RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537954.5

PGA3-203, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 2

Gene PGA3, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-203ENST00000537954 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
PGA3-203ENST00000537954 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
PGA3-203ENST00000537954 DAPK1P53355 1430 aa25.9■■□□□ 1.74
PGA3-203ENST00000537954 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
PGA3-203ENST00000537954 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.89■■□□□ 1.74
PGA3-203ENST00000537954 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.88■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.87■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 PKD2Q13563 968 aa25.86■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.86■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.85■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.85■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 PLA2R1Q13018 1463 aa25.84■■□□□ 1.73
PGA3-203ENST00000537954 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.82■■□□□ 1.72
PGA3-203ENST00000537954 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PGA3-203ENST00000537954 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
PGA3-203ENST00000537954 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
PGA3-203ENST00000537954 KIF3BO15066 747 aa25.79■■□□□ 1.72
PGA3-203ENST00000537954 TSPY4P0CV99 314 aa25.76■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 TSPY10P0CW01 314 aa25.76■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 ADGRL2O95490 1459 aa25.76■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.75■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.75■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.73■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 ITGAEP38570 1179 aa25.71■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 ILDR2Q71H61 639 aa25.71■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.7■■□□□ 1.71
PGA3-203ENST00000537954 TNRQ92752 1358 aa25.69■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.69■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 PZPP20742 1482 aa25.69■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.68■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 ROCK1Q13464 1354 aa25.66■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.65■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.65■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 KIF15Q9NS87 1388 aa25.65■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.64■■□□□ 1.7
PGA3-203ENST00000537954 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.63■■□□□ 1.69
PGA3-203ENST00000537954 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
PGA3-203ENST00000537954 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.59■■□□□ 1.69
PGA3-203ENST00000537954 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.58■■□□□ 1.69
PGA3-203ENST00000537954 NLRP1Q9C000 1473 aa25.58■■□□□ 1.69
PGA3-203ENST00000537954 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 SOCS7O14512 581 aa25.57■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 ERBINQ96RT1 1412 aa25.56■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.56■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.56■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 NAIPQ13075 1403 aa25.54■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 HFM1A2PYH4 1435 aa25.53■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.52■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.52■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.52■■□□□ 1.68
PGA3-203ENST00000537954 MED14O60244 1454 aa25.51■■□□□ 1.67
PGA3-203ENST00000537954 ABCC3O15438 1527 aa25.51■■□□□ 1.67
PGA3-203ENST00000537954 CPS1P31327 1500 aa25.51■■□□□ 1.67
PGA3-203ENST00000537954 DEPDC5O75140 1603 aa25.49■■□□□ 1.67
PGA3-203ENST00000537954 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
PGA3-203ENST00000537954 TOM1O60784 492 aa25.46■■□□□ 1.67
PGA3-203ENST00000537954 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.46■■□□□ 1.67
PGA3-203ENST00000537954 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
PGA3-203ENST00000537954 ERVK-7P63135 1459 aa25.44■■□□□ 1.66
PGA3-203ENST00000537954 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
PGA3-203ENST00000537954 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
PGA3-203ENST00000537954 UNC13BO14795 1591 aa25.43■■□□□ 1.66
PGA3-203ENST00000537954 HSPA1LP34931 641 aa25.42■■□□□ 1.66
PGA3-203ENST00000537954 PIP4K2BP78356 416 aa25.42■■□□□ 1.66
PGA3-203ENST00000537954 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
PGA3-203ENST00000537954 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.37■■□□□ 1.65
PGA3-203ENST00000537954 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.37■■□□□ 1.65
PGA3-203ENST00000537954 IQGAP1P46940 1657 aa25.36■■□□□ 1.65
PGA3-203ENST00000537954 CEP152O94986 1710 aa25.36■■□□□ 1.65
PGA3-203ENST00000537954 ALKQ9UM73 1620 aa25.33■■□□□ 1.65
PGA3-203ENST00000537954 LTKP29376 864 aa25.32■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.31■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.31■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.3■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.3■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.3■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.3■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.29■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.29■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.28■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 SLIT1O75093 1534 aa25.27■■□□□ 1.64
PGA3-203ENST00000537954 NUP155O75694 1391 aa25.25■■□□□ 1.63
PGA3-203ENST00000537954 TET3O43151 1660 aa25.23■■□□□ 1.63
PGA3-203ENST00000537954 KANK1Q14678 1352 aa25.23■■□□□ 1.63
PGA3-203ENST00000537954 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PGA3-203ENST00000537954 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.22■■□□□ 1.63
PGA3-203ENST00000537954 EID1Q9Y6B2 187 aa25.22■■□□□ 1.63
PGA3-203ENST00000537954 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.2■■□□□ 1.63
PGA3-203ENST00000537954 SYNMO15061 1565 aa25.2■■□□□ 1.62
PGA3-203ENST00000537954 IDI1Q13907 227 aa25.2■■□□□ 1.62
PGA3-203ENST00000537954 E9PCH4 1651 aa25.19■■□□□ 1.62
PGA3-203ENST00000537954 HRCP23327 699 aa25.18■■□□□ 1.62
PGA3-203ENST00000537954 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.17■■□□□ 1.62
PGA3-203ENST00000537954 PIK3C2BO00750 1634 aa25.16■■□□□ 1.62
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