RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547169.5

CTDSP2-202, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTDSP2, Length 1,340 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-202ENST00000547169 PTPRMP28827 1452 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDSP2-202ENST00000547169 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDSP2-202ENST00000547169 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CTDSP2-202ENST00000547169 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.6■■□□□ 1.37
CTDSP2-202ENST00000547169 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 ZMYM3Q14202 1370 aa23.57■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 NAIPQ13075 1403 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.53■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.52■■□□□ 1.36
CTDSP2-202ENST00000547169 MROH2AA6NES4 1674 aa23.51■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 HFM1A2PYH4 1435 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 DEPDC5O75140 1603 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.5■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 KANK1Q14678 1352 aa23.49■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 C3P01024 1663 aa23.48■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCC3O15438 1527 aa23.46■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
CTDSP2-202ENST00000547169 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 CEP152O94986 1710 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 UNC13BO14795 1591 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 NUP155O75694 1391 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 NPATQ14207 1427 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDSP2-202ENST00000547169 PZPP20742 1482 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-202ENST00000547169 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-202ENST00000547169 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-202ENST00000547169 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDSP2-202ENST00000547169 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CTDSP2-202ENST00000547169 TRIM52Q96A61 297 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDSP2-202ENST00000547169 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDSP2-202ENST00000547169 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 HRCP23327 699 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 TNRQ92752 1358 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 TET3O43151 1660 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 ERVK-7P63135 1459 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-202ENST00000547169 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 LMTK3Q96Q04 1460 aa23.27■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 NOS1P29475 1434 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 E9PCH4 1651 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 HSPA2P54652 639 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 PKD2Q13563 968 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 FBXO41Q8TF61 875 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 NLRP1Q9C000 1473 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDSP2-202ENST00000547169 IDI1Q13907 227 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.19■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 SYNMO15061 1565 aa23.14■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 PTPRTO14522 1441 aa23.14■■□□□ 1.3
CTDSP2-202ENST00000547169 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDSP2-202ENST00000547169 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDSP2-202ENST00000547169 FOXD1Q16676 465 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDSP2-202ENST00000547169 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDSP2-202ENST00000547169 PLA2R1Q13018 1463 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDSP2-202ENST00000547169 PIK3C2BO00750 1634 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.04■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.03■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 TRPM2O94759 1503 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 STRCQ7RTU9 1775 aa23.02■■□□□ 1.28
CTDSP2-202ENST00000547169 PCGF6Q9BYE7 350 aa23■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 ADGRB3O60242 1522 aa22.99■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.98■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 CLTCL1P53675 1640 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 LTKP29376 864 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 SLIT1O75093 1534 aa22.97■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 EID1Q9Y6B2 187 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.96■■□□□ 1.27
CTDSP2-202ENST00000547169 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.93■■□□□ 1.26
CTDSP2-202ENST00000547169 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-202ENST00000547169 KIF1BO60333 1816 aa22.91■■□□□ 1.26
CTDSP2-202ENST00000547169 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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