RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa10.29□□□□□ -0.76
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RABGGTB-212ENST00000491266 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 MAMSTRQ6ZN01 415 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-212ENST00000491266 CUX2O14529 1486 aa10.28□□□□□ -0.76
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RABGGTB-212ENST00000491266 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
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RABGGTB-212ENST00000491266 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.782e-11■■■□□ 18.5
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RABGGTB-212ENST00000491266 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.791e-9■■■□□ 14.8
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RABGGTB-212ENST00000491266 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
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RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF454Q8N9F8 522 aa10.04□□□□□ -0.8
RABGGTB-212ENST00000491266 ERICH3Q5RHP9 1530 aa10.03□□□□□ -0.8
RABGGTB-212ENST00000491266 POTEMA6NI47 508 aa10.03□□□□□ -0.8
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RABGGTB-212ENST00000491266 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
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RABGGTB-212ENST00000491266 POTEGQ6S5H5 508 aa10.01□□□□□ -0.81
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RABGGTB-212ENST00000491266 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
RABGGTB-212ENST00000491266 ADAMTS12P58397 1594 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-212ENST00000491266 CERKQ8TCT0 537 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-212ENST00000491266 BCL2L12Q9HB09 334 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-212ENST00000491266 GOLGA3Q08378 1498 aa9.98□□□□□ -0.81
RABGGTB-212ENST00000491266 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-212ENST00000491266 TTC13Q8NBP0 860 aa9.97□□□□□ -0.81
RABGGTB-212ENST00000491266 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
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