RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 FLIIQ13045 1269 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.69□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 CLCN1P35523 988 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.68□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 PHOX2BQ99453 314 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.66□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PGGT1B-205ENST00000514178 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.65□□□□□ -0.06
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PGGT1B-205ENST00000514178 JPH4Q96JJ6 628 aa14.61□□□□□ -0.07
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PGGT1B-205ENST00000514178 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PGGT1B-205ENST00000514178 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.59□□□□□ -0.07
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PGGT1B-205ENST00000514178 PADI6Q6TGC4 694 aa14.55□□□□□ -0.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 NLRP7Q8WX94 980 aa14.54□□□□□ -0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.54□□□□□ -0.08
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PGGT1B-205ENST00000514178 ARID3AQ99856 593 aa14.53□□□□□ -0.08
PGGT1B-205ENST00000514178 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.52□□□□□ -0.09
PGGT1B-205ENST00000514178 ADGRG1Q9Y653 693 aa14.52□□□□□ -0.09
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZDHHC16Q969W1 377 aa14.49□□□□□ -0.09
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF454Q8N9F8 522 aa14.48□□□□□ -0.09
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PGGT1B-205ENST00000514178 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.45□□□□□ -0.1
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PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT7P0C024 238 aa14.42□□□□□ -0.1
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PGGT1B-205ENST00000514178 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.33□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 POM121Q96HA1 1249 aa14.33□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM198AQ9UFP1 575 aa14.33□□□□□ -0.12
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PGGT1B-205ENST00000514178 GPR153Q6NV75 609 aa14.32□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa14.32□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 RIMBP2O15034 1052 aa14.31□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 RCCD1A6NED2 376 aa14.3□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 SPDYE5A6NIY4 337 aa14.3□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEHQ6S545 545 aa14.3□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 RAD21O60216 631 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 COL9A1P20849 921 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 RFC5P40937 340 aa14.29□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 EYA1Q99502 592 aa14.29□□□□□ -0.12
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PGGT1B-205ENST00000514178 LHX6Q9UPM6 363 aa14.28□□□□□ -0.12
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.27□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 POTEJP0CG39 1038 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 CD46P15529 392 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 BANK1Q8NDB2 785 aa14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.25□□□□□ -0.13
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PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 TSKSQ9UJT2 592 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 COG6Q9Y2V7 657 aa14.24□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.23□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 C3orf80F5H4A9 247 aa14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
PGGT1B-205ENST00000514178 NUDT18Q6ZVK8 323 aa14.22□□□□□ -0.13
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