RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535423.5

TM7SF3-204, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-204ENST00000535423 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.56■■■■■ 4.08
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TM7SF3-204ENST00000535423 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
TM7SF3-204ENST00000535423 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
TM7SF3-204ENST00000535423 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
TM7SF3-204ENST00000535423 ABCC5O15440 1437 aa40.52■■■■■ 4.08
TM7SF3-204ENST00000535423 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.5■■■■■ 4.07
TM7SF3-204ENST00000535423 DAPK1P53355 1430 aa40.49■■■■■ 4.07
TM7SF3-204ENST00000535423 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.46■■■■■ 4.07
TM7SF3-204ENST00000535423 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
TM7SF3-204ENST00000535423 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
TM7SF3-204ENST00000535423 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.44■■■■■ 4.06
TM7SF3-204ENST00000535423 PZPP20742 1482 aa40.43■■■■■ 4.06
TM7SF3-204ENST00000535423 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.42■■■■■ 4.06
TM7SF3-204ENST00000535423 KIF15Q9NS87 1388 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-204ENST00000535423 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-204ENST00000535423 NCOA1Q15788 1441 aa40.4■■■■■ 4.06
TM7SF3-204ENST00000535423 ABCC3O15438 1527 aa40.36■■■■■ 4.05
TM7SF3-204ENST00000535423 CEP152O94986 1710 aa40.36■■■■■ 4.05
TM7SF3-204ENST00000535423 ERBINQ96RT1 1412 aa40.34■■■■■ 4.05
TM7SF3-204ENST00000535423 PTPRTO14522 1441 aa40.33■■■■■ 4.05
TM7SF3-204ENST00000535423 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.32■■■■■ 4.05
TM7SF3-204ENST00000535423 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 TNRQ92752 1358 aa40.31■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.31■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.28■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 FBXO41Q8TF61 875 aa40.28■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.27■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 PLA2R1Q13018 1463 aa40.27■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 DEPDC5O75140 1603 aa40.27■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.26■■■■■ 4.04
TM7SF3-204ENST00000535423 ADGRL2O95490 1459 aa40.21■■■■■ 4.03
TM7SF3-204ENST00000535423 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-204ENST00000535423 CERKQ8TCT0 537 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-204ENST00000535423 NLRP1Q9C000 1473 aa40.18■■■■■ 4.02
TM7SF3-204ENST00000535423 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.16■■■■■ 4.02
TM7SF3-204ENST00000535423 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
TM7SF3-204ENST00000535423 PKD2Q13563 968 aa40.15■■■■■ 4.02
TM7SF3-204ENST00000535423 ERVK-7P63135 1459 aa40.13■■■■■ 4.01
TM7SF3-204ENST00000535423 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.09■■■■■ 4.01
TM7SF3-204ENST00000535423 KANK1Q14678 1352 aa40.09■■■■■ 4.01
TM7SF3-204ENST00000535423 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.01
TM7SF3-204ENST00000535423 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.07■■■■■ 4
TM7SF3-204ENST00000535423 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.05■■■■■ 4
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TM7SF3-204ENST00000535423 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.01■■■■■ 4
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TM7SF3-204ENST00000535423 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.99■■■■□ 3.99
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TM7SF3-204ENST00000535423 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP39.97■■■■□ 3.99
TM7SF3-204ENST00000535423 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.97■■■■□ 3.99
TM7SF3-204ENST00000535423 ANKLE2Q86XL3 938 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-204ENST00000535423 ROCK1Q13464 1354 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-204ENST00000535423 EFCAB6Q5THR3 1501 aa39.91■■■■□ 3.98
TM7SF3-204ENST00000535423 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP39.88■■■■□ 3.97
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TM7SF3-204ENST00000535423 PIK3C2BO00750 1634 aa39.84■■■■□ 3.97
TM7SF3-204ENST00000535423 MED14O60244 1454 aa39.84■■■■□ 3.97
TM7SF3-204ENST00000535423 TET3O43151 1660 aa39.83■■■■□ 3.97
TM7SF3-204ENST00000535423 IQGAP1P46940 1657 aa39.83■■■■□ 3.97
TM7SF3-204ENST00000535423 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.81■■■■□ 3.96
TM7SF3-204ENST00000535423 ITGAEP38570 1179 aa39.81■■■■□ 3.96
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TM7SF3-204ENST00000535423 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
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TM7SF3-204ENST00000535423 SLIT1O75093 1534 aa39.74■■■■□ 3.95
TM7SF3-204ENST00000535423 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.72■■■■□ 3.95
TM7SF3-204ENST00000535423 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.71■■■■□ 3.95
TM7SF3-204ENST00000535423 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.68■■■■□ 3.94
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TM7SF3-204ENST00000535423 E9PCH4 1651 aa39.66■■■■□ 3.94
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TM7SF3-204ENST00000535423 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.65■■■■□ 3.94
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TM7SF3-204ENST00000535423 EID1Q9Y6B2 187 aa39.58■■■■□ 3.93
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TM7SF3-204ENST00000535423 HFM1A2PYH4 1435 aa39.35■■■■□ 3.89
TM7SF3-204ENST00000535423 ZFYVE9O95405 1425 aa39.35■■■■□ 3.89
TM7SF3-204ENST00000535423 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.31■■■■□ 3.88
TM7SF3-204ENST00000535423 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP39.3■■■■□ 3.88
TM7SF3-204ENST00000535423 TOM1O60784 492 aa39.29■■■■□ 3.88
TM7SF3-204ENST00000535423 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
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