RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527527.1

PITPNM1-210, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein membrane associated 1, humanhuman

TSL 4

Gene PITPNM1, Length 459 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1-210ENST00000527527 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.04■■■■□ 3.36
PITPNM1-210ENST00000527527 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
PITPNM1-210ENST00000527527 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
PITPNM1-210ENST00000527527 FAM135AQ9P2D6 1515 aa35.98■■■■□ 3.35
PITPNM1-210ENST00000527527 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
PITPNM1-210ENST00000527527 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.98■■■■□ 3.35
PITPNM1-210ENST00000527527 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.96■■■■□ 3.35
PITPNM1-210ENST00000527527 PZPP20742 1482 aa35.95■■■■□ 3.35
PITPNM1-210ENST00000527527 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.95■■■■□ 3.35
PITPNM1-210ENST00000527527 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.94■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCC5O15440 1437 aa35.91■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 TNRQ92752 1358 aa35.9■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.9■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 PLA2R1Q13018 1463 aa35.9■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 CROCC2H7BZ55 1655 aa35.9■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.9■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
PITPNM1-210ENST00000527527 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 MROH1Q8NDA8 1641 aa35.86■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 SHANK2Q9UPX8 1470 aa35.86■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 ABCC3O15438 1527 aa35.85■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.85■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.85■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 DAPK1P53355 1430 aa35.83■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 KIF15Q9NS87 1388 aa35.83■■■■□ 3.33
PITPNM1-210ENST00000527527 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
PITPNM1-210ENST00000527527 PKD2Q13563 968 aa35.8■■■■□ 3.32
PITPNM1-210ENST00000527527 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa35.8■■■■□ 3.32
PITPNM1-210ENST00000527527 CEP152O94986 1710 aa35.77■■■■□ 3.32
PITPNM1-210ENST00000527527 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PITPNM1-210ENST00000527527 ERBINQ96RT1 1412 aa35.73■■■■□ 3.31
PITPNM1-210ENST00000527527 CHIC2Q9UKJ5 165 aa35.72■■■■□ 3.31
PITPNM1-210ENST00000527527 NLRP1Q9C000 1473 aa35.72■■■■□ 3.31
PITPNM1-210ENST00000527527 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa35.7■■■■□ 3.31
PITPNM1-210ENST00000527527 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
PITPNM1-210ENST00000527527 ERVK-7P63135 1459 aa35.69■■■■□ 3.3
PITPNM1-210ENST00000527527 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.38e-9■■■■□ 26.4
PITPNM1-210ENST00000527527 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
PITPNM1-210ENST00000527527 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.67■■■■□ 3.3
PITPNM1-210ENST00000527527 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.67■■■■□ 3.3
PITPNM1-210ENST00000527527 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa35.64■■■■□ 3.3
PITPNM1-210ENST00000527527 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
PITPNM1-210ENST00000527527 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.63■■■■□ 3.29
PITPNM1-210ENST00000527527 DEPDC5O75140 1603 aa35.62■■■■□ 3.29
PITPNM1-210ENST00000527527 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PITPNM1-210ENST00000527527 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
PITPNM1-210ENST00000527527 IQSEC2Q5JU85 1478 aa35.6■■■■□ 3.29
PITPNM1-210ENST00000527527 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.57■■■■□ 3.28
PITPNM1-210ENST00000527527 ADGRL2O95490 1459 aa35.55■■■■□ 3.28
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa35.55■■■■□ 3.28
PITPNM1-210ENST00000527527 KANK1Q14678 1352 aa35.51■■■■□ 3.28
PITPNM1-210ENST00000527527 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.49■■■■□ 3.27
PITPNM1-210ENST00000527527 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.48■■■■□ 3.27
PITPNM1-210ENST00000527527 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.48■■■■□ 3.27
PITPNM1-210ENST00000527527 MED14O60244 1454 aa35.48■■■■□ 3.27
PITPNM1-210ENST00000527527 LMTK2Q8IWU2 1503 aa35.46■■■■□ 3.27
PITPNM1-210ENST00000527527 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
PITPNM1-210ENST00000527527 IQGAP1P46940 1657 aa35.42■■■■□ 3.26
PITPNM1-210ENST00000527527 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.41■■■■□ 3.26
PITPNM1-210ENST00000527527 UBAP1LF5GYI3 381 aa35.39■■■■□ 3.26
PITPNM1-210ENST00000527527 CPS1P31327 1500 aa35.37■■■■□ 3.25
PITPNM1-210ENST00000527527 PIK3C2BO00750 1634 aa35.37■■■■□ 3.25
PITPNM1-210ENST00000527527 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.37■■■■□ 3.25
PITPNM1-210ENST00000527527 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
PITPNM1-210ENST00000527527 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.34■■■■□ 3.25
PITPNM1-210ENST00000527527 SLIT1O75093 1534 aa35.33■■■■□ 3.25
PITPNM1-210ENST00000527527 SYNMO15061 1565 aa35.33■■■■□ 3.25
PITPNM1-210ENST00000527527 LTKP29376 864 aa35.31■■■■□ 3.24
PITPNM1-210ENST00000527527 NOS1P29475 1434 aa35.3■■■■□ 3.24
PITPNM1-210ENST00000527527 IDI1Q13907 227 aa35.28■■■■□ 3.24
PITPNM1-210ENST00000527527 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.28■■■■□ 3.24
PITPNM1-210ENST00000527527 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.26■■■■□ 3.24
PITPNM1-210ENST00000527527 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.26■■■■□ 3.24
PITPNM1-210ENST00000527527 ROCK1Q13464 1354 aa35.25■■■■□ 3.23
PITPNM1-210ENST00000527527 ITGAEP38570 1179 aa35.24■■■■□ 3.23
PITPNM1-210ENST00000527527 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.24■■■■□ 3.23
PITPNM1-210ENST00000527527 UNC13BO14795 1591 aa35.23■■■■□ 3.23
PITPNM1-210ENST00000527527 TET3O43151 1660 aa35.21■■■■□ 3.23
PITPNM1-210ENST00000527527 EID1Q9Y6B2 187 aa35.2■■■■□ 3.23
PITPNM1-210ENST00000527527 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
PITPNM1-210ENST00000527527 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.19■■■■□ 3.22
PITPNM1-210ENST00000527527 ADGRB3O60242 1522 aa35.17■■■■□ 3.22
PITPNM1-210ENST00000527527 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.16■■■■□ 3.22
PITPNM1-210ENST00000527527 PIP4K2BP78356 416 aa35.15■■■■□ 3.22
PITPNM1-210ENST00000527527 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.14■■■■□ 3.22
PITPNM1-210ENST00000527527 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
PITPNM1-210ENST00000527527 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.13■■■■□ 3.21
PITPNM1-210ENST00000527527 TOM1O60784 492 aa35.12■■■■□ 3.21
PITPNM1-210ENST00000527527 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.12■■■■□ 3.21
PITPNM1-210ENST00000527527 ALKQ9UM73 1620 aa35.1■■■■□ 3.21
PITPNM1-210ENST00000527527 E9PCH4 1651 aa35.08■■■■□ 3.21
PITPNM1-210ENST00000527527 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.08■■■■□ 3.21
PITPNM1-210ENST00000527527 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.04■■■■□ 3.2
PITPNM1-210ENST00000527527 NUP155O75694 1391 aa35.03■■■■□ 3.2
PITPNM1-210ENST00000527527 HSPA1LP34931 641 aa35.02■■■■□ 3.2
PITPNM1-210ENST00000527527 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
PITPNM1-210ENST00000527527 SLC26A8Q96RN1 970 aa35.01■■■■□ 3.2
PITPNM1-210ENST00000527527 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa34.99■■■■□ 3.19
PITPNM1-210ENST00000527527 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP34.99■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms