RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 DAPK1P53355 1430 aa26.3■■□□□ 1.8
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HOXD8-204ENST00000544999 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXD8-204ENST00000544999 PTPRKQ15262 1439 aa26.27■■□□□ 1.8
HOXD8-204ENST00000544999 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
HOXD8-204ENST00000544999 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.26■■□□□ 1.79
HOXD8-204ENST00000544999 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD8-204ENST00000544999 KIF15Q9NS87 1388 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD8-204ENST00000544999 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD8-204ENST00000544999 STRCQ7RTU9 1775 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD8-204ENST00000544999 PZPP20742 1482 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXD8-204ENST00000544999 ERBINQ96RT1 1412 aa26.18■■□□□ 1.78
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HOXD8-204ENST00000544999 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.17■■□□□ 1.78
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HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.16■■□□□ 1.78
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HOXD8-204ENST00000544999 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
HOXD8-204ENST00000544999 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD8-204ENST00000544999 NCOA1Q15788 1441 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD8-204ENST00000544999 ADGRL2O95490 1459 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD8-204ENST00000544999 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD8-204ENST00000544999 TNRQ92752 1358 aa26.11■■□□□ 1.77
HOXD8-204ENST00000544999 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
HOXD8-204ENST00000544999 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.09■■□□□ 1.77
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HOXD8-204ENST00000544999 DEPDC5O75140 1603 aa26.07■■□□□ 1.76
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HOXD8-204ENST00000544999 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
HOXD8-204ENST00000544999 NLRP1Q9C000 1473 aa26.02■■□□□ 1.76
HOXD8-204ENST00000544999 ERVK-7P63135 1459 aa26■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 KANK1Q14678 1352 aa26■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 PKD2Q13563 968 aa25.99■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.97■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 FBXO41Q8TF61 875 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.96■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 ROCK1Q13464 1354 aa25.95■■□□□ 1.75
HOXD8-204ENST00000544999 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
HOXD8-204ENST00000544999 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.94■■□□□ 1.74
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HOXD8-204ENST00000544999 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.86■■□□□ 1.73
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HOXD8-204ENST00000544999 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.84■■□□□ 1.73
HOXD8-204ENST00000544999 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.83■■□□□ 1.72
HOXD8-204ENST00000544999 TET3O43151 1660 aa25.8■■□□□ 1.72
HOXD8-204ENST00000544999 NOS1P29475 1434 aa25.79■■□□□ 1.72
HOXD8-204ENST00000544999 MED14O60244 1454 aa25.79■■□□□ 1.72
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HOXD8-204ENST00000544999 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
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HOXD8-204ENST00000544999 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXD8-204ENST00000544999 SYNMO15061 1565 aa25.76■■□□□ 1.71
HOXD8-204ENST00000544999 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.75■■□□□ 1.71
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HOXD8-204ENST00000544999 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
HOXD8-204ENST00000544999 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.74■■□□□ 1.71
HOXD8-204ENST00000544999 SLIT1O75093 1534 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXD8-204ENST00000544999 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.73■■□□□ 1.71
HOXD8-204ENST00000544999 IQGAP1P46940 1657 aa25.72■■□□□ 1.71
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HOXD8-204ENST00000544999 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
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HOXD8-204ENST00000544999 NUP155O75694 1391 aa25.69■■□□□ 1.7
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HOXD8-204ENST00000544999 ADGRB3O60242 1522 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.66■■□□□ 1.7
HOXD8-204ENST00000544999 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD8-204ENST00000544999 NAIPQ13075 1403 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD8-204ENST00000544999 CPS1P31327 1500 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD8-204ENST00000544999 LTKP29376 864 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD8-204ENST00000544999 EID1Q9Y6B2 187 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD8-204ENST00000544999 HFM1A2PYH4 1435 aa25.59■■□□□ 1.69
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-204ENST00000544999 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.55■■□□□ 1.68
HOXD8-204ENST00000544999 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.52■■□□□ 1.68
HOXD8-204ENST00000544999 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD8-204ENST00000544999 ZFYVE9O95405 1425 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD8-204ENST00000544999 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD8-204ENST00000544999 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD8-204ENST00000544999 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
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