RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538037.5

PUS1-207, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-207ENST00000538037 NCOA2Q15596 1464 aa34.78■■■■□ 3.16
PUS1-207ENST00000538037 RSPH4AQ5TD94 716 aa34.76■■■■□ 3.16
PUS1-207ENST00000538037 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa34.75■■■■□ 3.15
PUS1-207ENST00000538037 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.75■■■■□ 3.15
PUS1-207ENST00000538037 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa34.74■■■■□ 3.15
PUS1-207ENST00000538037 TNRQ92752 1358 aa34.74■■■■□ 3.15
PUS1-207ENST00000538037 PZPP20742 1482 aa34.71■■■■□ 3.15
PUS1-207ENST00000538037 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.68■■■■□ 3.14
PUS1-207ENST00000538037 NEURL4Q96JN8 1562 aa34.66■■■■□ 3.14
PUS1-207ENST00000538037 KDM5DQ9BY66 1539 aa34.66■■■■□ 3.14
PUS1-207ENST00000538037 MIA2Q96PC5 1412 aa34.64■■■■□ 3.14
PUS1-207ENST00000538037 FAM135AQ9P2D6 1515 aa34.64■■■■□ 3.14
PUS1-207ENST00000538037 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.62■■■■□ 3.13
PUS1-207ENST00000538037 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.61■■■■□ 3.13
PUS1-207ENST00000538037 TSPY4P0CV99 314 aa34.59■■■■□ 3.13
PUS1-207ENST00000538037 TSPY10P0CW01 314 aa34.59■■■■□ 3.13
PUS1-207ENST00000538037 ANKLE2Q86XL3 938 aa34.58■■■■□ 3.13
PUS1-207ENST00000538037 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.58■■■■□ 3.13
PUS1-207ENST00000538037 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP34.57■■■■□ 3.12
PUS1-207ENST00000538037 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP34.55■■■■□ 3.12
PUS1-207ENST00000538037 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.53■■■■□ 3.12
PUS1-207ENST00000538037 NLRP1Q9C000 1473 aa34.53■■■■□ 3.12
PUS1-207ENST00000538037 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
PUS1-207ENST00000538037 CPS1P31327 1500 aa34.51■■■■□ 3.12
PUS1-207ENST00000538037 MED14O60244 1454 aa34.51■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.5■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa34.5■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 HSPA1LP34931 641 aa34.5■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.49■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.47■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.47■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 TOM1O60784 492 aa34.46■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 PIP4K2BP78356 416 aa34.46■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 ABCC3O15438 1527 aa34.45■■■■□ 3.11
PUS1-207ENST00000538037 DEPDC5O75140 1603 aa34.44■■■■□ 3.1
PUS1-207ENST00000538037 ALKQ9UM73 1620 aa34.41■■■■□ 3.1
PUS1-207ENST00000538037 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.4■■■■□ 3.1
PUS1-207ENST00000538037 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP34.39■■■■□ 3.1
PUS1-207ENST00000538037 ERVK-7P63135 1459 aa34.38■■■■□ 3.09
PUS1-207ENST00000538037 MAP3K1Q13233 1512 aa34.36■■■■□ 3.09
PUS1-207ENST00000538037 MYOM3Q5VTT5 1437 aa34.35■■■■□ 3.09
PUS1-207ENST00000538037 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
PUS1-207ENST00000538037 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
PUS1-207ENST00000538037 STRCP1A6NGW2 1772 aa34.32■■■■□ 3.08
PUS1-207ENST00000538037 IQGAP1P46940 1657 aa34.31■■■■□ 3.08
PUS1-207ENST00000538037 LRRC7Q96NW7 1537 aa34.28■■■■□ 3.08
PUS1-207ENST00000538037 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PUS1-207ENST00000538037 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
PUS1-207ENST00000538037 LTKP29376 864 aa34.26■■■■□ 3.08
PUS1-207ENST00000538037 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.25■■■■□ 3.07
PUS1-207ENST00000538037 CEP152O94986 1710 aa34.25■■■■□ 3.07
PUS1-207ENST00000538037 ABCC5O15440 1437 aa34.23■■■■□ 3.07
PUS1-207ENST00000538037 UBR1Q8IWV7 1749 aa34.23■■■■□ 3.07
PUS1-207ENST00000538037 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34.22■■■■□ 3.07
PUS1-207ENST00000538037 ARHGAP23Q9P227 1491 aa34.2■■■■□ 3.07
PUS1-207ENST00000538037 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.2■■■■□ 3.07
PUS1-207ENST00000538037 KIF15Q9NS87 1388 aa34.19■■■■□ 3.06
PUS1-207ENST00000538037 TXNDC2Q86VQ3 553 aa34.17■■■■□ 3.06
PUS1-207ENST00000538037 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PUS1-207ENST00000538037 SLIT1O75093 1534 aa34.16■■■■□ 3.06
PUS1-207ENST00000538037 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PUS1-207ENST00000538037 ERBINQ96RT1 1412 aa34.13■■■■□ 3.05
PUS1-207ENST00000538037 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.1■■■■□ 3.053e-6■■□□□ 11.8
PUS1-207ENST00000538037 SYNMO15061 1565 aa34.09■■■■□ 3.05
PUS1-207ENST00000538037 PTPN23Q9H3S7 1636 aa34.08■■■■□ 3.05
PUS1-207ENST00000538037 DAPK1P53355 1430 aa34.07■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.06■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.06■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 TMEM2Q9UHN6 1383 aa34.04■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 IDI1Q13907 227 aa34.04■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 PIK3C2BO00750 1634 aa34.03■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 EID1Q9Y6B2 187 aa34.02■■■■□ 3.04
PUS1-207ENST00000538037 FGD6Q6ZV73 1430 aa34■■■■□ 3.03
PUS1-207ENST00000538037 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34■■■■□ 3.03
PUS1-207ENST00000538037 LMTK2Q8IWU2 1503 aa33.99■■■■□ 3.03
PUS1-207ENST00000538037 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP33.96■■■■□ 3.03
PUS1-207ENST00000538037 KANK1Q14678 1352 aa33.96■■■■□ 3.03
PUS1-207ENST00000538037 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa33.94■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 NOS1P29475 1434 aa33.93■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 APLP2Q06481 763 aa33.92■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 TET3O43151 1660 aa33.92■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 KCNA6P17658 529 aa33.91■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 STAG3Q9UJ98 1225 aa33.91■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 EFCAB6Q5THR3 1501 aa33.9■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 SLC26A8Q96RN1 970 aa33.89■■■■□ 3.02
PUS1-207ENST00000538037 FAM135BQ49AJ0 1406 aa33.88■■■■□ 3.01
PUS1-207ENST00000538037 TMEM94Q12767 1356 aa33.87■■■■□ 3.01
PUS1-207ENST00000538037 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PUS1-207ENST00000538037 ADGRL2O95490 1459 aa33.82■■■■□ 3
PUS1-207ENST00000538037 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
PUS1-207ENST00000538037 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.81■■■■□ 3
PUS1-207ENST00000538037 ADGRB3O60242 1522 aa33.76■■■■□ 3
PUS1-207ENST00000538037 ZFYVE9O95405 1425 aa33.71■■■□□ 2.99
PUS1-207ENST00000538037 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa33.71■■■□□ 2.99
PUS1-207ENST00000538037 NWD1Q149M9 1564 aa33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms