RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 GPCPD1Q9NPB8 672 aa8.77□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 G3V3G9 751 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 TBC1D12O60347 775 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 OCEL1Q9H607 264 aa8.76□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-209ENST00000504994 RAD21O60216 631 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.71□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 MAP3K7O43318 606 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 IER5LQ5T953 404 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 NLRP7Q8WX94 980 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 COG6Q9Y2V7 657 aa8.7□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 FAM161AQ3B820 660 aa8.69□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 PHF14O94880 888 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 PLCG2P16885 1265 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.68□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 EPAS1Q99814 870 aa8.67□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 CLK2P49760 499 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 SNRKQ9NRH2 765 aa8.66□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 RFC5P40937 340 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 RETREG2Q8NC44 543 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.65□□□□□ -1.02
HERC3-209ENST00000504994 HAX1O00165 279 aa8.63□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 PADI6Q6TGC4 694 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 BANK1Q8NDB2 785 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 PXYLP1Q8TE99 480 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.62□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 SLC34A2O95436 690 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 ADGRG1Q9Y653 693 aa8.61□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 OATP04181 439 aa8.6□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.59□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
HERC3-209ENST00000504994 IRF5Q13568 498 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 GDPD2Q9HCC8 539 aa8.58□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.57□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 TMEM259Q4ZIN3 620 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 TTC13Q8NBP0 860 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 JPH4Q96JJ6 628 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 CLCN6P51797 869 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 EVX2Q03828 476 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 FBXW7Q969H0 707 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 POM121CA8CG34 1229 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 SEC24BO95487 1268 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 DIXDC1Q155Q3 683 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 RIC3Q7Z5B4 369 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 RGS22Q8NE09 1264 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 CERKQ8TCT0 537 aa8.53□□□□□ -1.04
HERC3-209ENST00000504994 POTEFA5A3E0 1075 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 ABL2P42684 1182 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 GLMNQ92990 594 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa8.52□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.51□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 SPTLC1O15269 473 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 CD46P15529 392 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 FOSBP53539 338 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.5□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 SOCS7O14512 581 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 QPCTQ16769 361 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-209ENST00000504994 WWC1Q8IX03 1113 aa8.49□□□□□ -1.05
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