RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 HSPA2P54652 639 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.1■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF3BO15066 747 aa29.08■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 STRCQ7RTU9 1775 aa29.08■■■□□ 2.25
SH3BP2-218ENST00000511185 DEPDC5O75140 1603 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ZMYM3Q14202 1370 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.07■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF15Q9NS87 1388 aa29.06■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.05■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCC3O15438 1527 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRKQ15262 1439 aa29.04■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 NPATQ14207 1427 aa29.03■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRL2O95490 1459 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-218ENST00000511185 ERBINQ96RT1 1412 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-218ENST00000511185 PZPP20742 1482 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-218ENST00000511185 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-218ENST00000511185 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.95■■■□□ 2.22
SH3BP2-218ENST00000511185 NCOA1Q15788 1441 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.94■■■□□ 2.22
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.92■■■□□ 2.22
SH3BP2-218ENST00000511185 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.89■■■□□ 2.21
SH3BP2-218ENST00000511185 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.88■■■□□ 2.21
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.87■■■□□ 2.21
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
SH3BP2-218ENST00000511185 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC13BO14795 1591 aa28.83■■■□□ 2.21
SH3BP2-218ENST00000511185 TNRQ92752 1358 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP2-218ENST00000511185 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
SH3BP2-218ENST00000511185 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVK-7P63135 1459 aa28.82■■■□□ 2.2
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.78■■■□□ 2.2
SH3BP2-218ENST00000511185 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.78■■■□□ 2.2
SH3BP2-218ENST00000511185 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.78■■■□□ 2.2
SH3BP2-218ENST00000511185 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.77■■■□□ 2.22e-6■□□□□ 10.9
SH3BP2-218ENST00000511185 GCC2Q8IWJ2 1684 aa28.75■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 UBR1Q8IWV7 1749 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2R1Q13018 1463 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 ROCK1Q13464 1354 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 TET3O43151 1660 aa28.74■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGAEP38570 1179 aa28.73■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.191e-7■□□□□ 10.8
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP1Q9C000 1473 aa28.72■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.71■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.7■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.7■■■□□ 2.19
SH3BP2-218ENST00000511185 SYNMO15061 1565 aa28.7■■■□□ 2.18
SH3BP2-218ENST00000511185 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.7■■■□□ 2.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PIK3C2BO00750 1634 aa28.69■■■□□ 2.18
SH3BP2-218ENST00000511185 KANK1Q14678 1352 aa28.68■■■□□ 2.18
SH3BP2-218ENST00000511185 E9PCH4 1651 aa28.67■■■□□ 2.18
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRTO14522 1441 aa28.65■■■□□ 2.18
SH3BP2-218ENST00000511185 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.62■■■□□ 2.17
SH3BP2-218ENST00000511185 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 LTBP4Q8N2S1 1624 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 IQGAP1P46940 1657 aa28.57■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 NOS1P29475 1434 aa28.55■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.53■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 NAIPQ13075 1403 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ADGRB3O60242 1522 aa28.52■■■□□ 2.16
SH3BP2-218ENST00000511185 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP2-218ENST00000511185 PKD2Q13563 968 aa28.49■■■□□ 2.15
SH3BP2-218ENST00000511185 SLIT1O75093 1534 aa28.48■■■□□ 2.15
SH3BP2-218ENST00000511185 ARHGAP23Q9P227 1491 aa28.46■■■□□ 2.15
SH3BP2-218ENST00000511185 HFM1A2PYH4 1435 aa28.45■■■□□ 2.15
SH3BP2-218ENST00000511185 MED14O60244 1454 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.45■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 NUP155O75694 1391 aa28.43■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.42■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 CERKQ8TCT0 537 aa28.4■■■□□ 2.14
SH3BP2-218ENST00000511185 IDI1Q13907 227 aa28.36■■■□□ 2.13
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKLE2Q86XL3 938 aa28.35■■■□□ 2.13
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXO41Q8TF61 875 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM2Q9UHN6 1383 aa28.33■■■□□ 2.13
SH3BP2-218ENST00000511185 CLTCL1P53675 1640 aa28.32■■■□□ 2.12
SH3BP2-218ENST00000511185 LTKP29376 864 aa28.3■■■□□ 2.12
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPM2O94759 1503 aa28.28■■■□□ 2.12
SH3BP2-218ENST00000511185 IQSEC2Q5JU85 1478 aa28.27■■■□□ 2.12
SH3BP2-218ENST00000511185 STAG3Q9UJ98 1225 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2-218ENST00000511185 ZFYVE9O95405 1425 aa28.26■■■□□ 2.11
SH3BP2-218ENST00000511185 CPS1P31327 1500 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-218ENST00000511185 KIF1BO60333 1816 aa28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-218ENST00000511185 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
SH3BP2-218ENST00000511185 TXNDC2Q86VQ3 553 aa28.22■■■□□ 2.11
SH3BP2-218ENST00000511185 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.18■■■□□ 2.1
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM52Q96A61 297 aa28.15■■■□□ 2.1
SH3BP2-218ENST00000511185 EID1Q9Y6B2 187 aa28.15■■■□□ 2.1
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