RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520063.1

TMPRSS4-209, Transcript of transmembrane serine protease 4, humanhuman

TSL 3

Gene TMPRSS4, Length 354 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4-209ENST00000520063 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 PTPRTO14522 1441 aa25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 ABCC5O15440 1437 aa25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 NCOA1Q15788 1441 aa25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 FBXO41Q8TF61 875 aa25.05■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 PZPP20742 1482 aa25.04■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.03■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.02■■□□□ 1.6
TMPRSS4-209ENST00000520063 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 DAPK1P53355 1430 aa25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 PLA2R1Q13018 1463 aa25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa24.99■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 KIF15Q9NS87 1388 aa24.98■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 ERBINQ96RT1 1412 aa24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 ABCC3O15438 1527 aa24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 TNRQ92752 1358 aa24.96■■□□□ 1.59
TMPRSS4-209ENST00000520063 CERKQ8TCT0 537 aa24.94■■□□□ 1.58
TMPRSS4-209ENST00000520063 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
TMPRSS4-209ENST00000520063 PKD2Q13563 968 aa24.92■■□□□ 1.58
TMPRSS4-209ENST00000520063 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
TMPRSS4-209ENST00000520063 NLRP1Q9C000 1473 aa24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS4-209ENST00000520063 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.9■■□□□ 1.58
TMPRSS4-209ENST00000520063 ADGRL2O95490 1459 aa24.89■■□□□ 1.58
TMPRSS4-209ENST00000520063 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS4-209ENST00000520063 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.88■■□□□ 1.57
TMPRSS4-209ENST00000520063 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4-209ENST00000520063 DEPDC5O75140 1603 aa24.86■■□□□ 1.57
TMPRSS4-209ENST00000520063 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.85■■□□□ 1.57
TMPRSS4-209ENST00000520063 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.84■■□□□ 1.57
TMPRSS4-209ENST00000520063 ERVK-7P63135 1459 aa24.83■■□□□ 1.57
TMPRSS4-209ENST00000520063 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 CEP152O94986 1710 aa24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.8■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.79■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 KANK1Q14678 1352 aa24.77■■□□□ 1.56
TMPRSS4-209ENST00000520063 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.75■■□□□ 1.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 MED14O60244 1454 aa24.73■■□□□ 1.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.73■■□□□ 1.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 ROCK1Q13464 1354 aa24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.72■■□□□ 1.55
TMPRSS4-209ENST00000520063 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
TMPRSS4-209ENST00000520063 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TMPRSS4-209ENST00000520063 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.66■■□□□ 1.54
TMPRSS4-209ENST00000520063 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.65■■□□□ 1.54
TMPRSS4-209ENST00000520063 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TMPRSS4-209ENST00000520063 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.64■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 NOS1P29475 1434 aa24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 SLIT1O75093 1534 aa24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 UNC13BO14795 1591 aa24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 CPS1P31327 1500 aa24.6■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 IQGAP1P46940 1657 aa24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TMPRSS4-209ENST00000520063 SYNMO15061 1565 aa24.58■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 PIK3C2BO00750 1634 aa24.57■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 TET3O43151 1660 aa24.56■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 IDI1Q13907 227 aa24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.55■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.54■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 LTKP29376 864 aa24.52■■□□□ 1.52
TMPRSS4-209ENST00000520063 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4-209ENST00000520063 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.5■■□□□ 1.51
TMPRSS4-209ENST00000520063 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4-209ENST00000520063 ADGRB3O60242 1522 aa24.49■■□□□ 1.51
TMPRSS4-209ENST00000520063 EID1Q9Y6B2 187 aa24.48■■□□□ 1.51
TMPRSS4-209ENST00000520063 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.46■■□□□ 1.51
TMPRSS4-209ENST00000520063 ITGAEP38570 1179 aa24.44■■□□□ 1.5
TMPRSS4-209ENST00000520063 NUP155O75694 1391 aa24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4-209ENST00000520063 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.43■■□□□ 1.5
TMPRSS4-209ENST00000520063 E9PCH4 1651 aa24.42■■□□□ 1.5
TMPRSS4-209ENST00000520063 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.39■■□□□ 1.5
TMPRSS4-209ENST00000520063 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.39■■□□□ 1.49
TMPRSS4-209ENST00000520063 ZFYVE9O95405 1425 aa24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4-209ENST00000520063 NAIPQ13075 1403 aa24.38■■□□□ 1.49
TMPRSS4-209ENST00000520063 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.37■■□□□ 1.49
TMPRSS4-209ENST00000520063 TOM1O60784 492 aa24.35■■□□□ 1.49
TMPRSS4-209ENST00000520063 HFM1A2PYH4 1435 aa24.33■■□□□ 1.49
TMPRSS4-209ENST00000520063 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4-209ENST00000520063 ALKQ9UM73 1620 aa24.32■■□□□ 1.48
TMPRSS4-209ENST00000520063 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4-209ENST00000520063 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.31■■□□□ 1.48
TMPRSS4-209ENST00000520063 KCNA6P17658 529 aa24.28■■□□□ 1.48
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