RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519418.5

TBC1D31-208, Transcript of TBC1 domain family member 31, human

TSL 3

Gene TBC1D31, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D31-208	ENST00000519418	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		29.32	■■■□□ 2.28
TBC1D31-208	ENST00000519418	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	29.29	■■■□□ 2.28
TBC1D31-208	ENST00000519418	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
TBC1D31-208	ENST00000519418	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	29.27	■■■□□ 2.28
TBC1D31-208	ENST00000519418	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TBC1D31-208	ENST00000519418	MIA2	Q96PC5	1412 aa		29.27	■■■□□ 2.28
TBC1D31-208	ENST00000519418	TNR	Q92752	1358 aa		29.26	■■■□□ 2.28
TBC1D31-208	ENST00000519418	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		29.26	■■■□□ 2.27
TBC1D31-208	ENST00000519418	PZP	P20742	1482 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TBC1D31-208	ENST00000519418	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
TBC1D31-208	ENST00000519418	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		29.24	■■■□□ 2.27
TBC1D31-208	ENST00000519418	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TBC1D31-208	ENST00000519418	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		29.23	■■■□□ 2.27
TBC1D31-208	ENST00000519418	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.22	■■■□□ 2.27
TBC1D31-208	ENST00000519418	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TBC1D31-208	ENST00000519418	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
TBC1D31-208	ENST00000519418	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		29.17	■■■□□ 2.26
TBC1D31-208	ENST00000519418	APLP2	Q06481	763 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TBC1D31-208	ENST00000519418	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.15	■■■□□ 2.26
TBC1D31-208	ENST00000519418	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.12	■■■□□ 2.25
TBC1D31-208	ENST00000519418	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.1	■■■□□ 2.25
TBC1D31-208	ENST00000519418	ABCC5	O15440	1437 aa		29.09	■■■□□ 2.25
TBC1D31-208	ENST00000519418	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		29.08	■■■□□ 2.25
TBC1D31-208	ENST00000519418	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.07	■■■□□ 2.24
TBC1D31-208	ENST00000519418	ABCC3	O15438	1527 aa		29.06	■■■□□ 2.24
TBC1D31-208	ENST00000519418	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
TBC1D31-208	ENST00000519418	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		29.03	■■■□□ 2.24
TBC1D31-208	ENST00000519418	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.02	■■■□□ 2.24
TBC1D31-208	ENST00000519418	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.01	■■■□□ 2.24
TBC1D31-208	ENST00000519418	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	MED14	O60244	1454 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	ERVK-7	P63135	1459 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	DAPK1	P53355	1430 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TBC1D31-208	ENST00000519418	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	28.94	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	CPS1	P31327	1500 aa		28.91	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	TOM1	O60784	492 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	DEPDC5	O75140	1603 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TBC1D31-208	ENST00000519418	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TBC1D31-208	ENST00000519418	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TBC1D31-208	ENST00000519418	LTK	P29376	864 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TBC1D31-208	ENST00000519418	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TBC1D31-208	ENST00000519418	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TBC1D31-208	ENST00000519418	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TBC1D31-208	ENST00000519418	KANK1	Q14678	1352 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TBC1D31-208	ENST00000519418	PIP4K2B	P78356	416 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	CEP152	O94986	1710 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	HSPA1L	P34931	641 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	IDI1	Q13907	227 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.77	■■■□□ 2.2
TBC1D31-208	ENST00000519418	SLIT1	O75093	1534 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.76	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	SOCS7	O14512	581 aa		28.75	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	ADGRL2	O95490	1459 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.74	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		28.73	■■■□□ 2.19
TBC1D31-208	ENST00000519418	NOS1	P29475	1434 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TBC1D31-208	ENST00000519418	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.69	■■■□□ 2.18
TBC1D31-208	ENST00000519418	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		28.68	■■■□□ 2.18
TBC1D31-208	ENST00000519418	ALK	Q9UM73	1620 aa		28.67	■■■□□ 2.18
TBC1D31-208	ENST00000519418	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		28.65	■■■□□ 2.18
TBC1D31-208	ENST00000519418	PIK3C2B	O00750	1634 aa		28.63	■■■□□ 2.17
TBC1D31-208	ENST00000519418	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		28.6	■■■□□ 2.17
TBC1D31-208	ENST00000519418	SYNM	O15061	1565 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TBC1D31-208	ENST00000519418	KCNA6	P17658	529 aa		28.58	■■■□□ 2.17
TBC1D31-208	ENST00000519418	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		28.57	■■■□□ 2.16
TBC1D31-208	ENST00000519418	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
TBC1D31-208	ENST00000519418	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	28.54	■■■□□ 2.16
TBC1D31-208	ENST00000519418	ROCK1	Q13464	1354 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TBC1D31-208	ENST00000519418	TET3	O43151	1660 aa		28.53	■■■□□ 2.16
TBC1D31-208	ENST00000519418	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.49	■■■□□ 2.15
TBC1D31-208	ENST00000519418	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
TBC1D31-208	ENST00000519418	TMEM94	Q12767	1356 aa		28.49	■■■□□ 2.15
TBC1D31-208	ENST00000519418	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
TBC1D31-208	ENST00000519418	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.47	■■■□□ 2.15
TBC1D31-208	ENST00000519418	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	28.46	■■■□□ 2.15
TBC1D31-208	ENST00000519418	BCAN	Q96GW7	911 aa		28.45	■■■□□ 2.14
TBC1D31-208	ENST00000519418	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.44	■■■□□ 2.14
TBC1D31-208	ENST00000519418	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms