RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520986.5

DENND3-215, Transcript of DENN domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene DENND3, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3-215ENST00000520986 NCOA1Q15788 1441 aa36.44■■■■□ 3.42
DENND3-215ENST00000520986 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.44■■■■□ 3.42
DENND3-215ENST00000520986 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
DENND3-215ENST00000520986 PTPRKQ15262 1439 aa36.42■■■■□ 3.42
DENND3-215ENST00000520986 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.42■■■■□ 3.42
DENND3-215ENST00000520986 ERBINQ96RT1 1412 aa36.4■■■■□ 3.42
DENND3-215ENST00000520986 ZMYM3Q14202 1370 aa36.4■■■■□ 3.42
DENND3-215ENST00000520986 LMTK3Q96Q04 1460 aa36.37■■■■□ 3.41
DENND3-215ENST00000520986 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.36■■■■□ 3.41
DENND3-215ENST00000520986 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.36■■■■□ 3.41
DENND3-215ENST00000520986 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.36■■■■□ 3.41
DENND3-215ENST00000520986 PREX1Q8TCU6 1659 aa36.31■■■■□ 3.4
DENND3-215ENST00000520986 ITGAEP38570 1179 aa36.3■■■■□ 3.4
DENND3-215ENST00000520986 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa36.3■■■■□ 3.4
DENND3-215ENST00000520986 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
DENND3-215ENST00000520986 ROCK1Q13464 1354 aa36.27■■■■□ 3.4
DENND3-215ENST00000520986 DEPDC5O75140 1603 aa36.26■■■■□ 3.4
DENND3-215ENST00000520986 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
DENND3-215ENST00000520986 NPATQ14207 1427 aa36.25■■■■□ 3.39
DENND3-215ENST00000520986 ABCC3O15438 1527 aa36.25■■■■□ 3.39
DENND3-215ENST00000520986 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
DENND3-215ENST00000520986 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.22■■■■□ 3.39
DENND3-215ENST00000520986 CEP152O94986 1710 aa36.21■■■■□ 3.39
DENND3-215ENST00000520986 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.2■■■■□ 3.39
DENND3-215ENST00000520986 PZPP20742 1482 aa36.18■■■■□ 3.38
DENND3-215ENST00000520986 HSPA2P54652 639 aa36.16■■■■□ 3.38
DENND3-215ENST00000520986 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
DENND3-215ENST00000520986 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa36.14■■■■□ 3.38
DENND3-215ENST00000520986 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.11■■■■□ 3.37
DENND3-215ENST00000520986 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
DENND3-215ENST00000520986 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.11■■■■□ 3.37
DENND3-215ENST00000520986 KANK1Q14678 1352 aa36.1■■■■□ 3.37
DENND3-215ENST00000520986 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.04■■■■□ 3.36
DENND3-215ENST00000520986 UNC13BO14795 1591 aa36.04■■■■□ 3.36
DENND3-215ENST00000520986 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
DENND3-215ENST00000520986 TNRQ92752 1358 aa36.03■■■■□ 3.36
DENND3-215ENST00000520986 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa36.01■■■■□ 3.36
DENND3-215ENST00000520986 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa36■■■■□ 3.35
DENND3-215ENST00000520986 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
DENND3-215ENST00000520986 ERVK-7P63135 1459 aa35.99■■■■□ 3.35
DENND3-215ENST00000520986 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.97■■■■□ 3.35
DENND3-215ENST00000520986 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
DENND3-215ENST00000520986 NAIPQ13075 1403 aa35.96■■■■□ 3.35
DENND3-215ENST00000520986 EFCAB6Q5THR3 1501 aa35.94■■■■□ 3.34
DENND3-215ENST00000520986 A2ML1A8K2U0 1454 aa35.94■■■■□ 3.34
DENND3-215ENST00000520986 STRCQ7RTU9 1775 aa35.91■■■■□ 3.34
DENND3-215ENST00000520986 HFM1A2PYH4 1435 aa35.91■■■■□ 3.34
DENND3-215ENST00000520986 NLRP1Q9C000 1473 aa35.9■■■■□ 3.34
DENND3-215ENST00000520986 TET3O43151 1660 aa35.89■■■■□ 3.34
DENND3-215ENST00000520986 IQGAP3Q86VI3 1631 aa35.89■■■■□ 3.34
DENND3-215ENST00000520986 NUP155O75694 1391 aa35.84■■■■□ 3.33
DENND3-215ENST00000520986 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
DENND3-215ENST00000520986 PLA2R1Q13018 1463 aa35.8■■■■□ 3.32
DENND3-215ENST00000520986 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.79■■■■□ 3.32
DENND3-215ENST00000520986 NOS1P29475 1434 aa35.78■■■■□ 3.32
DENND3-215ENST00000520986 SYNMO15061 1565 aa35.77■■■■□ 3.32
DENND3-215ENST00000520986 E9PCH4 1651 aa35.77■■■■□ 3.32
DENND3-215ENST00000520986 UBR1Q8IWV7 1749 aa35.71■■■■□ 3.31
DENND3-215ENST00000520986 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
DENND3-215ENST00000520986 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.7■■■■□ 3.31
DENND3-215ENST00000520986 PIK3C2BO00750 1634 aa35.69■■■■□ 3.3
DENND3-215ENST00000520986 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
DENND3-215ENST00000520986 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.69■■■■□ 3.3
DENND3-215ENST00000520986 PTPRTO14522 1441 aa35.67■■■■□ 3.3
DENND3-215ENST00000520986 PKD2Q13563 968 aa35.66■■■■□ 3.3
DENND3-215ENST00000520986 IDI1Q13907 227 aa35.65■■■■□ 3.3
DENND3-215ENST00000520986 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
DENND3-215ENST00000520986 TRIM52Q96A61 297 aa35.62■■■■□ 3.29
DENND3-215ENST00000520986 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP35.6■■■■□ 3.29
DENND3-215ENST00000520986 SLC52A1Q9NWF4 448 aa35.6■■■■□ 3.29
DENND3-215ENST00000520986 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.59■■■■□ 3.29
DENND3-215ENST00000520986 SETD5Q9C0A6 1442 aa35.57■■■■□ 3.28
DENND3-215ENST00000520986 ANKLE2Q86XL3 938 aa35.56■■■■□ 3.28
DENND3-215ENST00000520986 ADGRB3O60242 1522 aa35.56■■■■□ 3.28
DENND3-215ENST00000520986 SLIT1O75093 1534 aa35.54■■■■□ 3.28
DENND3-215ENST00000520986 STAG3Q9UJ98 1225 aa35.54■■■■□ 3.28
DENND3-215ENST00000520986 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.54■■■■□ 3.28
DENND3-215ENST00000520986 ARHGAP23Q9P227 1491 aa35.54■■■■□ 3.28
DENND3-215ENST00000520986 FBXO41Q8TF61 875 aa35.5■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 MED14O60244 1454 aa35.48■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 TMEM2Q9UHN6 1383 aa35.48■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa35.47■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 MYO5BQ9ULV0 1848 aa35.47■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa35.46■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
DENND3-215ENST00000520986 LTKP29376 864 aa35.43■■■■□ 3.26
DENND3-215ENST00000520986 IQGAP1P46940 1657 aa35.43■■■■□ 3.26
DENND3-215ENST00000520986 TXNDC2Q86VQ3 553 aa35.42■■■■□ 3.26
DENND3-215ENST00000520986 TRPM2O94759 1503 aa35.42■■■■□ 3.26
DENND3-215ENST00000520986 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
DENND3-215ENST00000520986 CHGAP10645 457 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
DENND3-215ENST00000520986 EID1Q9Y6B2 187 aa35.38■■■■□ 3.25
DENND3-215ENST00000520986 CLTCL1P53675 1640 aa35.37■■■■□ 3.25
DENND3-215ENST00000520986 LTBP4Q8N2S1 1624 aa35.37■■■■□ 3.25
DENND3-215ENST00000520986 CERKQ8TCT0 537 aa35.37■■■■□ 3.25
DENND3-215ENST00000520986 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.37■■■■□ 3.25
DENND3-215ENST00000520986 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
DENND3-215ENST00000520986 ZFYVE9O95405 1425 aa35.33■■■■□ 3.25
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