RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493230.5

HRAS-211, Transcript of HRas proto-oncogene, GTPase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HRAS, Length 1,114 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRAS-211ENST00000493230 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
HRAS-211ENST00000493230 KIF15Q9NS87 1388 aa28.5■■■□□ 2.15
HRAS-211ENST00000493230 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.48■■■□□ 2.15
HRAS-211ENST00000493230 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.47■■■□□ 2.15
HRAS-211ENST00000493230 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.47■■■□□ 2.15
HRAS-211ENST00000493230 ERBINQ96RT1 1412 aa28.46■■■□□ 2.15
HRAS-211ENST00000493230 KDM5DQ9BY66 1539 aa28.45■■■□□ 2.15
HRAS-211ENST00000493230 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
HRAS-211ENST00000493230 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.142e-6■□□□□ 9.6
HRAS-211ENST00000493230 CHIC2Q9UKJ5 165 aa28.43■■■□□ 2.14
HRAS-211ENST00000493230 NCOA1Q15788 1441 aa28.43■■■□□ 2.14
HRAS-211ENST00000493230 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
HRAS-211ENST00000493230 ADGRL2O95490 1459 aa28.41■■■□□ 2.14
HRAS-211ENST00000493230 HSPA2P54652 639 aa28.39■■■□□ 2.14
HRAS-211ENST00000493230 PTPRKQ15262 1439 aa28.39■■■□□ 2.14
HRAS-211ENST00000493230 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
HRAS-211ENST00000493230 PZPP20742 1482 aa28.34■■■□□ 2.13
HRAS-211ENST00000493230 ROCK1Q13464 1354 aa28.31■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 ABCC3O15438 1527 aa28.31■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.3■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 KANK1Q14678 1352 aa28.3■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 DMRT2Q9Y5R5 561 aa28.28■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.26■■■□□ 2.12
HRAS-211ENST00000493230 DEPDC5O75140 1603 aa28.26■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 TNRQ92752 1358 aa28.24■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.24■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.21■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 ITGAEP38570 1179 aa28.21■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
HRAS-211ENST00000493230 A2ML1A8K2U0 1454 aa28.2■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.19■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 CEP152O94986 1710 aa28.18■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 NLRP1Q9C000 1473 aa28.17■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.17■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.16■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.16■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 STRCQ7RTU9 1775 aa28.14■■■□□ 2.1
HRAS-211ENST00000493230 ERVK-7P63135 1459 aa28.14■■■□□ 2.09
HRAS-211ENST00000493230 PLA2R1Q13018 1463 aa28.14■■■□□ 2.09
HRAS-211ENST00000493230 PKD2Q13563 968 aa28.12■■■□□ 2.09
HRAS-211ENST00000493230 PTPRTO14522 1441 aa28.11■■■□□ 2.09
HRAS-211ENST00000493230 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
HRAS-211ENST00000493230 UNC13BO14795 1591 aa28.06■■■□□ 2.08
HRAS-211ENST00000493230 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.05■■■□□ 2.08
HRAS-211ENST00000493230 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.04■■■□□ 2.08
HRAS-211ENST00000493230 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HRAS-211ENST00000493230 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HRAS-211ENST00000493230 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa28.01■■■□□ 2.07
HRAS-211ENST00000493230 ANKLE2Q86XL3 938 aa27.99■■■□□ 2.07
HRAS-211ENST00000493230 TET3O43151 1660 aa27.99■■■□□ 2.07
HRAS-211ENST00000493230 NUP155O75694 1391 aa27.98■■■□□ 2.07
HRAS-211ENST00000493230 NOS1P29475 1434 aa27.96■■■□□ 2.07
HRAS-211ENST00000493230 SLC52A1Q9NWF4 448 aa27.96■■■□□ 2.07
HRAS-211ENST00000493230 NAIPQ13075 1403 aa27.95■■■□□ 2.07
HRAS-211ENST00000493230 IQGAP3Q86VI3 1631 aa27.95■■■□□ 2.06
HRAS-211ENST00000493230 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.94■■■□□ 2.06
HRAS-211ENST00000493230 HFM1A2PYH4 1435 aa27.94■■■□□ 2.06
HRAS-211ENST00000493230 STAG3Q9UJ98 1225 aa27.91■■■□□ 2.06
HRAS-211ENST00000493230 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
HRAS-211ENST00000493230 UBR1Q8IWV7 1749 aa27.9■■■□□ 2.06
HRAS-211ENST00000493230 IDI1Q13907 227 aa27.9■■■□□ 2.06
HRAS-211ENST00000493230 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 CERKQ8TCT0 537 aa27.88■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 SYNMO15061 1565 aa27.87■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 MED14O60244 1454 aa27.86■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 PIK3C2BO00750 1634 aa27.85■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 EID1Q9Y6B2 187 aa27.84■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 SLIT1O75093 1534 aa27.83■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 NEURL4Q96JN8 1562 aa27.83■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 FBXO41Q8TF61 875 aa27.83■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 E9PCH4 1651 aa27.83■■■□□ 2.05
HRAS-211ENST00000493230 ARHGAP23Q9P227 1491 aa27.83■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 TXNDC2Q86VQ3 553 aa27.8■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 TMEM2Q9UHN6 1383 aa27.8■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.78■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 ADGRB3O60242 1522 aa27.77■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 TRIM52Q96A61 297 aa27.77■■■□□ 2.04
HRAS-211ENST00000493230 HDGFP51858 240 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
HRAS-211ENST00000493230 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
HRAS-211ENST00000493230 IQGAP1P46940 1657 aa27.75■■■□□ 2.03
HRAS-211ENST00000493230 LTKP29376 864 aa27.74■■■□□ 2.03
HRAS-211ENST00000493230 IQSEC2Q5JU85 1478 aa27.73■■■□□ 2.03
HRAS-211ENST00000493230 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
HRAS-211ENST00000493230 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa27.67■■■□□ 2.02
HRAS-211ENST00000493230 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa27.67■■■□□ 2.02
HRAS-211ENST00000493230 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
HRAS-211ENST00000493230 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP27.66■■■□□ 2.02
HRAS-211ENST00000493230 CPS1P31327 1500 aa27.66■■■□□ 2.02
HRAS-211ENST00000493230 SETD5Q9C0A6 1442 aa27.65■■■□□ 2.02
HRAS-211ENST00000493230 ZFYVE9O95405 1425 aa27.61■■■□□ 2.01
HRAS-211ENST00000493230 RIMS2Q9UQ26 1411 aa27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms