RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491659.5

USP39-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 39, humanhuman

TSL 3

Gene USP39, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39-217ENST00000491659 DAPK1P53355 1430 aa23.43■■□□□ 1.34
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USP39-217ENST00000491659 ABCC5O15440 1437 aa23.42■■□□□ 1.34
USP39-217ENST00000491659 MYO3AQ8NEV4 1616 aa23.41■■□□□ 1.34
USP39-217ENST00000491659 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
USP39-217ENST00000491659 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
USP39-217ENST00000491659 PTPRKQ15262 1439 aa23.39■■□□□ 1.33
USP39-217ENST00000491659 KIF15Q9NS87 1388 aa23.37■■□□□ 1.33
USP39-217ENST00000491659 STRCQ7RTU9 1775 aa23.35■■□□□ 1.33
USP39-217ENST00000491659 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.34■■□□□ 1.33
USP39-217ENST00000491659 ERBINQ96RT1 1412 aa23.34■■□□□ 1.33
USP39-217ENST00000491659 PZPP20742 1482 aa23.34■■□□□ 1.33
USP39-217ENST00000491659 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.33■■□□□ 1.33
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USP39-217ENST00000491659 CEP152O94986 1710 aa23.32■■□□□ 1.32
USP39-217ENST00000491659 ABCC3O15438 1527 aa23.32■■□□□ 1.32
USP39-217ENST00000491659 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.31■■□□□ 1.32
USP39-217ENST00000491659 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
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USP39-217ENST00000491659 DEPDC5O75140 1603 aa23.29■■□□□ 1.32
USP39-217ENST00000491659 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.29■■□□□ 1.32
USP39-217ENST00000491659 ADGRL2O95490 1459 aa23.28■■□□□ 1.32
USP39-217ENST00000491659 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.27■■□□□ 1.32
USP39-217ENST00000491659 NCOA1Q15788 1441 aa23.25■■□□□ 1.31
USP39-217ENST00000491659 DMRT2Q9Y5R5 561 aa23.25■■□□□ 1.31
USP39-217ENST00000491659 TNRQ92752 1358 aa23.25■■□□□ 1.31
USP39-217ENST00000491659 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.24■■□□□ 1.31
USP39-217ENST00000491659 PLA2R1Q13018 1463 aa23.22■■□□□ 1.31
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USP39-217ENST00000491659 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.2■■□□□ 1.3
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USP39-217ENST00000491659 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
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USP39-217ENST00000491659 NLRP1Q9C000 1473 aa23.18■■□□□ 1.3
USP39-217ENST00000491659 ERVK-7P63135 1459 aa23.17■■□□□ 1.3
USP39-217ENST00000491659 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
USP39-217ENST00000491659 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
USP39-217ENST00000491659 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
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USP39-217ENST00000491659 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.14■■□□□ 1.291e-6■□□□□ 11
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USP39-217ENST00000491659 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.13■■□□□ 1.29
USP39-217ENST00000491659 PKD2Q13563 968 aa23.11■■□□□ 1.29
USP39-217ENST00000491659 ROCK1Q13464 1354 aa23.11■■□□□ 1.29
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USP39-217ENST00000491659 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.06■■□□□ 1.28
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USP39-217ENST00000491659 PIK3C2BO00750 1634 aa23■■□□□ 1.27
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USP39-217ENST00000491659 SYNMO15061 1565 aa22.98■■□□□ 1.27
USP39-217ENST00000491659 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP39-217ENST00000491659 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.98■■□□□ 1.27
USP39-217ENST00000491659 IQGAP1P46940 1657 aa22.97■■□□□ 1.27
USP39-217ENST00000491659 MED14O60244 1454 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 NOS1P29475 1434 aa22.95■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 E9PCH4 1651 aa22.93■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.93■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 SLIT1O75093 1534 aa22.92■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 ADGRB3O60242 1522 aa22.91■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.91■■□□□ 1.26
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USP39-217ENST00000491659 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
USP39-217ENST00000491659 NUP155O75694 1391 aa22.88■■□□□ 1.25
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USP39-217ENST00000491659 CPS1P31327 1500 aa22.86■■□□□ 1.25
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USP39-217ENST00000491659 NAIPQ13075 1403 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-217ENST00000491659 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-217ENST00000491659 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.84■■□□□ 1.25
USP39-217ENST00000491659 EID1Q9Y6B2 187 aa22.83■■□□□ 1.25
USP39-217ENST00000491659 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.81■■□□□ 1.24
USP39-217ENST00000491659 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.81■■□□□ 1.24
USP39-217ENST00000491659 HFM1A2PYH4 1435 aa22.81■■□□□ 1.24
USP39-217ENST00000491659 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.79■■□□□ 1.24
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USP39-217ENST00000491659 STRCP1A6NGW2 1772 aa22.76■■□□□ 1.23
USP39-217ENST00000491659 ZFYVE9O95405 1425 aa22.71■■□□□ 1.23
USP39-217ENST00000491659 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
USP39-217ENST00000491659 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.7■■□□□ 1.22
USP39-217ENST00000491659 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.68■■□□□ 1.22
USP39-217ENST00000491659 TRPM2O94759 1503 aa22.67■■□□□ 1.22
USP39-217ENST00000491659 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
USP39-217ENST00000491659 TRIM52Q96A61 297 aa22.67■■□□□ 1.22
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