RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525525.5

RPS6KA1-210, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, human

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 543 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS6KA1-210	ENST00000525525	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		41.35	■■■■■ 4.21
RPS6KA1-210	ENST00000525525	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.34	■■■■■ 4.21
RPS6KA1-210	ENST00000525525	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	41.33	■■■■■ 4.21
RPS6KA1-210	ENST00000525525	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.33	■■■■■ 4.21
RPS6KA1-210	ENST00000525525	STRC	Q7RTU9	1775 aa		41.31	■■■■■ 4.2
RPS6KA1-210	ENST00000525525	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.31	■■■■■ 4.2
RPS6KA1-210	ENST00000525525	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41.28	■■■■■ 4.2
RPS6KA1-210	ENST00000525525	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		41.28	■■■■■ 4.2
RPS6KA1-210	ENST00000525525	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	41.25	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		41.25	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	41.23	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		41.23	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		41.22	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	PZP	P20742	1482 aa		41.21	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	41.2	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	41.2	■■■■■ 4.19
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		41.19	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		41.18	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		41.18	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	41.17	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	41.17	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		41.16	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ABCC3	O15438	1527 aa		41.16	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NCOA1	Q15788	1441 aa		41.14	■■■■■ 4.18
RPS6KA1-210	ENST00000525525	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	41.13	■■■■■ 4.17
RPS6KA1-210	ENST00000525525	TNR	Q92752	1358 aa		41.12	■■■■■ 4.17
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CEP152	O94986	1710 aa		41.1	■■■■■ 4.17
RPS6KA1-210	ENST00000525525	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		41.09	■■■■■ 4.17
RPS6KA1-210	ENST00000525525	PTPRT	O14522	1441 aa		41.08	■■■■■ 4.17
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ADGRL2	O95490	1459 aa		41.08	■■■■■ 4.17
RPS6KA1-210	ENST00000525525	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	41.04	■■■■■ 4.16
RPS6KA1-210	ENST00000525525	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	41.02	■■■■■ 4.16
RPS6KA1-210	ENST00000525525	DEPDC5	O75140	1603 aa		41.02	■■■■■ 4.16
RPS6KA1-210	ENST00000525525	PLA2R1	Q13018	1463 aa		41.02	■■■■■ 4.16
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.99	■■■■■ 4.15
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.98	■■■■■ 4.15
RPS6KA1-210	ENST00000525525	PKD2	Q13563	968 aa		40.97	■■■■■ 4.15
RPS6KA1-210	ENST00000525525	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.97	■■■■■ 4.15
RPS6KA1-210	ENST00000525525	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.96	■■■■■ 4.15
RPS6KA1-210	ENST00000525525	KANK1	Q14678	1352 aa		40.95	■■■■■ 4.15
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.95	■■■■■ 4.15
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.94	■■■■■ 4.14
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.93	■■■■■ 4.14
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.89	■■■■■ 4.14
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.89	■■■■■ 4.14
RPS6KA1-210	ENST00000525525	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.86	■■■■■ 4.13
RPS6KA1-210	ENST00000525525	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.86	■■■■■ 4.13
RPS6KA1-210	ENST00000525525	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.85	■■■■■ 4.13
RPS6KA1-210	ENST00000525525	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.85	■■■■■ 4.13
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ITGAE	P38570	1179 aa		40.82	■■■■■ 4.13
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.82	■■■■■ 4.12
RPS6KA1-210	ENST00000525525	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.82	■■■■■ 4.12
RPS6KA1-210	ENST00000525525	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.75	■■■■■ 4.11
RPS6KA1-210	ENST00000525525	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.75	■■■■■ 4.11
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.7	■■■■■ 4.11
RPS6KA1-210	ENST00000525525	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.7	■■■■■ 4.11
RPS6KA1-210	ENST00000525525	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.68	■■■■■ 4.1
RPS6KA1-210	ENST00000525525	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.68	■■■■■ 4.1
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
RPS6KA1-210	ENST00000525525	UNC13B	O14795	1591 aa		40.65	■■■■■ 4.1
RPS6KA1-210	ENST00000525525	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.6	■■■■■ 4.09
RPS6KA1-210	ENST00000525525	TET3	O43151	1660 aa		40.59	■■■■■ 4.09
RPS6KA1-210	ENST00000525525	MED14	O60244	1454 aa		40.59	■■■■■ 4.09
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NOS1	P29475	1434 aa		40.59	■■■■■ 4.09
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.58	■■■■■ 4.09
RPS6KA1-210	ENST00000525525	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.57	■■■■■ 4.08
RPS6KA1-210	ENST00000525525	SYNM	O15061	1565 aa		40.57	■■■■■ 4.08
RPS6KA1-210	ENST00000525525	IDI1	Q13907	227 aa		40.56	■■■■■ 4.08
RPS6KA1-210	ENST00000525525	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.55	■■■■■ 4.08
RPS6KA1-210	ENST00000525525	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.53	■■■■■ 4.08
RPS6KA1-210	ENST00000525525	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.51	■■■■■ 4.08
RPS6KA1-210	ENST00000525525	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.51	■■■■■ 4.08
RPS6KA1-210	ENST00000525525	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.5	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	SLIT1	O75093	1534 aa		40.5	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.5	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.49	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.48	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NUP155	O75694	1391 aa		40.48	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.47	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40.47	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525	LTK	P29376	864 aa		40.46	■■■■■ 4.07
RPS6KA1-210	ENST00000525525		E9PCH4	1651 aa		40.44	■■■■■ 4.06
RPS6KA1-210	ENST00000525525	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.43	■■■■■ 4.06
RPS6KA1-210	ENST00000525525	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.42	■■■■■ 4.06
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.37	■■■■■ 4.05
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CPS1	P31327	1500 aa		40.37	■■■■■ 4.05
RPS6KA1-210	ENST00000525525	NAIP	Q13075	1403 aa		40.36	■■■■■ 4.05
RPS6KA1-210	ENST00000525525	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		40.29	■■■■■ 4.04
RPS6KA1-210	ENST00000525525	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		40.25	■■■■■ 4.03
RPS6KA1-210	ENST00000525525	HFM1	A2PYH4	1435 aa		40.25	■■■■■ 4.03
RPS6KA1-210	ENST00000525525	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		40.24	■■■■■ 4.03
RPS6KA1-210	ENST00000525525	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		40.23	■■■■■ 4.03
RPS6KA1-210	ENST00000525525	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	40.2	■■■■■ 4.03
RPS6KA1-210	ENST00000525525	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	40.15	■■■■■ 4.02
RPS6KA1-210	ENST00000525525	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		40.15	■■■■■ 4.02
RPS6KA1-210	ENST00000525525	ZFYVE9	O95405	1425 aa		40.15	■■■■■ 4.02
RPS6KA1-210	ENST00000525525	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		40.14	■■■■■ 4.02
RPS6KA1-210	ENST00000525525	TRIM52	Q96A61	297 aa		40.13	■■■■■ 4.01
RPS6KA1-210	ENST00000525525	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		40.11	■■■■■ 4.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms