RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542338.1

NPIPB4-216, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 387 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-216	ENST00000542338	ABCA6	Q8N139	1617 aa		13.93	□□□□□ -0.18
NPIPB4-216	ENST00000542338	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NPIPB4-216	ENST00000542338	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NPIPB4-216	ENST00000542338	KIF15	Q9NS87	1388 aa		13.92	□□□□□ -0.18
NPIPB4-216	ENST00000542338	AGL	P35573	1532 aa		13.9	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		13.9	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	PLXNC1	O60486	1568 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	MLEC	Q14165	292 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	ATP7A	Q04656	1500 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		13.89	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		13.88	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.87	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		13.86	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	TRIM52	Q96A61	297 aa		13.85	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
NPIPB4-216	ENST00000542338	HSPA2	P54652	639 aa		13.83	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		13.83	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	A2M	P01023	1474 aa		13.82	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	KIF3B	O15066	747 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	NUP155	O75694	1391 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	KANK1	Q14678	1352 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	C3	P01024	1663 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NPIPB4-216	ENST00000542338	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	UNC13B	O14795	1591 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	STRC	Q7RTU9	1775 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	GGT6	Q6P531	493 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NPIPB4-216	ENST00000542338	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	NPAT	Q14207	1427 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	PKD2	Q13563	968 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	DEPDC5	O75140	1603 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	PZP	P20742	1482 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	CERK	Q8TCT0	537 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	ZMYM3	Q14202	1370 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NPIPB4-216	ENST00000542338	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	PTPRT	O14522	1441 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	TET3	O43151	1660 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.61	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.6	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	ABCC3	O15438	1527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		13.59	□□□□□ -0.23
NPIPB4-216	ENST00000542338	NEUROD1	Q13562	356 aa		13.58	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.57	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	TNR	Q92752	1358 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		13.56	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	POTED	Q86YR6	584 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	TONSL	Q96HA7	1378 aa		13.55	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.54	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338		E9PCH4	1651 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	CEP152	O94986	1710 aa		13.53	□□□□□ -0.24
NPIPB4-216	ENST00000542338	STAC3	Q96MF2	364 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		13.52	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	TRPM2	O94759	1503 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	NOS1	P29475	1434 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	ERVK-7	P63135	1459 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
NPIPB4-216	ENST00000542338	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25

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