7-208ENST00000549462 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.32■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.32■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 PREX1Q8TCU6 1659 aa30.31■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.29■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 PTPRKQ15262 1439 aa30.28■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 NPATQ14207 1427 aa30.27■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP30.27■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 KDM5DQ9BY66 1539 aa30.27■■■□□ 2.44
ITGB7-208ENST00000549462 NCOA1Q15788 1441 aa30.26■■■□□ 2.43
ITGB7-208ENST00000549462 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
ITGB7-208ENST00000549462 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
ITGB7-208ENST00000549462 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
ITGB7-208ENST00000549462 ERBINQ96RT1 1412 aa30.22■■■□□ 2.43
ITGB7-208ENST00000549462 ITGAEP38570 1179 aa30.2■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.2■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 ADGRL2O95490 1459 aa30.19■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.19■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.19■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 ABCC3O15438 1527 aa30.18■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 PZPP20742 1482 aa30.16■■■□□ 2.42
ITGB7-208ENST00000549462 TNRQ92752 1358 aa30.12■■■□□ 2.41
ITGB7-208ENST00000549462 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.09■■■□□ 2.41
ITGB7-208ENST00000549462 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
ITGB7-208ENST00000549462 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.08■■■□□ 2.41
ITGB7-208ENST00000549462 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 CEP152O94986 1710 aa30.06■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 ROCK1Q13464 1354 aa30.04■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 KANK1Q14678 1352 aa30.04■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 STRCQ7RTU9 1775 aa30.04■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 DEPDC5O75140 1603 aa30.04■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.02■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 A2ML1A8K2U0 1454 aa30.01■■■□□ 2.4
ITGB7-208ENST00000549462 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
ITGB7-208ENST00000549462 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.99■■■□□ 2.39
ITGB7-208ENST00000549462 ERVK-7P63135 1459 aa29.99■■■□□ 2.39
ITGB7-208ENST00000549462 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.98■■■□□ 2.39
ITGB7-208ENST00000549462 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.96■■■□□ 2.39
ITGB7-208ENST00000549462 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.96■■■□□ 2.39
ITGB7-208ENST00000549462 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.96■■■□□ 2.39
ITGB7-208ENST00000549462 NLRP1Q9C000 1473 aa29.93■■■□□ 2.38
ITGB7-208ENST00000549462 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.92■■■□□ 2.38
ITGB7-208ENST00000549462 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
ITGB7-208ENST00000549462 PTPRTO14522 1441 aa29.91■■■□□ 2.38
ITGB7-208ENST00000549462 PLA2R1Q13018 1463 aa29.91■■■□□ 2.38
ITGB7-208ENST00000549462 PKD2Q13563 968 aa29.88■■■□□ 2.37
ITGB7-208ENST00000549462 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
ITGB7-208ENST00000549462 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.87■■■□□ 2.37
ITGB7-208ENST00000549462 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ITGB7-208ENST00000549462 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.84■■■□□ 2.37
ITGB7-208ENST00000549462 UNC13BO14795 1591 aa29.83■■■□□ 2.37
ITGB7-208ENST00000549462 NUP155O75694 1391 aa29.81■■■□□ 2.36
ITGB7-208ENST00000549462 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.79■■■□□ 2.36
ITGB7-208ENST00000549462 NAIPQ13075 1403 aa29.78■■■□□ 2.36
ITGB7-208ENST00000549462 NOS1P29475 1434 aa29.77■■■□□ 2.36
ITGB7-208ENST00000549462 IDI1Q13907 227 aa29.77■■■□□ 2.36
ITGB7-208ENST00000549462 CERKQ8TCT0 537 aa29.77■■■□□ 2.36
ITGB7-208ENST00000549462 SYNMO15061 1565 aa29.75■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 TET3O43151 1660 aa29.74■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.72■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.72■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 HFM1A2PYH4 1435 aa29.71■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.71■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.7■■■□□ 2.35
ITGB7-208ENST00000549462 PIK3C2BO00750 1634 aa29.7■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 FBXO41Q8TF61 875 aa29.69■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.67■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 LTKP29376 864 aa29.66■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.66■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.66■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 E9PCH4 1651 aa29.64■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.64■■■□□ 2.34
ITGB7-208ENST00000549462 MED14O60244 1454 aa29.63■■■□□ 2.33
ITGB7-208ENST00000549462 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.62■■■□□ 2.33
ITGB7-208ENST00000549462 TRIM52Q96A61 297 aa29.62■■■□□ 2.33
ITGB7-208ENST00000549462 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.62■■■□□ 2.33
ITGB7-208ENST00000549462 SLIT1O75093 1534 aa29.61■■■□□ 2.33
ITGB7-208ENST00000549462 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
ITGB7-208ENST00000549462 EID1Q9Y6B2 187 aa29.59■■■□□ 2.33
ITGB7-208ENST00000549462 ADGRB3O60242 1522 aa29.57■■■□□ 2.32
ITGB7-208ENST00000549462 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
ITGB7-208ENST00000549462 IQGAP1P46940 1657 aa29.54■■■□□ 2.32
ITGB7-208ENST00000549462 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
ITGB7-208ENST00000549462 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
ITGB7-208ENST00000549462 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.5■■■□□ 2.31
ITGB7-208ENST00000549462 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
ITGB7-208ENST00000549462 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.47■■■□□ 2.31
ITGB7-208ENST00000549462 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.44■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 ZFYVE9O95405 1425 aa29.44■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 SLC26A8Q96RN1 970 aa29.43■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.43■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.41■■■□□ 2.3
ITGB7-208ENST00000549462 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.41■■■□□ 2.3
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