RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514354.5

NHP2-206, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 3

Gene NHP2, Length 472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-206ENST00000514354 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.23■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 TSPY4P0CV99 314 aa23.22■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 TSPY10P0CW01 314 aa23.22■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 TNRQ92752 1358 aa23.21■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.21■■□□□ 1.31
NHP2-206ENST00000514354 SOCS7O14512 581 aa23.18■■□□□ 1.3
NHP2-206ENST00000514354 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.16■■□□□ 1.3
NHP2-206ENST00000514354 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
NHP2-206ENST00000514354 PZPP20742 1482 aa23.15■■□□□ 1.3
NHP2-206ENST00000514354 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.14■■□□□ 1.3
NHP2-206ENST00000514354 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.14■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 MIA2Q96PC5 1412 aa23.12■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.12■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.12■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.09■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.09■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.09■■□□□ 1.29
NHP2-206ENST00000514354 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.08■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 NLRP1Q9C000 1473 aa23.07■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 PIP4K2BP78356 416 aa23.07■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 TOM1O60784 492 aa23.06■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.05■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.04■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.03■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 CPS1P31327 1500 aa23.03■■□□□ 1.28
NHP2-206ENST00000514354 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
NHP2-206ENST00000514354 HSPA1LP34931 641 aa23■■□□□ 1.27
NHP2-206ENST00000514354 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
NHP2-206ENST00000514354 MED14O60244 1454 aa22.98■■□□□ 1.27
NHP2-206ENST00000514354 ABCC3O15438 1527 aa22.98■■□□□ 1.27
NHP2-206ENST00000514354 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.97■■□□□ 1.27
NHP2-206ENST00000514354 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.97■■□□□ 1.27
NHP2-206ENST00000514354 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 MAP3K1Q13233 1512 aa22.94■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.93■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 ERVK-7P63135 1459 aa22.93■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 DEPDC5O75140 1603 aa22.92■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.91■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 APLP2Q06481 763 aa22.9■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.9■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NHP2-206ENST00000514354 KIF15Q9NS87 1388 aa22.89■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.258e-7■□□□□ 9.2
NHP2-206ENST00000514354 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.86■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.86■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 IQGAP1P46940 1657 aa22.86■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 ABCC5O15440 1437 aa22.85■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 LTKP29376 864 aa22.84■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.83■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 EID1Q9Y6B2 187 aa22.83■■□□□ 1.25
NHP2-206ENST00000514354 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.82■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 ERBINQ96RT1 1412 aa22.82■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.81■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 KANK1Q14678 1352 aa22.79■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.79■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 CEP152O94986 1710 aa22.79■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 ALKQ9UM73 1620 aa22.79■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 DAPK1P53355 1430 aa22.78■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.77■■□□□ 1.24
NHP2-206ENST00000514354 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.76■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 SLIT1O75093 1534 aa22.76■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.75■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.75■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.74■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.74■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.73■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 IDI1Q13907 227 aa22.73■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 SYNMO15061 1565 aa22.72■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
NHP2-206ENST00000514354 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.69■■□□□ 1.22
NHP2-206ENST00000514354 SLC26A8Q96RN1 970 aa22.66■■□□□ 1.22
NHP2-206ENST00000514354 PIK3C2BO00750 1634 aa22.66■■□□□ 1.22
NHP2-206ENST00000514354 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.66■■□□□ 1.22
NHP2-206ENST00000514354 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
NHP2-206ENST00000514354 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.65■■□□□ 1.22
NHP2-206ENST00000514354 KCNA6P17658 529 aa22.64■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 BCANQ96GW7 911 aa22.63■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.63■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 TMEM94Q12767 1356 aa22.63■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 NOS1P29475 1434 aa22.61■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.58■■□□□ 1.21
NHP2-206ENST00000514354 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.57■■□□□ 1.2
NHP2-206ENST00000514354 ADGRL2O95490 1459 aa22.56■■□□□ 1.2
NHP2-206ENST00000514354 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
NHP2-206ENST00000514354 TET3O43151 1660 aa22.55■■□□□ 1.2
NHP2-206ENST00000514354 ADGRB3O60242 1522 aa22.54■■□□□ 1.2
NHP2-206ENST00000514354 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
NHP2-206ENST00000514354 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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