RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528426.5

CHID1-212, Transcript of chitinase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene CHID1, Length 991 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1-212ENST00000528426 FAM135AQ9P2D6 1515 aa43.98■■■■■ 4.63
CHID1-212ENST00000528426 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.97■■■■■ 4.63
CHID1-212ENST00000528426 NCOA1Q15788 1441 aa43.97■■■■■ 4.63
CHID1-212ENST00000528426 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.97■■■■■ 4.63
CHID1-212ENST00000528426 NPATQ14207 1427 aa43.96■■■■■ 4.63
CHID1-212ENST00000528426 ERBINQ96RT1 1412 aa43.93■■■■■ 4.62
CHID1-212ENST00000528426 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
CHID1-212ENST00000528426 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.93■■■■■ 4.62
CHID1-212ENST00000528426 ADGRL2O95490 1459 aa43.92■■■■■ 4.62
CHID1-212ENST00000528426 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.9■■■■■ 4.62
CHID1-212ENST00000528426 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.88■■■■■ 4.61
CHID1-212ENST00000528426 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP43.87■■■■■ 4.61
CHID1-212ENST00000528426 HSPA2P54652 639 aa43.86■■■■■ 4.61
CHID1-212ENST00000528426 PTPRKQ15262 1439 aa43.86■■■■■ 4.61
CHID1-212ENST00000528426 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.86■■■■■ 4.61
CHID1-212ENST00000528426 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP43.77■■■■■ 4.6
CHID1-212ENST00000528426 ROCK1Q13464 1354 aa43.76■■■■■ 4.6
CHID1-212ENST00000528426 PZPP20742 1482 aa43.74■■■■■ 4.59
CHID1-212ENST00000528426 MROH1Q8NDA8 1641 aa43.73■■■■■ 4.59
CHID1-212ENST00000528426 ABCC3O15438 1527 aa43.72■■■■■ 4.59
CHID1-212ENST00000528426 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP43.7■■■■■ 4.59
CHID1-212ENST00000528426 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.69■■■■■ 4.58
CHID1-212ENST00000528426 KANK1Q14678 1352 aa43.67■■■■■ 4.58
CHID1-212ENST00000528426 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP43.66■■■■■ 4.58
CHID1-212ENST00000528426 ITGAEP38570 1179 aa43.66■■■■■ 4.58
CHID1-212ENST00000528426 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.66■■■■■ 4.58
CHID1-212ENST00000528426 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
CHID1-212ENST00000528426 TNRQ92752 1358 aa43.62■■■■■ 4.57
CHID1-212ENST00000528426 DEPDC5O75140 1603 aa43.62■■■■■ 4.57
CHID1-212ENST00000528426 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.57■■■■■ 4.57
CHID1-212ENST00000528426 DMRT2Q9Y5R5 561 aa43.55■■■■■ 4.56
CHID1-212ENST00000528426 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.51■■■■■ 4.56
CHID1-212ENST00000528426 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.51■■■■■ 4.56
CHID1-212ENST00000528426 MYO3AQ8NEV4 1616 aa43.51■■■■■ 4.56
CHID1-212ENST00000528426 A2ML1A8K2U0 1454 aa43.5■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP43.48■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 CEP152O94986 1710 aa43.47■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa43.47■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 NLRP1Q9C000 1473 aa43.46■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP43.46■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa43.46■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 ERVK-7P63135 1459 aa43.45■■■■■ 4.55
CHID1-212ENST00000528426 STRCQ7RTU9 1775 aa43.39■■■■■ 4.54
CHID1-212ENST00000528426 PLA2R1Q13018 1463 aa43.38■■■■■ 4.54
CHID1-212ENST00000528426 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP43.38■■■■■ 4.53
CHID1-212ENST00000528426 PKD2Q13563 968 aa43.37■■■■■ 4.53
CHID1-212ENST00000528426 PTPRTO14522 1441 aa43.35■■■■■ 4.53
CHID1-212ENST00000528426 UNC13BO14795 1591 aa43.3■■■■■ 4.52
CHID1-212ENST00000528426 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa43.29■■■■■ 4.52
CHID1-212ENST00000528426 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.27■■■■■ 4.52
CHID1-212ENST00000528426 NAIPQ13075 1403 aa43.27■■■■■ 4.52
CHID1-212ENST00000528426 UGGT1Q9NYU2 1555 aa43.26■■■■■ 4.52
CHID1-212ENST00000528426 NUP155O75694 1391 aa43.26■■■■■ 4.52
CHID1-212ENST00000528426 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
CHID1-212ENST00000528426 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.24■■■■■ 4.51
CHID1-212ENST00000528426 NOS1P29475 1434 aa43.22■■■■■ 4.51
CHID1-212ENST00000528426 HFM1A2PYH4 1435 aa43.21■■■■■ 4.51
CHID1-212ENST00000528426 ANKLE2Q86XL3 938 aa43.2■■■■■ 4.51
CHID1-212ENST00000528426 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.18■■■■■ 4.5
CHID1-212ENST00000528426 TET3O43151 1660 aa43.17■■■■■ 4.5
CHID1-212ENST00000528426 IDI1Q13907 227 aa43.16■■■■■ 4.5
CHID1-212ENST00000528426 IQGAP3Q86VI3 1631 aa43.14■■■■■ 4.5
CHID1-212ENST00000528426 GCC2Q8IWJ2 1684 aa43.08■■■■■ 4.49
CHID1-212ENST00000528426 STAG3Q9UJ98 1225 aa43.06■■■■■ 4.48
CHID1-212ENST00000528426 SYNMO15061 1565 aa43.06■■■■■ 4.48
CHID1-212ENST00000528426 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.02■■■■■ 4.48
CHID1-212ENST00000528426 CERKQ8TCT0 537 aa43.01■■■■■ 4.48
CHID1-212ENST00000528426 MED14O60244 1454 aa43■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.98■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 PIK3C2BO00750 1634 aa42.97■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 E9PCH4 1651 aa42.97■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 SLIT1O75093 1534 aa42.97■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 TRIM52Q96A61 297 aa42.96■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.95■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 TMEM2Q9UHN6 1383 aa42.95■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 EID1Q9Y6B2 187 aa42.95■■■■■ 4.47
CHID1-212ENST00000528426 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.94■■■■■ 4.46
CHID1-212ENST00000528426 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
CHID1-212ENST00000528426 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
CHID1-212ENST00000528426 LTKP29376 864 aa42.92■■■■■ 4.46
CHID1-212ENST00000528426 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
CHID1-212ENST00000528426 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP42.87■■■■■ 4.45
CHID1-212ENST00000528426 FBXO41Q8TF61 875 aa42.87■■■■■ 4.45
CHID1-212ENST00000528426 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
CHID1-212ENST00000528426 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
CHID1-212ENST00000528426 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.86■■■■■ 4.45
CHID1-212ENST00000528426 ADGRB3O60242 1522 aa42.85■■■■■ 4.45
CHID1-212ENST00000528426 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.82■■■■■ 4.45
CHID1-212ENST00000528426 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42.8■■■■■ 4.44
CHID1-212ENST00000528426 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.79■■■■■ 4.44
CHID1-212ENST00000528426 IQGAP1P46940 1657 aa42.74■■■■■ 4.43
CHID1-212ENST00000528426 CHGAP10645 457 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
CHID1-212ENST00000528426 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa42.73■■■■■ 4.43
CHID1-212ENST00000528426 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP42.69■■■■■ 4.42
CHID1-212ENST00000528426 IQSEC2Q5JU85 1478 aa42.68■■■■■ 4.42
CHID1-212ENST00000528426 ZFYVE9O95405 1425 aa42.68■■■■■ 4.42
CHID1-212ENST00000528426 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.67■■■■■ 4.42
CHID1-212ENST00000528426 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.66■■■■■ 4.42
CHID1-212ENST00000528426 RIMS2Q9UQ26 1411 aa42.65■■■■■ 4.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.9 ms