RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		28.03	■■■□□ 2.08
SPATA20-223	ENST00000513618	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SPATA20-223	ENST00000513618	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.01	■■■□□ 2.08
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
SPATA20-223	ENST00000513618	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		28	■■■□□ 2.07
SPATA20-223	ENST00000513618	PZP	P20742	1482 aa		28	■■■□□ 2.07
SPATA20-223	ENST00000513618	TNR	Q92752	1358 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SPATA20-223	ENST00000513618	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SPATA20-223	ENST00000513618	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
SPATA20-223	ENST00000513618	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		27.97	■■■□□ 2.07
SPATA20-223	ENST00000513618	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
SPATA20-223	ENST00000513618	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.93	■■■□□ 2.06
SPATA20-223	ENST00000513618	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SPATA20-223	ENST00000513618	NLRP1	Q9C000	1473 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SPATA20-223	ENST00000513618	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SPATA20-223	ENST00000513618	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		27.89	■■■□□ 2.06
SPATA20-223	ENST00000513618	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		27.89	■■■□□ 2.05
SPATA20-223	ENST00000513618	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SPATA20-223	ENST00000513618	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SPATA20-223	ENST00000513618	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SPATA20-223	ENST00000513618	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SPATA20-223	ENST00000513618	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SPATA20-223	ENST00000513618	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	CPS1	P31327	1500 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF2AK4	Q9P2K8	1649 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	ABCC3	O15438	1527 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	ILDR2	Q71H61	639 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	MED14	O60244	1454 aa		27.76	■■■□□ 2.04
SPATA20-223	ENST00000513618	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SPATA20-223	ENST00000513618	DEPDC5	O75140	1603 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SPATA20-223	ENST00000513618	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SPATA20-223	ENST00000513618	ERVK-7	P63135	1459 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SPATA20-223	ENST00000513618	SOCS7	O14512	581 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SPATA20-223	ENST00000513618	TOM1	O60784	492 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SPATA20-223	ENST00000513618	APLP2	Q06481	763 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SPATA20-223	ENST00000513618	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SPATA20-223	ENST00000513618	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SPATA20-223	ENST00000513618	KIF15	Q9NS87	1388 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SPATA20-223	ENST00000513618	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SPATA20-223	ENST00000513618	ABCC5	O15440	1437 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SPATA20-223	ENST00000513618	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SPATA20-223	ENST00000513618	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	IQGAP1	P46940	1657 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	PIP4K2B	P78356	416 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	CEP152	O94986	1710 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	DAPK1	P53355	1430 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	HSPA1L	P34931	641 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SPATA20-223	ENST00000513618	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.58	■■■□□ 2
SPATA20-223	ENST00000513618	KANK1	Q14678	1352 aa		27.57	■■■□□ 2
SPATA20-223	ENST00000513618	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
SPATA20-223	ENST00000513618	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		27.55	■■■□□ 2
SPATA20-223	ENST00000513618	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		27.54	■■■□□ 2
SPATA20-223	ENST00000513618	SLIT1	O75093	1534 aa		27.53	■■■□□ 2
SPATA20-223	ENST00000513618	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		27.53	■■■□□ 2
SPATA20-223	ENST00000513618	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	27.53	■■■□□ 2	1e-7	■■□□□ 13.2
SPATA20-223	ENST00000513618	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	EID1	Q9Y6B2	187 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		27.51	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	SYNM	O15061	1565 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	LTK	P29376	864 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		27.46	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		27.46	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	ALK	Q9UM73	1620 aa		27.45	■■□□□ 1.99
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		27.45	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.45	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	27.43	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	PIK3C2B	O00750	1634 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	27.4	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	ADGRL2	O95490	1459 aa		27.4	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	IDI1	Q13907	227 aa		27.39	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		27.39	■■□□□ 1.98
SPATA20-223	ENST00000513618	NOS1	P29475	1434 aa		27.36	■■□□□ 1.97
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		27.35	■■□□□ 1.97
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
SPATA20-223	ENST00000513618	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		27.32	■■□□□ 1.96
SPATA20-223	ENST00000513618	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96
SPATA20-223	ENST00000513618	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
SPATA20-223	ENST00000513618	KCNA6	P17658	529 aa		27.29	■■□□□ 1.96
SPATA20-223	ENST00000513618	ADGRB3	O60242	1522 aa		27.28	■■□□□ 1.96
SPATA20-223	ENST00000513618	TET3	O43151	1660 aa		27.26	■■□□□ 1.95
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.24	■■□□□ 1.95
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		27.24	■■□□□ 1.95
SPATA20-223	ENST00000513618	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	27.24	■■□□□ 1.95
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		27.23	■■□□□ 1.95
SPATA20-223	ENST00000513618	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	27.22	■■□□□ 1.95
SPATA20-223	ENST00000513618	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.21	■■□□□ 1.95
SPATA20-223	ENST00000513618	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	27.2	■■□□□ 1.94
SPATA20-223	ENST00000513618	BCAN	Q96GW7	911 aa		27.19	■■□□□ 1.94

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