RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527677.1

TSTA3-207, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-207ENST00000527677 DEPDC5O75140 1603 aa24.97■■□□□ 1.59
TSTA3-207ENST00000527677 KANK1Q14678 1352 aa24.96■■□□□ 1.59
TSTA3-207ENST00000527677 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.96■■□□□ 1.59
TSTA3-207ENST00000527677 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 UNC13BO14795 1591 aa24.94■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.93■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 GGT6Q6P531 493 aa24.92■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.91■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.91■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.9■■□□□ 1.58
TSTA3-207ENST00000527677 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
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TSTA3-207ENST00000527677 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.87■■□□□ 1.57
TSTA3-207ENST00000527677 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.87■■□□□ 1.57
TSTA3-207ENST00000527677 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-207ENST00000527677 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-207ENST00000527677 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.86■■□□□ 1.57
TSTA3-207ENST00000527677 NUP155O75694 1391 aa24.85■■□□□ 1.57
TSTA3-207ENST00000527677 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.84■■□□□ 1.57
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TSTA3-207ENST00000527677 ABCC3O15438 1527 aa24.83■■□□□ 1.57
TSTA3-207ENST00000527677 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa24.81■■□□□ 1.56
TSTA3-207ENST00000527677 TRIM52Q96A61 297 aa24.81■■□□□ 1.56
TSTA3-207ENST00000527677 MROH2AA6NES4 1674 aa24.81■■□□□ 1.56
TSTA3-207ENST00000527677 MADDQ8WXG6 1647 aa24.78■■□□□ 1.56
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.78■■□□□ 1.56
TSTA3-207ENST00000527677 TET3O43151 1660 aa24.77■■□□□ 1.56
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TSTA3-207ENST00000527677 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.74■■□□□ 1.55
TSTA3-207ENST00000527677 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.74■■□□□ 1.55
TSTA3-207ENST00000527677 ZMYM3Q14202 1370 aa24.73■■□□□ 1.55
TSTA3-207ENST00000527677 CEP152O94986 1710 aa24.72■■□□□ 1.55
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TSTA3-207ENST00000527677 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TSTA3-207ENST00000527677 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
TSTA3-207ENST00000527677 MPHOSPH9Q99550 1183 aa24.69■■□□□ 1.54
TSTA3-207ENST00000527677 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.68■■□□□ 1.54
TSTA3-207ENST00000527677 PTPRMP28827 1452 aa24.68■■□□□ 1.54
TSTA3-207ENST00000527677 NPATQ14207 1427 aa24.67■■□□□ 1.54
TSTA3-207ENST00000527677 C3P01024 1663 aa24.63■■□□□ 1.53
TSTA3-207ENST00000527677 PKD2Q13563 968 aa24.63■■□□□ 1.53
TSTA3-207ENST00000527677 E9PCH4 1651 aa24.61■■□□□ 1.53
TSTA3-207ENST00000527677 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.6■■□□□ 1.53
TSTA3-207ENST00000527677 ERVK-7P63135 1459 aa24.6■■□□□ 1.53
TSTA3-207ENST00000527677 NOS1P29475 1434 aa24.59■■□□□ 1.53
TSTA3-207ENST00000527677 PTPRTO14522 1441 aa24.58■■□□□ 1.53
TSTA3-207ENST00000527677 PREX1Q8TCU6 1659 aa24.57■■□□□ 1.52
TSTA3-207ENST00000527677 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
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TSTA3-207ENST00000527677 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
TSTA3-207ENST00000527677 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.54■■□□□ 1.52
TSTA3-207ENST00000527677 TRPM2O94759 1503 aa24.53■■□□□ 1.52
TSTA3-207ENST00000527677 NLRP1Q9C000 1473 aa24.52■■□□□ 1.52
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TSTA3-207ENST00000527677 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
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TSTA3-207ENST00000527677 PLA2R1Q13018 1463 aa24.46■■□□□ 1.51
TSTA3-207ENST00000527677 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.46■■□□□ 1.51
TSTA3-207ENST00000527677 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.46■■□□□ 1.51
TSTA3-207ENST00000527677 PIK3C2BO00750 1634 aa24.45■■□□□ 1.5
TSTA3-207ENST00000527677 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.44■■□□□ 1.5
TSTA3-207ENST00000527677 FOXD1Q16676 465 aa24.44■■□□□ 1.5
TSTA3-207ENST00000527677 MYO3AQ8NEV4 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
TSTA3-207ENST00000527677 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.42■■□□□ 1.5
TSTA3-207ENST00000527677 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
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TSTA3-207ENST00000527677 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TSTA3-207ENST00000527677 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-207ENST00000527677 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
TSTA3-207ENST00000527677 CLTCL1P53675 1640 aa24.37■■□□□ 1.49
TSTA3-207ENST00000527677 ADGRB3O60242 1522 aa24.36■■□□□ 1.49
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TSTA3-207ENST00000527677 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-207ENST00000527677 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TSTA3-207ENST00000527677 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
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TSTA3-207ENST00000527677 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.3■■□□□ 1.48
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TSTA3-207ENST00000527677 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-207ENST00000527677 LMTK3Q96Q04 1460 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-207ENST00000527677 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.28■■□□□ 1.48
TSTA3-207ENST00000527677 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 STAC3Q96MF2 364 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 SLIT1O75093 1534 aa24.25■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.24■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP24.23■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.22■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TSTA3-207ENST00000527677 EID1Q9Y6B2 187 aa24.2■■□□□ 1.46
TSTA3-207ENST00000527677 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.19■■□□□ 1.46
TSTA3-207ENST00000527677 ZFYVE9O95405 1425 aa24.18■■□□□ 1.46
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