RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504717.1

LMF2-203, Transcript of lipase maturation factor 2, humanhuman

TSL 5

Gene LMF2, Length 1,233 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMF2-203ENST00000504717 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.93■■■■■ 4.14
LMF2-203ENST00000504717 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.93■■■■■ 4.14
LMF2-203ENST00000504717 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.91■■■■■ 4.14
LMF2-203ENST00000504717 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
LMF2-203ENST00000504717 KIF15Q9NS87 1388 aa40.88■■■■■ 4.14
LMF2-203ENST00000504717 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
LMF2-203ENST00000504717 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.85■■■■■ 4.13
LMF2-203ENST00000504717 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
LMF2-203ENST00000504717 STRCQ7RTU9 1775 aa40.81■■■■■ 4.12
LMF2-203ENST00000504717 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.8■■■■■ 4.12
LMF2-203ENST00000504717 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.8■■■■■ 4.12
LMF2-203ENST00000504717 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.8■■■■■ 4.12
LMF2-203ENST00000504717 PZPP20742 1482 aa40.79■■■■■ 4.12
LMF2-203ENST00000504717 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.79■■■■■ 4.12
LMF2-203ENST00000504717 ERBINQ96RT1 1412 aa40.78■■■■■ 4.12
LMF2-203ENST00000504717 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.74■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 ABCC3O15438 1527 aa40.73■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.73■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 NCOA1Q15788 1441 aa40.71■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 TNRQ92752 1358 aa40.71■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.7■■■■■ 4.11
LMF2-203ENST00000504717 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
LMF2-203ENST00000504717 ADGRL2O95490 1459 aa40.67■■■■■ 4.1
LMF2-203ENST00000504717 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.65■■■■■ 4.1
LMF2-203ENST00000504717 PTPRTO14522 1441 aa40.64■■■■■ 4.1
LMF2-203ENST00000504717 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.63■■■■■ 4.1
LMF2-203ENST00000504717 CEP152O94986 1710 aa40.62■■■■■ 4.09
LMF2-203ENST00000504717 PLA2R1Q13018 1463 aa40.59■■■■■ 4.09
LMF2-203ENST00000504717 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.59■■■■■ 4.09
LMF2-203ENST00000504717 DEPDC5O75140 1603 aa40.59■■■■■ 4.09
LMF2-203ENST00000504717 KANK1Q14678 1352 aa40.56■■■■■ 4.08
LMF2-203ENST00000504717 NLRP1Q9C000 1473 aa40.54■■■■■ 4.08
LMF2-203ENST00000504717 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.54■■■■■ 4.08
LMF2-203ENST00000504717 PKD2Q13563 968 aa40.53■■■■■ 4.08
LMF2-203ENST00000504717 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.52■■■■■ 4.08
LMF2-203ENST00000504717 FBXO41Q8TF61 875 aa40.51■■■■■ 4.08
LMF2-203ENST00000504717 ERVK-7P63135 1459 aa40.51■■■■■ 4.07
LMF2-203ENST00000504717 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.49■■■■■ 4.07
LMF2-203ENST00000504717 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.49■■■■■ 4.07
LMF2-203ENST00000504717 CERKQ8TCT0 537 aa40.48■■■■■ 4.07
LMF2-203ENST00000504717 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.48■■■■■ 4.07
LMF2-203ENST00000504717 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
LMF2-203ENST00000504717 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.43■■■■■ 4.06
LMF2-203ENST00000504717 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.43■■■■■ 4.06
LMF2-203ENST00000504717 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.43■■■■■ 4.06
LMF2-203ENST00000504717 ROCK1Q13464 1354 aa40.42■■■■■ 4.06
LMF2-203ENST00000504717 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.41■■■■■ 4.06
LMF2-203ENST00000504717 ITGAEP38570 1179 aa40.39■■■■■ 4.06
LMF2-203ENST00000504717 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.32■■■■■ 4.05
LMF2-203ENST00000504717 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.32■■■■■ 4.05
LMF2-203ENST00000504717 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
LMF2-203ENST00000504717 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.28■■■■■ 4.04
LMF2-203ENST00000504717 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.27■■■■■ 4.04
LMF2-203ENST00000504717 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.25■■■■■ 4.03
LMF2-203ENST00000504717 UNC13BO14795 1591 aa40.23■■■■■ 4.03
LMF2-203ENST00000504717 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.22■■■■■ 4.03
LMF2-203ENST00000504717 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
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LMF2-203ENST00000504717 TET3O43151 1660 aa40.17■■■■■ 4.02
LMF2-203ENST00000504717 NOS1P29475 1434 aa40.16■■■■■ 4.02
LMF2-203ENST00000504717 MED14O60244 1454 aa40.16■■■■■ 4.02
LMF2-203ENST00000504717 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
LMF2-203ENST00000504717 PIK3C2BO00750 1634 aa40.14■■■■■ 4.02
LMF2-203ENST00000504717 SYNMO15061 1565 aa40.13■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 IDI1Q13907 227 aa40.12■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.12■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.1■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.1■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 SLIT1O75093 1534 aa40.08■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.07■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.07■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.07■■■■■ 4.01
LMF2-203ENST00000504717 NUP155O75694 1391 aa40.07■■■■■ 4
LMF2-203ENST00000504717 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
LMF2-203ENST00000504717 IQGAP1P46940 1657 aa40.06■■■■■ 4
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LMF2-203ENST00000504717 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.01■■■■■ 4
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LMF2-203ENST00000504717 E9PCH4 1651 aa39.99■■■■□ 3.99
LMF2-203ENST00000504717 ADGRB3O60242 1522 aa39.96■■■■□ 3.99
LMF2-203ENST00000504717 NAIPQ13075 1403 aa39.96■■■■□ 3.99
LMF2-203ENST00000504717 CPS1P31327 1500 aa39.94■■■■□ 3.98
LMF2-203ENST00000504717 HFM1A2PYH4 1435 aa39.87■■■■□ 3.97
LMF2-203ENST00000504717 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.8■■■■□ 3.96
LMF2-203ENST00000504717 UBAP1LF5GYI3 381 aa39.8■■■■□ 3.96
LMF2-203ENST00000504717 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.78■■■■□ 3.96
LMF2-203ENST00000504717 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
LMF2-203ENST00000504717 STRCP1A6NGW2 1772 aa39.75■■■■□ 3.95
LMF2-203ENST00000504717 HDGFP51858 240 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
LMF2-203ENST00000504717 ZFYVE9O95405 1425 aa39.74■■■■□ 3.95
LMF2-203ENST00000504717 TRIM52Q96A61 297 aa39.72■■■■□ 3.95
LMF2-203ENST00000504717 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.72■■■■□ 3.95
LMF2-203ENST00000504717 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa39.71■■■■□ 3.95
LMF2-203ENST00000504717 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
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