RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		10.29	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	EVI5	O60447	810 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	CUX2	O14529	1486 aa		10.28	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
RABGGTB-212	ENST00000491266	OTUD5	Q96G74	571 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR62	O43379	1518 aa		10.27	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		10.26	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZMYND10	O75800	440 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	OSBP	P22059	807 aa		10.25	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.24	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR37	O15354	613 aa		10.23	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		10.22	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		10.21	□□□□□ -0.77
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDX12P	Q92771	950 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.2	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		10.19	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHF14	O94880	888 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		10.18	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGF1R	P08069	1367 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPAS1	Q99814	870 aa		10.17	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	10.16	□□□□□ -0.78	2e-11	■■■□□ 18.5
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFT140	Q96RY7	1462 aa		10.16	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.15	□□□□□ -0.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	JPH4	Q96JJ6	628 aa		10.14	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79	1e-9	■■■□□ 14.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	WDR97	A6NE52	1622 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF27	Q86VH2	1401 aa		10.13	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOSB	P53539	338 aa		10.12	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUDT7	P0C024	238 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		10.11	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	NUTM2F	A1L443	756 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNPH	O15079	494 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRX	Q9BXM0	1461 aa		10.1	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	EEA1	Q15075	1411 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	PTGDR	Q13258	359 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIC1	Q14526	733 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	FBXW7	Q969H0	707 aa		10.09	□□□□□ -0.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCHSD2	O94868	740 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPDC1	Q9NQX5	325 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNPAT	O15228	680 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	AK7	Q96M32	723 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP2K5	Q13163	448 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	GRIN2B	Q13224	1484 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEM	A6NI47	508 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	MAP3K7	O43318	606 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	FECH	P22830	423 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	IRF6	O14896	467 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRIM66	O15016	1216 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf132	Q5T0Z8	1188 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIF21B	O75037	1637 aa		10	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	CCDC102A	Q96A19	550 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTS12	P58397	1594 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	CERK	Q8TCT0	537 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	GOLGA3	Q08378	1498 aa		9.98	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	TTC13	Q8NBP0	860 aa		9.97	□□□□□ -0.81
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81

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