RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510195.1

SNF8-208, Transcript of SNF8, ESCRT-II complex subunit, humanhuman

TSL 2

Gene SNF8, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8-208ENST00000510195 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.8■■■■■ 4.28
SNF8-208ENST00000510195 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.8■■■■■ 4.28
SNF8-208ENST00000510195 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.79■■■■■ 4.28
SNF8-208ENST00000510195 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.78■■■■■ 4.28
SNF8-208ENST00000510195 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
SNF8-208ENST00000510195 PLA2R1Q13018 1463 aa41.72■■■■■ 4.27
SNF8-208ENST00000510195 PZPP20742 1482 aa41.72■■■■■ 4.27
SNF8-208ENST00000510195 PKD2Q13563 968 aa41.69■■■■■ 4.26
SNF8-208ENST00000510195 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.67■■■■■ 4.26
SNF8-208ENST00000510195 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
SNF8-208ENST00000510195 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.67■■■■■ 4.26
SNF8-208ENST00000510195 TNRQ92752 1358 aa41.64■■■■■ 4.26
SNF8-208ENST00000510195 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.64■■■■■ 4.26
SNF8-208ENST00000510195 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.64■■■■■ 4.26
SNF8-208ENST00000510195 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.63■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.62■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.61■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.61■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 ABCC5O15440 1437 aa41.6■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
SNF8-208ENST00000510195 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.55■■■■■ 4.24
SNF8-208ENST00000510195 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.55■■■■■ 4.24
SNF8-208ENST00000510195 ABCC3O15438 1527 aa41.54■■■■■ 4.24
SNF8-208ENST00000510195 DAPK1P53355 1430 aa41.52■■■■■ 4.24
SNF8-208ENST00000510195 KIF15Q9NS87 1388 aa41.52■■■■■ 4.24
SNF8-208ENST00000510195 NLRP1Q9C000 1473 aa41.52■■■■■ 4.24
SNF8-208ENST00000510195 ERBINQ96RT1 1412 aa41.5■■■■■ 4.23
SNF8-208ENST00000510195 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.48■■■■■ 4.23
SNF8-208ENST00000510195 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.47■■■■■ 4.23
SNF8-208ENST00000510195 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.46■■■■■ 4.23
SNF8-208ENST00000510195 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
SNF8-208ENST00000510195 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.42■■■■■ 4.22
SNF8-208ENST00000510195 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.4■■■■■ 4.22
SNF8-208ENST00000510195 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.38■■■■■ 4.22
SNF8-208ENST00000510195 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.38■■■■■ 4.21
SNF8-208ENST00000510195 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.36■■■■■ 4.21
SNF8-208ENST00000510195 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SNF8-208ENST00000510195 ERVK-7P63135 1459 aa41.35■■■■■ 4.21
SNF8-208ENST00000510195 CEP152O94986 1710 aa41.34■■■■■ 4.21
SNF8-208ENST00000510195 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
SNF8-208ENST00000510195 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.34■■■■■ 4.21
SNF8-208ENST00000510195 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.33■■■■■ 4.213e-6■□□□□ 10.3
SNF8-208ENST00000510195 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.31■■■■■ 4.2
SNF8-208ENST00000510195 DEPDC5O75140 1603 aa41.3■■■■■ 4.2
SNF8-208ENST00000510195 KANK1Q14678 1352 aa41.28■■■■■ 4.2
SNF8-208ENST00000510195 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.28■■■■■ 4.2
SNF8-208ENST00000510195 ADGRL2O95490 1459 aa41.27■■■■■ 4.2
SNF8-208ENST00000510195 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
SNF8-208ENST00000510195 MED14O60244 1454 aa41.23■■■■■ 4.19
SNF8-208ENST00000510195 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.23■■■■■ 4.191e-6■■■■□ 20.4
SNF8-208ENST00000510195 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
SNF8-208ENST00000510195 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.18■■■■■ 4.18
SNF8-208ENST00000510195 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
SNF8-208ENST00000510195 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.16■■■■■ 4.18
SNF8-208ENST00000510195 CPS1P31327 1500 aa41.12■■■■■ 4.17
SNF8-208ENST00000510195 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.11■■■■■ 4.17
SNF8-208ENST00000510195 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.08■■■■■ 4.17
SNF8-208ENST00000510195 IQGAP1P46940 1657 aa41.06■■■■■ 4.16
SNF8-208ENST00000510195 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.04■■■■■ 4.16
SNF8-208ENST00000510195 SLIT1O75093 1534 aa41.02■■■■■ 4.16
SNF8-208ENST00000510195 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.02■■■■■ 4.16
SNF8-208ENST00000510195 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
SNF8-208ENST00000510195 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.98■■■■■ 4.15
SNF8-208ENST00000510195 ROCK1Q13464 1354 aa40.97■■■■■ 4.15
SNF8-208ENST00000510195 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
SNF8-208ENST00000510195 NOS1P29475 1434 aa40.95■■■■■ 4.15
SNF8-208ENST00000510195 PIK3C2BO00750 1634 aa40.94■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.94■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 EID1Q9Y6B2 187 aa40.94■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 IDI1Q13907 227 aa40.93■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.93■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.93■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 LTKP29376 864 aa40.92■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.9■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.9■■■■■ 4.14
SNF8-208ENST00000510195 TOM1O60784 492 aa40.88■■■■■ 4.13
SNF8-208ENST00000510195 SYNMO15061 1565 aa40.87■■■■■ 4.13
SNF8-208ENST00000510195 TET3O43151 1660 aa40.82■■■■■ 4.13
SNF8-208ENST00000510195 UNC13BO14795 1591 aa40.82■■■■■ 4.12
SNF8-208ENST00000510195 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.76■■■■■ 4.12
SNF8-208ENST00000510195 ADGRB3O60242 1522 aa40.76■■■■■ 4.12
SNF8-208ENST00000510195 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.76■■■■■ 4.12
SNF8-208ENST00000510195 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
SNF8-208ENST00000510195 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.75■■■■■ 4.11
SNF8-208ENST00000510195 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.73■■■■■ 4.11
SNF8-208ENST00000510195 ITGAEP38570 1179 aa40.7■■■■■ 4.11
SNF8-208ENST00000510195 PIP4K2BP78356 416 aa40.68■■■■■ 4.1
SNF8-208ENST00000510195 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.67■■■■■ 4.1
SNF8-208ENST00000510195 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
SNF8-208ENST00000510195 NUP155O75694 1391 aa40.63■■■■■ 4.1
SNF8-208ENST00000510195 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.63■■■■■ 4.09
SNF8-208ENST00000510195 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
SNF8-208ENST00000510195 E9PCH4 1651 aa40.6■■■■■ 4.09
SNF8-208ENST00000510195 ALKQ9UM73 1620 aa40.59■■■■■ 4.09
SNF8-208ENST00000510195 HSPA1LP34931 641 aa40.57■■■■■ 4.09
SNF8-208ENST00000510195 KCNA6P17658 529 aa40.56■■■■■ 4.08
SNF8-208ENST00000510195 ZFYVE9O95405 1425 aa40.56■■■■■ 4.08
SNF8-208ENST00000510195 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.56■■■■■ 4.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms