RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.37■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.37■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 PTPRTO14522 1441 aa25.37■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.35■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 NCOA1Q15788 1441 aa25.35■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.33■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HACE1-211ENST00000521962 MROH2AA6NES4 1674 aa25.32■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.32■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.31■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.31■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.31■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 ERBINQ96RT1 1412 aa25.3■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 KIF3BO15066 747 aa25.29■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 GGT6Q6P531 493 aa25.27■■□□□ 1.64
HACE1-211ENST00000521962 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 NPATQ14207 1427 aa25.26■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 ROCK1Q13464 1354 aa25.25■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.24■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.24■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.23■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 DEPDC5O75140 1603 aa25.23■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 ITGAEP38570 1179 aa25.22■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
HACE1-211ENST00000521962 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.19■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 ABCC3O15438 1527 aa25.19■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.19■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.19■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 ZMYM3Q14202 1370 aa25.18■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.16■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.15■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.14■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 ILDR2Q71H61 639 aa25.14■■□□□ 1.62
HACE1-211ENST00000521962 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.13■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 CEP152O94986 1710 aa25.12■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 PLA2R1Q13018 1463 aa25.12■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.11■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 UNC13BO14795 1591 aa25.1■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 PZPP20742 1482 aa25.1■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.09■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 NAIPQ13075 1403 aa25.08■■□□□ 1.61
HACE1-211ENST00000521962 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.07■■□□□ 1.6
HACE1-211ENST00000521962 HFM1A2PYH4 1435 aa25.05■■□□□ 1.6
HACE1-211ENST00000521962 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
HACE1-211ENST00000521962 SOCS7O14512 581 aa25.02■■□□□ 1.6
HACE1-211ENST00000521962 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.02■■□□□ 1.6
HACE1-211ENST00000521962 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 KANK1Q14678 1352 aa25.01■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 ERVK-7P63135 1459 aa24.99■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 PKD2Q13563 968 aa24.98■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.97■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.96■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 TNRQ92752 1358 aa24.95■■□□□ 1.59
HACE1-211ENST00000521962 TET3O43151 1660 aa24.94■■□□□ 1.58
HACE1-211ENST00000521962 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.92■■□□□ 1.58
HACE1-211ENST00000521962 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
HACE1-211ENST00000521962 NUP155O75694 1391 aa24.9■■□□□ 1.58
HACE1-211ENST00000521962 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
HACE1-211ENST00000521962 NLRP1Q9C000 1473 aa24.87■■□□□ 1.57
HACE1-211ENST00000521962 SYNMO15061 1565 aa24.87■■□□□ 1.57
HACE1-211ENST00000521962 E9PCH4 1651 aa24.87■■□□□ 1.57
HACE1-211ENST00000521962 NOS1P29475 1434 aa24.86■■□□□ 1.57
HACE1-211ENST00000521962 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.86■■□□□ 1.57
HACE1-211ENST00000521962 CPS1P31327 1500 aa24.81■■□□□ 1.56
HACE1-211ENST00000521962 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HACE1-211ENST00000521962 SETD5Q9C0A6 1442 aa24.8■■□□□ 1.56
HACE1-211ENST00000521962 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.78■■□□□ 1.56
HACE1-211ENST00000521962 PIK3C2BO00750 1634 aa24.76■■□□□ 1.55
HACE1-211ENST00000521962 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.75■■□□□ 1.55
HACE1-211ENST00000521962 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa24.75■■□□□ 1.55
HACE1-211ENST00000521962 MED14O60244 1454 aa24.75■■□□□ 1.55
HACE1-211ENST00000521962 ALKQ9UM73 1620 aa24.73■■□□□ 1.55
HACE1-211ENST00000521962 TRIM52Q96A61 297 aa24.72■■□□□ 1.55
HACE1-211ENST00000521962 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 ADGRB3O60242 1522 aa24.7■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.69■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 IDI1Q13907 227 aa24.69■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 IQGAP1P46940 1657 aa24.67■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 HSPA1LP34931 641 aa24.66■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 TRPM2O94759 1503 aa24.66■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.65■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.65■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 SLIT1O75093 1534 aa24.65■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.64■■□□□ 1.54
HACE1-211ENST00000521962 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.64■■□□□ 1.53
HACE1-211ENST00000521962 TOM1O60784 492 aa24.63■■□□□ 1.53
HACE1-211ENST00000521962 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.63■■□□□ 1.53
HACE1-211ENST00000521962 CLTCL1P53675 1640 aa24.62■■□□□ 1.53
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