RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.99■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.98■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 FMN1Q68DA7 1419 aa25.98■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.97■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.96■■□□□ 1.75
UBE2B-207ENST00000510021 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2B-207ENST00000510021 PZPP20742 1482 aa25.94■■□□□ 1.74
UBE2B-207ENST00000510021 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
UBE2B-207ENST00000510021 NLRP1Q9C000 1473 aa25.92■■□□□ 1.74
UBE2B-207ENST00000510021 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.9■■□□□ 1.74
UBE2B-207ENST00000510021 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.89■■□□□ 1.73
UBE2B-207ENST00000510021 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
UBE2B-207ENST00000510021 MIA2Q96PC5 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
UBE2B-207ENST00000510021 TRIM52Q96A61 297 aa25.86■■□□□ 1.73
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
UBE2B-207ENST00000510021 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.82■■□□□ 1.72
UBE2B-207ENST00000510021 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.8■■□□□ 1.72
UBE2B-207ENST00000510021 JCADQ9P266 1359 aa25.78■■□□□ 1.72
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.78■■□□□ 1.72
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.75■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 LRP6O75581 1613 aa25.74■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 PHLPP1O60346 1717 aa25.74■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.72■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 EEA1Q15075 1411 aa25.71■■□□□ 1.71
UBE2B-207ENST00000510021 TMEM94Q12767 1356 aa25.69■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 MAP3K1Q13233 1512 aa25.68■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.68■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 RXRBP28702 533 aa25.67■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.64■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 KIF3BO15066 747 aa25.64■■□□□ 1.7
UBE2B-207ENST00000510021 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa25.63■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.61■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 LTKP29376 864 aa25.6■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 SLIT1O75093 1534 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 NCOA2Q15596 1464 aa25.58■■□□□ 1.69
UBE2B-207ENST00000510021 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.56■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.56■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 ERVK-7P63135 1459 aa25.55■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 MBD5Q9P267 1494 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.54■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 TIAM1Q13009 1591 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 RGS12O14924 1447 aa25.53■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 SHPRHQ149N8 1683 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 SLAIN2Q9P270 581 aa25.52■■□□□ 1.68
UBE2B-207ENST00000510021 ZRANB1Q9UGI0 708 aa25.51■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 KCNA6P17658 529 aa25.49■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 ABCC3O15438 1527 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 MSH6P52701 1360 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 CCNB3Q8WWL7 1395 aa25.47■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
UBE2B-207ENST00000510021 FOXD1Q16676 465 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 NWD1Q149M9 1564 aa25.44■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 EID1Q9Y6B2 187 aa25.43■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 AFF2P51816 1311 aa25.42■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.41■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
UBE2B-207ENST00000510021 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 TET3O43151 1660 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 ATAD2Q6PL18 1390 aa25.37■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.36■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 DIP2AQ14689 1571 aa25.35■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.34■■□□□ 1.65
UBE2B-207ENST00000510021 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.32■■□□□ 1.64
UBE2B-207ENST00000510021 PIK3C2BO00750 1634 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2B-207ENST00000510021 CEP152O94986 1710 aa25.3■■□□□ 1.64
UBE2B-207ENST00000510021 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
UBE2B-207ENST00000510021 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2B-207ENST00000510021 EP400Q96L91 3159 aa25.29■■□□□ 1.64
UBE2B-207ENST00000510021 LRP5O75197 1615 aa25.26■■□□□ 1.63
UBE2B-207ENST00000510021 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.22■■□□□ 1.63
UBE2B-207ENST00000510021 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
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