RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511078.1

NHP2-205, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NHP2, Length 475 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-205ENST00000511078 PTPRKQ15262 1439 aa26.02■■□□□ 1.76
NHP2-205ENST00000511078 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
NHP2-205ENST00000511078 KIF3BO15066 747 aa26.01■■□□□ 1.75
NHP2-205ENST00000511078 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
NHP2-205ENST00000511078 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
NHP2-205ENST00000511078 ABCC5O15440 1437 aa25.97■■□□□ 1.75
NHP2-205ENST00000511078 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.96■■□□□ 1.75
NHP2-205ENST00000511078 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
NHP2-205ENST00000511078 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 DAPK1P53355 1430 aa25.95■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 PZPP20742 1482 aa25.94■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 NCOA1Q15788 1441 aa25.94■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.93■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.92■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 KIF15Q9NS87 1388 aa25.91■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 ABCC3O15438 1527 aa25.9■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.89■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.89■■□□□ 1.74
NHP2-205ENST00000511078 ERBINQ96RT1 1412 aa25.88■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 PTPRTO14522 1441 aa25.88■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.85■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 PLA2R1Q13018 1463 aa25.85■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 TNRQ92752 1358 aa25.84■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 CEP152O94986 1710 aa25.84■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 FBXO41Q8TF61 875 aa25.83■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 DEPDC5O75140 1603 aa25.83■■□□□ 1.73
NHP2-205ENST00000511078 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.81■■□□□ 1.72
NHP2-205ENST00000511078 ADGRL2O95490 1459 aa25.8■■□□□ 1.72
NHP2-205ENST00000511078 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
NHP2-205ENST00000511078 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.79■■□□□ 1.72
NHP2-205ENST00000511078 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.78■■□□□ 1.72
NHP2-205ENST00000511078 NLRP1Q9C000 1473 aa25.78■■□□□ 1.72
NHP2-205ENST00000511078 ERVK-7P63135 1459 aa25.75■■□□□ 1.71
NHP2-205ENST00000511078 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NHP2-205ENST00000511078 CERKQ8TCT0 537 aa25.74■■□□□ 1.71
NHP2-205ENST00000511078 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.73■■□□□ 1.71
NHP2-205ENST00000511078 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
NHP2-205ENST00000511078 PKD2Q13563 968 aa25.72■■□□□ 1.71
NHP2-205ENST00000511078 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.71■■□□□ 1.71
NHP2-205ENST00000511078 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.7■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.7■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.69■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.69■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.68■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.68■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 KANK1Q14678 1352 aa25.67■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
NHP2-205ENST00000511078 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.63■■□□□ 1.69
NHP2-205ENST00000511078 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.62■■□□□ 1.698e-7■□□□□ 9.2
NHP2-205ENST00000511078 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.62■■□□□ 1.69
NHP2-205ENST00000511078 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
NHP2-205ENST00000511078 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.61■■□□□ 1.69
NHP2-205ENST00000511078 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.6■■□□□ 1.69
NHP2-205ENST00000511078 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
NHP2-205ENST00000511078 ROCK1Q13464 1354 aa25.58■■□□□ 1.69
NHP2-205ENST00000511078 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 UNC13BO14795 1591 aa25.56■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 MED14O60244 1454 aa25.55■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.54■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 IQGAP1P46940 1657 aa25.53■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 SYNMO15061 1565 aa25.52■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 PIK3C2BO00750 1634 aa25.52■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 TET3O43151 1660 aa25.52■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
NHP2-205ENST00000511078 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.49■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 SLIT1O75093 1534 aa25.49■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 NOS1P29475 1434 aa25.49■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.48■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.45■■□□□ 1.67
NHP2-205ENST00000511078 CPS1P31327 1500 aa25.45■■□□□ 1.66
NHP2-205ENST00000511078 ADGRB3O60242 1522 aa25.43■■□□□ 1.66
NHP2-205ENST00000511078 ITGAEP38570 1179 aa25.43■■□□□ 1.66
NHP2-205ENST00000511078 E9PCH4 1651 aa25.39■■□□□ 1.66
NHP2-205ENST00000511078 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.39■■□□□ 1.65
NHP2-205ENST00000511078 IDI1Q13907 227 aa25.38■■□□□ 1.65
NHP2-205ENST00000511078 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.35■■□□□ 1.65
NHP2-205ENST00000511078 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.35■■□□□ 1.65
NHP2-205ENST00000511078 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.35■■□□□ 1.65
NHP2-205ENST00000511078 LTKP29376 864 aa25.34■■□□□ 1.65
NHP2-205ENST00000511078 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.33■■□□□ 1.65
NHP2-205ENST00000511078 NUP155O75694 1391 aa25.32■■□□□ 1.64
NHP2-205ENST00000511078 EID1Q9Y6B2 187 aa25.32■■□□□ 1.64
NHP2-205ENST00000511078 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.32■■□□□ 1.64
NHP2-205ENST00000511078 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.3■■□□□ 1.64
NHP2-205ENST00000511078 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.28■■□□□ 1.64
NHP2-205ENST00000511078 NAIPQ13075 1403 aa25.28■■□□□ 1.64
NHP2-205ENST00000511078 ZFYVE9O95405 1425 aa25.25■■□□□ 1.63
NHP2-205ENST00000511078 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.25■■□□□ 1.63
NHP2-205ENST00000511078 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.23■■□□□ 1.63
NHP2-205ENST00000511078 HFM1A2PYH4 1435 aa25.23■■□□□ 1.63
NHP2-205ENST00000511078 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.19■■□□□ 1.62
NHP2-205ENST00000511078 ALKQ9UM73 1620 aa25.19■■□□□ 1.62
NHP2-205ENST00000511078 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NHP2-205ENST00000511078 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.16■■□□□ 1.62
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