RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509340.1

PPM1K-205, Transcript of protein phosphatase, Mg2+/Mn2+ dependent 1K, human

TSL 3

Gene PPM1K, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPM1K-205	ENST00000509340	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		41.08	■■■■■ 4.17
PPM1K-205	ENST00000509340	DUOX2	Q9NRD8	1548 aa		41.08	■■■■■ 4.17
PPM1K-205	ENST00000509340	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	41.07	■■■■■ 4.17
PPM1K-205	ENST00000509340	PTPRK	Q15262	1439 aa		41.02	■■■■■ 4.16
PPM1K-205	ENST00000509340	KIF15	Q9NS87	1388 aa		41	■■■■■ 4.15
PPM1K-205	ENST00000509340	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		40.97	■■■■■ 4.15
PPM1K-205	ENST00000509340	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	40.94	■■■■■ 4.15
PPM1K-205	ENST00000509340	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		40.94	■■■■■ 4.15
PPM1K-205	ENST00000509340	PZP	P20742	1482 aa		40.92	■■■■■ 4.14
PPM1K-205	ENST00000509340	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		40.92	■■■■■ 4.14
PPM1K-205	ENST00000509340	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		40.92	■■■■■ 4.14
PPM1K-205	ENST00000509340	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		40.91	■■■■■ 4.14
PPM1K-205	ENST00000509340	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	40.9	■■■■■ 4.14
PPM1K-205	ENST00000509340	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
PPM1K-205	ENST00000509340	ADGRL2	O95490	1459 aa		40.89	■■■■■ 4.14
PPM1K-205	ENST00000509340	ABCC3	O15438	1527 aa		40.88	■■■■■ 4.13
PPM1K-205	ENST00000509340	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		40.87	■■■■■ 4.13
PPM1K-205	ENST00000509340	NCOA1	Q15788	1441 aa		40.85	■■■■■ 4.13
PPM1K-205	ENST00000509340	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	40.84	■■■■■ 4.13
PPM1K-205	ENST00000509340	STRC	Q7RTU9	1775 aa		40.84	■■■■■ 4.13
PPM1K-205	ENST00000509340	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	40.82	■■■■■ 4.13
PPM1K-205	ENST00000509340	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		40.81	■■■■■ 4.12
PPM1K-205	ENST00000509340	DEPDC5	O75140	1603 aa		40.8	■■■■■ 4.12
PPM1K-205	ENST00000509340	TNR	Q92752	1358 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PPM1K-205	ENST00000509340	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		40.76	■■■■■ 4.12
PPM1K-205	ENST00000509340	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PPM1K-205	ENST00000509340	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		40.74	■■■■■ 4.11
PPM1K-205	ENST00000509340	CEP152	O94986	1710 aa		40.73	■■■■■ 4.11
PPM1K-205	ENST00000509340	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	40.73	■■■■■ 4.11
PPM1K-205	ENST00000509340	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	40.72	■■■■■ 4.11
PPM1K-205	ENST00000509340	PLA2R1	Q13018	1463 aa		40.7	■■■■■ 4.11
PPM1K-205	ENST00000509340	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
PPM1K-205	ENST00000509340	PTPRT	O14522	1441 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PPM1K-205	ENST00000509340	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		40.67	■■■■■ 4.1
PPM1K-205	ENST00000509340	NLRP1	Q9C000	1473 aa		40.66	■■■■■ 4.1
PPM1K-205	ENST00000509340	KANK1	Q14678	1352 aa		40.65	■■■■■ 4.1
PPM1K-205	ENST00000509340	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		40.64	■■■■■ 4.1
PPM1K-205	ENST00000509340	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		40.63	■■■■■ 4.09
PPM1K-205	ENST00000509340	ERVK-7	P63135	1459 aa		40.63	■■■■■ 4.09
PPM1K-205	ENST00000509340	ROCK1	Q13464	1354 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PPM1K-205	ENST00000509340	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		40.62	■■■■■ 4.09
PPM1K-205	ENST00000509340	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		40.61	■■■■■ 4.09
PPM1K-205	ENST00000509340	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	40.56	■■■■■ 4.08
PPM1K-205	ENST00000509340	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	40.55	■■■■■ 4.08
PPM1K-205	ENST00000509340	PKD2	Q13563	968 aa		40.54	■■■■■ 4.08
PPM1K-205	ENST00000509340	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		40.51	■■■■■ 4.08
PPM1K-205	ENST00000509340	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	40.49	■■■■■ 4.07
PPM1K-205	ENST00000509340	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		40.46	■■■■■ 4.07
PPM1K-205	ENST00000509340	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		40.46	■■■■■ 4.07
PPM1K-205	ENST00000509340	UNC13B	O14795	1591 aa		40.44	■■■■■ 4.06
PPM1K-205	ENST00000509340	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	40.44	■■■■■ 4.06
PPM1K-205	ENST00000509340	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	40.43	■■■■■ 4.06
PPM1K-205	ENST00000509340	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	40.42	■■■■■ 4.06
PPM1K-205	ENST00000509340	ITGAE	P38570	1179 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PPM1K-205	ENST00000509340	FBXO41	Q8TF61	875 aa		40.39	■■■■■ 4.06
PPM1K-205	ENST00000509340	CERK	Q8TCT0	537 aa		40.37	■■■■■ 4.05
PPM1K-205	ENST00000509340	TET3	O43151	1660 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PPM1K-205	ENST00000509340	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	40.35	■■■■■ 4.05
PPM1K-205	ENST00000509340	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		40.35	■■■■■ 4.05
PPM1K-205	ENST00000509340	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		40.33	■■■■■ 4.05
PPM1K-205	ENST00000509340	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		40.31	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	NOS1	P29475	1434 aa		40.3	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		40.29	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	SYNM	O15061	1565 aa		40.27	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	MED14	O60244	1454 aa		40.26	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	40.26	■■■■■ 4.04
PPM1K-205	ENST00000509340	PIK3C2B	O00750	1634 aa		40.24	■■■■■ 4.03
PPM1K-205	ENST00000509340	SLIT1	O75093	1534 aa		40.21	■■■■■ 4.03
PPM1K-205	ENST00000509340	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		40.19	■■■■■ 4.03
PPM1K-205	ENST00000509340	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	40.18	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		40.18	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	40.16	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	NUP155	O75694	1391 aa		40.16	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	IQGAP1	P46940	1657 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	NAIP	Q13075	1403 aa		40.15	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340		E9PCH4	1651 aa		40.14	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	40.13	■■■■■ 4.02
PPM1K-205	ENST00000509340	IDI1	Q13907	227 aa		40.13	■■■■■ 4.01
PPM1K-205	ENST00000509340	ADGRB3	O60242	1522 aa		40.12	■■■■■ 4.01
PPM1K-205	ENST00000509340	HFM1	A2PYH4	1435 aa		40.1	■■■■■ 4.01
PPM1K-205	ENST00000509340	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PPM1K-205	ENST00000509340	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		40.09	■■■■■ 4.01
PPM1K-205	ENST00000509340	EID1	Q9Y6B2	187 aa		40.03	■■■■■ 4
PPM1K-205	ENST00000509340	CPS1	P31327	1500 aa		40.01	■■■■■ 4
PPM1K-205	ENST00000509340	LTK	P29376	864 aa		40	■■■■□ 3.99
PPM1K-205	ENST00000509340	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		40	■■■■□ 3.99
PPM1K-205	ENST00000509340	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		39.94	■■■■□ 3.98
PPM1K-205	ENST00000509340	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		39.89	■■■■□ 3.98
PPM1K-205	ENST00000509340	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		39.88	■■■■□ 3.97
PPM1K-205	ENST00000509340	ZFYVE9	O95405	1425 aa		39.86	■■■■□ 3.97
PPM1K-205	ENST00000509340	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		39.8	■■■■□ 3.96
PPM1K-205	ENST00000509340	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		39.79	■■■■□ 3.96
PPM1K-205	ENST00000509340	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	39.78	■■■■□ 3.96
PPM1K-205	ENST00000509340	TRPM2	O94759	1503 aa		39.76	■■■■□ 3.96
PPM1K-205	ENST00000509340	TRIM52	Q96A61	297 aa		39.76	■■■■□ 3.96
PPM1K-205	ENST00000509340	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	39.74	■■■■□ 3.95
PPM1K-205	ENST00000509340	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		39.73	■■■■□ 3.95

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms