RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541213.5

POLE-216, Transcript of DNA polymerase epsilon, catalytic subunit, human

TSL 3

Gene POLE, Length 1,675 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLE-216	ENST00000541213	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	32.66	■■■□□ 2.82	2e-6	■■□□□ 13.8
POLE-216	ENST00000541213	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		32.66	■■■□□ 2.82
POLE-216	ENST00000541213	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
POLE-216	ENST00000541213	ATP10A	O60312	1499 aa		32.65	■■■□□ 2.82
POLE-216	ENST00000541213	PZP	P20742	1482 aa		32.64	■■■□□ 2.82
POLE-216	ENST00000541213	UNC13B	O14795	1591 aa		32.64	■■■□□ 2.82
POLE-216	ENST00000541213	KANK1	Q14678	1352 aa		32.58	■■■□□ 2.81
POLE-216	ENST00000541213	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		32.57	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	PKD2	Q13563	968 aa		32.56	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	DEPDC5	O75140	1603 aa		32.54	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.54	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	GGT6	Q6P531	493 aa		32.53	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.52	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		32.51	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.51	■■■□□ 2.8
POLE-216	ENST00000541213	FOXD1	Q16676	465 aa		32.5	■■■□□ 2.79
POLE-216	ENST00000541213	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
POLE-216	ENST00000541213	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
POLE-216	ENST00000541213	AGL	P35573	1532 aa		32.48	■■■□□ 2.79
POLE-216	ENST00000541213	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.46	■■■□□ 2.79
POLE-216	ENST00000541213	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		32.45	■■■□□ 2.79
POLE-216	ENST00000541213	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		32.45	■■■□□ 2.79
POLE-216	ENST00000541213	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.44	■■■□□ 2.78
POLE-216	ENST00000541213	NEUROD1	Q13562	356 aa		32.42	■■■□□ 2.78
POLE-216	ENST00000541213	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.4	■■■□□ 2.78
POLE-216	ENST00000541213	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.4	■■■□□ 2.78
POLE-216	ENST00000541213	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.37	■■■□□ 2.77
POLE-216	ENST00000541213	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		32.37	■■■□□ 2.77
POLE-216	ENST00000541213	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
POLE-216	ENST00000541213	TET3	O43151	1660 aa		32.33	■■■□□ 2.77
POLE-216	ENST00000541213	ABCC3	O15438	1527 aa		32.29	■■■□□ 2.76
POLE-216	ENST00000541213	MLEC	Q14165	292 aa		32.27	■■■□□ 2.76
POLE-216	ENST00000541213	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.25	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.25	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.25	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213		E9PCH4	1651 aa		32.23	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.21	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.21	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	CEP152	O94986	1710 aa		32.21	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	PTPRT	O14522	1441 aa		32.21	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.2	■■■□□ 2.75
POLE-216	ENST00000541213	NPAT	Q14207	1427 aa		32.19	■■■□□ 2.74
POLE-216	ENST00000541213	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.15	■■■□□ 2.74
POLE-216	ENST00000541213	TRPM2	O94759	1503 aa		32.12	■■■□□ 2.73
POLE-216	ENST00000541213	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
POLE-216	ENST00000541213	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.09	■■■□□ 2.73
POLE-216	ENST00000541213	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		32.08	■■■□□ 2.73
POLE-216	ENST00000541213	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.08	■■■□□ 2.73
POLE-216	ENST00000541213	NOS1	P29475	1434 aa		32.05	■■■□□ 2.72
POLE-216	ENST00000541213	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.04	■■■□□ 2.72
POLE-216	ENST00000541213	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
POLE-216	ENST00000541213	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	31.98	■■■□□ 2.71
POLE-216	ENST00000541213	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		31.98	■■■□□ 2.71
POLE-216	ENST00000541213	CLTCL1	P53675	1640 aa		31.96	■■■□□ 2.71
POLE-216	ENST00000541213	RGL3	Q3MIN7	710 aa		31.95	■■■□□ 2.71
POLE-216	ENST00000541213	ERVK-7	P63135	1459 aa		31.95	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		31.93	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		31.91	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.91	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		31.91	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	MROH2A	A6NES4	1674 aa		31.89	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	SYNM	O15061	1565 aa		31.89	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		31.89	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	IDI1	Q13907	227 aa		31.89	■■■□□ 2.7
POLE-216	ENST00000541213	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		31.88	■■■□□ 2.69
POLE-216	ENST00000541213	STAC3	Q96MF2	364 aa		31.88	■■■□□ 2.69
POLE-216	ENST00000541213	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.86	■■■□□ 2.69
POLE-216	ENST00000541213	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		31.85	■■■□□ 2.69
POLE-216	ENST00000541213	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		31.84	■■■□□ 2.69
POLE-216	ENST00000541213	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.83	■■■□□ 2.69
POLE-216	ENST00000541213	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	KIF1B	O60333	1816 aa		31.8	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	TNR	Q92752	1358 aa		31.79	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.79	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		31.79	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	ADGRB3	O60242	1522 aa		31.78	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		31.78	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		31.77	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	MADD	Q8WXG6	1647 aa		31.76	■■■□□ 2.68
POLE-216	ENST00000541213	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		31.76	■■■□□ 2.67
POLE-216	ENST00000541213	C3	P01024	1663 aa		31.72	■■■□□ 2.67
POLE-216	ENST00000541213	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		31.7	■■■□□ 2.66
POLE-216	ENST00000541213	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		31.69	■■■□□ 2.66
POLE-216	ENST00000541213	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
POLE-216	ENST00000541213	NLRP1	Q9C000	1473 aa		31.66	■■■□□ 2.66
POLE-216	ENST00000541213	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		31.65	■■■□□ 2.66
POLE-216	ENST00000541213	MYOM2	P54296	1465 aa		31.64	■■■□□ 2.66
POLE-216	ENST00000541213	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.65
POLE-216	ENST00000541213	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		31.62	■■■□□ 2.65
POLE-216	ENST00000541213	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.6	■■■□□ 2.65
POLE-216	ENST00000541213	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
POLE-216	ENST00000541213	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		31.58	■■■□□ 2.65
POLE-216	ENST00000541213	PTPRM	P28827	1452 aa		31.56	■■■□□ 2.64
POLE-216	ENST00000541213	ZFYVE9	O95405	1425 aa		31.56	■■■□□ 2.64
POLE-216	ENST00000541213	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		31.56	■■■□□ 2.64

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