RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503051.1

USP46-AS1-201, USP46 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene USP46-AS1, Length 1,048 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-AS1-201ENST00000503051 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.8■■■□□ 2.36
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
USP46-AS1-201ENST00000503051 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTPRKQ15262 1439 aa29.76■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.76■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 DAPK1P53355 1430 aa29.75■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCC5O15440 1437 aa29.73■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.71■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 CEP152O94986 1710 aa29.71■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
USP46-AS1-201ENST00000503051 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.7■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 KIF15Q9NS87 1388 aa29.69■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 PZPP20742 1482 aa29.68■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.66■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.65■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 ABCC3O15438 1527 aa29.65■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 NCOA1Q15788 1441 aa29.64■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 ERBINQ96RT1 1412 aa29.64■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
USP46-AS1-201ENST00000503051 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.61■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 TNRQ92752 1358 aa29.61■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.61■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.6■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 DEPDC5O75140 1603 aa29.58■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.58■■■□□ 2.33
USP46-AS1-201ENST00000503051 PTPRTO14522 1441 aa29.57■■■□□ 2.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 PLA2R1Q13018 1463 aa29.56■■■□□ 2.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADGRL2O95490 1459 aa29.53■■■□□ 2.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 FBXO41Q8TF61 875 aa29.52■■■□□ 2.32
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.51■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 NLRP1Q9C000 1473 aa29.5■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 ERVK-7P63135 1459 aa29.48■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 KANK1Q14678 1352 aa29.48■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.47■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.46■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.46■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 PKD2Q13563 968 aa29.45■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 CERKQ8TCT0 537 aa29.45■■■□□ 2.31
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.38■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.38■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.38■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP29.38■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.37■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.36■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.35■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.35■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.34■■■□□ 2.29
USP46-AS1-201ENST00000503051 UNC13BO14795 1591 aa29.3■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ITGAEP38570 1179 aa29.3■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.3■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ROCK1Q13464 1354 aa29.29■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 TET3O43151 1660 aa29.29■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 IQGAP1P46940 1657 aa29.29■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 PIK3C2BO00750 1634 aa29.28■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.28■■■□□ 2.28
USP46-AS1-201ENST00000503051 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.24■■■□□ 2.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 SYNMO15061 1565 aa29.22■■■□□ 2.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
USP46-AS1-201ENST00000503051 MED14O60244 1454 aa29.2■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.2■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.19■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLIT1O75093 1534 aa29.15■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 NOS1P29475 1434 aa29.15■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 E9PCH4 1651 aa29.15■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.14■■■□□ 2.26
USP46-AS1-201ENST00000503051 ADGRB3O60242 1522 aa29.14■■■□□ 2.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.13■■■□□ 2.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 CPS1P31327 1500 aa29.13■■■□□ 2.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 EID1Q9Y6B2 187 aa29.08■■■□□ 2.25
USP46-AS1-201ENST00000503051 IDI1Q13907 227 aa29.07■■■□□ 2.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 NUP155O75694 1391 aa29.06■■■□□ 2.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.06■■■□□ 2.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.05■■■□□ 2.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.05■■■□□ 2.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.04■■■□□ 2.24
USP46-AS1-201ENST00000503051 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.01■■■□□ 2.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 LTKP29376 864 aa29■■■□□ 2.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 NAIPQ13075 1403 aa29■■■□□ 2.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 HFM1A2PYH4 1435 aa28.98■■■□□ 2.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 UBAP1LF5GYI3 381 aa28.98■■■□□ 2.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.98■■■□□ 2.23
USP46-AS1-201ENST00000503051 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
USP46-AS1-201ENST00000503051 BCANQ96GW7 911 aa28.88■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.88■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 RIMS2Q9UQ26 1411 aa28.87■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
USP46-AS1-201ENST00000503051 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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