RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539034.1

CLIP1-AS1-202, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CLIP1-AS1, Length 447 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MAP3K9P80192 1104 aa10.53□□□□□ -0.72
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NUTM2FA1L443 756 aa10.5□□□□□ -0.73
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.5□□□□□ -0.73
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.5□□□□□ -0.73
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF687Q8N1G0 1237 aa10.49□□□□□ -0.73
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.39□□□□□ -0.75
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PTGDRQ13258 359 aa10.36□□□□□ -0.75
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PSEN2P49810 448 aa10.35□□□□□ -0.75
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FOSBP53539 338 aa10.34□□□□□ -0.75
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PBX2P40425 430 aa10.33□□□□□ -0.76
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 MMRN1Q13201 1228 aa10.33□□□□□ -0.76
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 JPH4Q96JJ6 628 aa10.31□□□□□ -0.76
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZMYND15Q9H091 742 aa10.31□□□□□ -0.76
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 CDHR5Q9HBB8 845 aa10.3□□□□□ -0.76
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZDHHC16Q969W1 377 aa10.29□□□□□ -0.76
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FLIIQ13045 1269 aa10.2□□□□□ -0.78
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa10.18□□□□□ -0.78
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.16□□□□□ -0.78
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.16□□□□□ -0.78
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 ZBED2Q9BTP6 218 aa10.15□□□□□ -0.78
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PROX2Q3B8N5 592 aa10.13□□□□□ -0.79
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM161AQ3B820 660 aa10.12□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.12□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 UBTFP17480 764 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 PADI6Q6TGC4 694 aa10.11□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 SLC4A5Q9BY07 1137 aa10.11□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CLIP1-AS1-202ENST00000539034 OATP04181 439 aa10.1□□□□□ -0.79
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CLIP1-AS1-202ENST00000539034 NLRP7Q8WX94 980 aa10.1□□□□□ -0.79
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