RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494971.2

USP20-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 3

Gene USP20, Length 503 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-208ENST00000494971 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.45■■□□□ 1.83
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USP20-208ENST00000494971 KIF15Q9NS87 1388 aa26.42■■□□□ 1.82
USP20-208ENST00000494971 PTPRKQ15262 1439 aa26.41■■□□□ 1.82
USP20-208ENST00000494971 ERBINQ96RT1 1412 aa26.38■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.37■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 ADGRL2O95490 1459 aa26.36■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.36■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.35■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 NCOA1Q15788 1441 aa26.35■■□□□ 1.81
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USP20-208ENST00000494971 CHIC2Q9UKJ5 165 aa26.33■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 PZPP20742 1482 aa26.33■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
USP20-208ENST00000494971 ABCC3O15438 1527 aa26.32■■□□□ 1.8
USP20-208ENST00000494971 MYO3AQ8NEV4 1616 aa26.3■■□□□ 1.8
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USP20-208ENST00000494971 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
USP20-208ENST00000494971 DEPDC5O75140 1603 aa26.28■■□□□ 1.8
USP20-208ENST00000494971 STRCQ7RTU9 1775 aa26.28■■□□□ 1.8
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USP20-208ENST00000494971 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
USP20-208ENST00000494971 TNRQ92752 1358 aa26.23■■□□□ 1.79
USP20-208ENST00000494971 CEP152O94986 1710 aa26.23■■□□□ 1.79
USP20-208ENST00000494971 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.21■■□□□ 1.79
USP20-208ENST00000494971 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.21■■□□□ 1.79
USP20-208ENST00000494971 DMRT2Q9Y5R5 561 aa26.19■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 ROCK1Q13464 1354 aa26.19■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.18■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.18■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.18■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.18■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 PLA2R1Q13018 1463 aa26.17■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 KANK1Q14678 1352 aa26.16■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 PTPRTO14522 1441 aa26.15■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.15■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 ERVK-7P63135 1459 aa26.15■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 NLRP1Q9C000 1473 aa26.15■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
USP20-208ENST00000494971 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
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USP20-208ENST00000494971 ITGAEP38570 1179 aa26.06■■□□□ 1.76
USP20-208ENST00000494971 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.06■■□□□ 1.76
USP20-208ENST00000494971 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.05■■□□□ 1.76
USP20-208ENST00000494971 UNC13BO14795 1591 aa26.05■■□□□ 1.76
USP20-208ENST00000494971 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.05■■□□□ 1.76
USP20-208ENST00000494971 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
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USP20-208ENST00000494971 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.97■■□□□ 1.75
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USP20-208ENST00000494971 SYNMO15061 1565 aa25.94■■□□□ 1.74
USP20-208ENST00000494971 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.93■■□□□ 1.74
USP20-208ENST00000494971 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.93■■□□□ 1.74
USP20-208ENST00000494971 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.93■■□□□ 1.74
USP20-208ENST00000494971 FBXO41Q8TF61 875 aa25.93■■□□□ 1.74
USP20-208ENST00000494971 MED14O60244 1454 aa25.91■■□□□ 1.74
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USP20-208ENST00000494971 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
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USP20-208ENST00000494971 NUP155O75694 1391 aa25.89■■□□□ 1.74
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USP20-208ENST00000494971 HFM1A2PYH4 1435 aa25.86■■□□□ 1.73
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USP20-208ENST00000494971 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.8■■□□□ 1.72
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USP20-208ENST00000494971 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.77■■□□□ 1.72
USP20-208ENST00000494971 EID1Q9Y6B2 187 aa25.75■■□□□ 1.71
USP20-208ENST00000494971 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.72■■□□□ 1.71
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USP20-208ENST00000494971 ZFYVE9O95405 1425 aa25.67■■□□□ 1.7
USP20-208ENST00000494971 TRIM52Q96A61 297 aa25.63■■□□□ 1.69
USP20-208ENST00000494971 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.63■■□□□ 1.69
USP20-208ENST00000494971 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.63■■□□□ 1.69
USP20-208ENST00000494971 TRPM2O94759 1503 aa25.61■■□□□ 1.69
USP20-208ENST00000494971 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
USP20-208ENST00000494971 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
USP20-208ENST00000494971 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa25.57■■□□□ 1.68
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