RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534826.5

CNIH2-206, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene CNIH2, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2-206ENST00000534826 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.77■■■■■ 4.12
CNIH2-206ENST00000534826 PTPRTO14522 1441 aa40.76■■■■■ 4.11
CNIH2-206ENST00000534826 CERKQ8TCT0 537 aa40.74■■■■■ 4.11
CNIH2-206ENST00000534826 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.74■■■■■ 4.11
CNIH2-206ENST00000534826 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
CNIH2-206ENST00000534826 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.73■■■■■ 4.11
CNIH2-206ENST00000534826 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.1
CNIH2-206ENST00000534826 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CNIH2-206ENST00000534826 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.67■■■■■ 4.1
CNIH2-206ENST00000534826 PZPP20742 1482 aa40.67■■■■■ 4.1
CNIH2-206ENST00000534826 FGD6Q6ZV73 1430 aa40.64■■■■■ 4.1
CNIH2-206ENST00000534826 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.64■■■■■ 4.1
CNIH2-206ENST00000534826 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.62■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 TNRQ92752 1358 aa40.61■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.61■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 PLA2R1Q13018 1463 aa40.61■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.6■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 ABCC5O15440 1437 aa40.59■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.59■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
CNIH2-206ENST00000534826 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.57■■■■■ 4.08
CNIH2-206ENST00000534826 DAPK1P53355 1430 aa40.57■■■■■ 4.08
CNIH2-206ENST00000534826 KIF15Q9NS87 1388 aa40.55■■■■■ 4.08
CNIH2-206ENST00000534826 ABCC3O15438 1527 aa40.54■■■■■ 4.08
CNIH2-206ENST00000534826 PKD2Q13563 968 aa40.54■■■■■ 4.08
CNIH2-206ENST00000534826 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.5■■■■■ 4.07
CNIH2-206ENST00000534826 ERBINQ96RT1 1412 aa40.49■■■■■ 4.07
CNIH2-206ENST00000534826 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.48■■■■■ 4.07
CNIH2-206ENST00000534826 CEP152O94986 1710 aa40.46■■■■■ 4.07
CNIH2-206ENST00000534826 NLRP1Q9C000 1473 aa40.45■■■■■ 4.07
CNIH2-206ENST00000534826 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.43■■■■■ 4.06
CNIH2-206ENST00000534826 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.41■■■■■ 4.06
CNIH2-206ENST00000534826 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
CNIH2-206ENST00000534826 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.39■■■■■ 4.06
CNIH2-206ENST00000534826 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
CNIH2-206ENST00000534826 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.38■■■■■ 4.05
CNIH2-206ENST00000534826 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.36■■■■■ 4.05
CNIH2-206ENST00000534826 ERVK-7P63135 1459 aa40.36■■■■■ 4.05
CNIH2-206ENST00000534826 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
CNIH2-206ENST00000534826 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.33■■■■■ 4.05
CNIH2-206ENST00000534826 DEPDC5O75140 1603 aa40.32■■■■■ 4.05
CNIH2-206ENST00000534826 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.31■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.3■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 KANK1Q14678 1352 aa40.3■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.29■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.27■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.26■■■■■ 4.04
CNIH2-206ENST00000534826 ADGRL2O95490 1459 aa40.26■■■■■ 4.03
CNIH2-206ENST00000534826 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.24■■■■■ 4.03
CNIH2-206ENST00000534826 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.13■■■■■ 4.02
CNIH2-206ENST00000534826 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.13■■■■■ 4.01
CNIH2-206ENST00000534826 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.13■■■■■ 4.01
CNIH2-206ENST00000534826 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.13■■■■■ 4.01
CNIH2-206ENST00000534826 MED14O60244 1454 aa40.12■■■■■ 4.01
CNIH2-206ENST00000534826 IQGAP1P46940 1657 aa40.08■■■■■ 4.01
CNIH2-206ENST00000534826 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.08■■■■■ 4.01
CNIH2-206ENST00000534826 CPS1P31327 1500 aa40.04■■■■■ 4
CNIH2-206ENST00000534826 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.04■■■■■ 4
CNIH2-206ENST00000534826 PIK3C2BO00750 1634 aa40.01■■■■■ 4
CNIH2-206ENST00000534826 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.99■■■■□ 3.99
CNIH2-206ENST00000534826 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
CNIH2-206ENST00000534826 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP39.97■■■■□ 3.99
CNIH2-206ENST00000534826 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.97■■■■□ 3.99
CNIH2-206ENST00000534826 SLIT1O75093 1534 aa39.96■■■■□ 3.99
CNIH2-206ENST00000534826 ROCK1Q13464 1354 aa39.95■■■■□ 3.99
CNIH2-206ENST00000534826 ARHGAP23Q9P227 1491 aa39.94■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 SYNMO15061 1565 aa39.93■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 UNC13BO14795 1591 aa39.9■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 TXNDC2Q86VQ3 553 aa39.9■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 EID1Q9Y6B2 187 aa39.9■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 NOS1P29475 1434 aa39.9■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 TET3O43151 1660 aa39.89■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP39.88■■■■□ 3.98
CNIH2-206ENST00000534826 ITGAEP38570 1179 aa39.88■■■■□ 3.97
CNIH2-206ENST00000534826 LTKP29376 864 aa39.86■■■■□ 3.97
CNIH2-206ENST00000534826 IDI1Q13907 227 aa39.86■■■■□ 3.97
CNIH2-206ENST00000534826 TMEM2Q9UHN6 1383 aa39.85■■■■□ 3.97
CNIH2-206ENST00000534826 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.84■■■■□ 3.97
CNIH2-206ENST00000534826 ADGRB3O60242 1522 aa39.82■■■■□ 3.97
CNIH2-206ENST00000534826 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.8■■■■□ 3.96
CNIH2-206ENST00000534826 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.78■■■■□ 3.96
CNIH2-206ENST00000534826 TOM1O60784 492 aa39.77■■■■□ 3.96
CNIH2-206ENST00000534826 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
CNIH2-206ENST00000534826 IQGAP3Q86VI3 1631 aa39.74■■■■□ 3.95
CNIH2-206ENST00000534826 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.7■■■■□ 3.95
CNIH2-206ENST00000534826 E9PCH4 1651 aa39.7■■■■□ 3.95
CNIH2-206ENST00000534826 PIP4K2BP78356 416 aa39.69■■■■□ 3.94
CNIH2-206ENST00000534826 NUP155O75694 1391 aa39.67■■■■□ 3.94
CNIH2-206ENST00000534826 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP39.66■■■■□ 3.94
CNIH2-206ENST00000534826 DISP3Q9P2K9 1392 aa39.66■■■■□ 3.94
CNIH2-206ENST00000534826 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.61■■■■□ 3.93
CNIH2-206ENST00000534826 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.58■■■■□ 3.93
CNIH2-206ENST00000534826 BCANQ96GW7 911 aa39.56■■■■□ 3.92
CNIH2-206ENST00000534826 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.55■■■■□ 3.92
CNIH2-206ENST00000534826 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.54■■■■□ 3.92
CNIH2-206ENST00000534826 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.54■■■■□ 3.92
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