RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496786.5

SPEG-222, Transcript of SPEG complex locus, human

TSL 4

Gene SPEG, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPEG-222	ENST00000496786	KIF15	Q9NS87	1388 aa		29.62	■■■□□ 2.33
SPEG-222	ENST00000496786	KDM5D	Q9BY66	1539 aa		29.61	■■■□□ 2.33
SPEG-222	ENST00000496786	NPAT	Q14207	1427 aa		29.6	■■■□□ 2.33
SPEG-222	ENST00000496786	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		29.6	■■■□□ 2.33
SPEG-222	ENST00000496786	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		29.59	■■■□□ 2.33
SPEG-222	ENST00000496786	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	29.58	■■■□□ 2.33
SPEG-222	ENST00000496786	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		29.57	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	ADGRL2	O95490	1459 aa		29.56	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		29.56	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	CHIC2	Q9UKJ5	165 aa		29.55	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	29.54	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	NCOA1	Q15788	1441 aa		29.54	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		29.53	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	PTPRK	Q15262	1439 aa		29.53	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	HSPA2	P54652	639 aa		29.52	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		29.52	■■■□□ 2.32
SPEG-222	ENST00000496786	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	29.5	■■■□□ 2.31
SPEG-222	ENST00000496786	ABCC3	O15438	1527 aa		29.47	■■■□□ 2.31
SPEG-222	ENST00000496786	PZP	P20742	1482 aa		29.47	■■■□□ 2.31
SPEG-222	ENST00000496786	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
SPEG-222	ENST00000496786	DEPDC5	O75140	1603 aa		29.46	■■■□□ 2.31
SPEG-222	ENST00000496786	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		29.45	■■■□□ 2.31
SPEG-222	ENST00000496786	CEP152	O94986	1710 aa		29.43	■■■□□ 2.3
SPEG-222	ENST00000496786	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	29.43	■■■□□ 2.3
SPEG-222	ENST00000496786	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	29.4	■■■□□ 2.3
SPEG-222	ENST00000496786	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		29.39	■■■□□ 2.3
SPEG-222	ENST00000496786	ROCK1	Q13464	1354 aa		29.39	■■■□□ 2.29
SPEG-222	ENST00000496786	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		29.37	■■■□□ 2.29
SPEG-222	ENST00000496786	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	29.37	■■■□□ 2.29
SPEG-222	ENST00000496786	KANK1	Q14678	1352 aa		29.36	■■■□□ 2.29
SPEG-222	ENST00000496786	TNR	Q92752	1358 aa		29.36	■■■□□ 2.29
SPEG-222	ENST00000496786	STRC	Q7RTU9	1775 aa		29.36	■■■□□ 2.29
SPEG-222	ENST00000496786	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
SPEG-222	ENST00000496786	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		29.32	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	29.32	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		29.31	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		29.31	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	ITGAE	P38570	1179 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		29.3	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	ERVK-7	P63135	1459 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	NLRP1	Q9C000	1473 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		29.27	■■■□□ 2.28
SPEG-222	ENST00000496786	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
SPEG-222	ENST00000496786	PLA2R1	Q13018	1463 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SPEG-222	ENST00000496786	UNC13B	O14795	1591 aa		29.23	■■■□□ 2.27
SPEG-222	ENST00000496786	PTPRT	O14522	1441 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SPEG-222	ENST00000496786	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		29.2	■■■□□ 2.27
SPEG-222	ENST00000496786	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SPEG-222	ENST00000496786	TET3	O43151	1660 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SPEG-222	ENST00000496786	PKD2	Q13563	968 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SPEG-222	ENST00000496786	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		29.13	■■■□□ 2.25
SPEG-222	ENST00000496786	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
SPEG-222	ENST00000496786	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
SPEG-222	ENST00000496786	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SPEG-222	ENST00000496786	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
SPEG-222	ENST00000496786	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SPEG-222	ENST00000496786	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SPEG-222	ENST00000496786	NOS1	P29475	1434 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	NAIP	Q13075	1403 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	SYNM	O15061	1565 aa		29.05	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	NUP155	O75694	1391 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	PIK3C2B	O00750	1634 aa		29.04	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	HFM1	A2PYH4	1435 aa		29.03	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	KDM5A	P29375	1690 aa	Known RBP	29.03	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786		E9PCH4	1651 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		29.02	■■■□□ 2.24
SPEG-222	ENST00000496786	IDI1	Q13907	227 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SPEG-222	ENST00000496786	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SPEG-222	ENST00000496786	MED14	O60244	1454 aa		28.97	■■■□□ 2.23
SPEG-222	ENST00000496786	SLIT1	O75093	1534 aa		28.96	■■■□□ 2.23
SPEG-222	ENST00000496786	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	CERK	Q8TCT0	537 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		28.94	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	ADGRB3	O60242	1522 aa		28.93	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	NPHP4	O75161	1426 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	IQGAP1	P46940	1657 aa		28.92	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
SPEG-222	ENST00000496786	FBXO41	Q8TF61	875 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		28.88	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		28.86	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	EID1	Q9Y6B2	187 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		28.84	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		28.83	■■■□□ 2.21
SPEG-222	ENST00000496786	LTK	P29376	864 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SPEG-222	ENST00000496786	TRIM52	Q96A61	297 aa		28.82	■■■□□ 2.2
SPEG-222	ENST00000496786	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SPEG-222	ENST00000496786	CPS1	P31327	1500 aa		28.75	■■■□□ 2.19
SPEG-222	ENST00000496786	TRPM2	O94759	1503 aa		28.74	■■■□□ 2.19
SPEG-222	ENST00000496786	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
SPEG-222	ENST00000496786	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
SPEG-222	ENST00000496786	ZFYVE9	O95405	1425 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SPEG-222	ENST00000496786	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
SPEG-222	ENST00000496786	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SPEG-222	ENST00000496786	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19

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