RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490751.1

LDB1-204, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene LDB1, Length 762 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-204ENST00000490751 SHANK2Q9UPX8 1470 aa48.86■■■■■ 5.41
LDB1-204ENST00000490751 MYO3AQ8NEV4 1616 aa48.85■■■■■ 5.41
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LDB1-204ENST00000490751 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
LDB1-204ENST00000490751 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
LDB1-204ENST00000490751 DAPK1P53355 1430 aa48.81■■■■■ 5.4
LDB1-204ENST00000490751 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa48.79■■■■■ 5.4
LDB1-204ENST00000490751 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP48.78■■■■■ 5.4
LDB1-204ENST00000490751 DUOX2Q9NRD8 1548 aa48.78■■■■■ 5.4
LDB1-204ENST00000490751 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP48.73■■■■■ 5.39
LDB1-204ENST00000490751 DMRT2Q9Y5R5 561 aa48.72■■■■■ 5.39
LDB1-204ENST00000490751 KIF15Q9NS87 1388 aa48.72■■■■■ 5.39
LDB1-204ENST00000490751 PZPP20742 1482 aa48.72■■■■■ 5.39
LDB1-204ENST00000490751 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa48.71■■■■■ 5.39
LDB1-204ENST00000490751 NCOA1Q15788 1441 aa48.7■■■■■ 5.39
LDB1-204ENST00000490751 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP48.68■■■■■ 5.38
LDB1-204ENST00000490751 MROH1Q8NDA8 1641 aa48.68■■■■■ 5.38
LDB1-204ENST00000490751 ABCC3O15438 1527 aa48.65■■■■■ 5.38
LDB1-204ENST00000490751 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP48.64■■■■■ 5.38
LDB1-204ENST00000490751 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa48.64■■■■■ 5.38
LDB1-204ENST00000490751 PTPRTO14522 1441 aa48.61■■■■■ 5.37
LDB1-204ENST00000490751 ERBINQ96RT1 1412 aa48.61■■■■■ 5.37
LDB1-204ENST00000490751 TNRQ92752 1358 aa48.61■■■■■ 5.37
LDB1-204ENST00000490751 A2ML1A8K2U0 1454 aa48.58■■■■■ 5.37
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LDB1-204ENST00000490751 FBXO41Q8TF61 875 aa48.57■■■■■ 5.37
LDB1-204ENST00000490751 CHIC2Q9UKJ5 165 aa48.57■■■■■ 5.37
LDB1-204ENST00000490751 CEP152O94986 1710 aa48.57■■■■■ 5.37
LDB1-204ENST00000490751 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa48.55■■■■■ 5.36
LDB1-204ENST00000490751 PLA2R1Q13018 1463 aa48.54■■■■■ 5.36
LDB1-204ENST00000490751 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP48.51■■■■■ 5.36
LDB1-204ENST00000490751 CERKQ8TCT0 537 aa48.47■■■■■ 5.35
LDB1-204ENST00000490751 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa48.46■■■■■ 5.35
LDB1-204ENST00000490751 ADGRL2O95490 1459 aa48.46■■■■■ 5.35
LDB1-204ENST00000490751 DEPDC5O75140 1603 aa48.46■■■■■ 5.35
LDB1-204ENST00000490751 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa48.42■■■■■ 5.34
LDB1-204ENST00000490751 NLRP1Q9C000 1473 aa48.41■■■■■ 5.34
LDB1-204ENST00000490751 PKD2Q13563 968 aa48.39■■■■■ 5.34
LDB1-204ENST00000490751 ERVK-7P63135 1459 aa48.38■■■■■ 5.34
LDB1-204ENST00000490751 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP48.36■■■■■ 5.332e-6■□□□□ 10.1
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LDB1-204ENST00000490751 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP48.34■■■■■ 5.33
LDB1-204ENST00000490751 KANK1Q14678 1352 aa48.3■■■■■ 5.32
LDB1-204ENST00000490751 UGGT1Q9NYU2 1555 aa48.3■■■■■ 5.32
LDB1-204ENST00000490751 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP48.29■■■■■ 5.32
LDB1-204ENST00000490751 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa48.28■■■■■ 5.32
LDB1-204ENST00000490751 LTBP4Q8N2S1 1624 aa48.26■■■■■ 5.32
LDB1-204ENST00000490751 VWDEQ8N2E2 1590 aa48.24■■■■■ 5.31
LDB1-204ENST00000490751 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP48.22■■■■■ 5.31
LDB1-204ENST00000490751 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP48.22■■■■■ 5.312e-10■■■□□ 15
LDB1-204ENST00000490751 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa48.22■■■■■ 5.31
LDB1-204ENST00000490751 LMTK2Q8IWU2 1503 aa48.21■■■■■ 5.31
LDB1-204ENST00000490751 NEURL4Q96JN8 1562 aa48.19■■■■■ 5.31
LDB1-204ENST00000490751 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP48.11■■■■■ 5.29
LDB1-204ENST00000490751 ANKLE2Q86XL3 938 aa48.11■■■■■ 5.29
LDB1-204ENST00000490751 UBR1Q8IWV7 1749 aa48.1■■■■■ 5.29
LDB1-204ENST00000490751 ROCK1Q13464 1354 aa48.09■■■■■ 5.29
LDB1-204ENST00000490751 EFCAB6Q5THR3 1501 aa48.08■■■■■ 5.29
LDB1-204ENST00000490751 ITGAEP38570 1179 aa48.04■■■■■ 5.28
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LDB1-204ENST00000490751 MED14O60244 1454 aa47.99■■■■■ 5.27
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LDB1-204ENST00000490751 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP47.98■■■■■ 5.27
LDB1-204ENST00000490751 SYNMO15061 1565 aa47.95■■■■■ 5.27
LDB1-204ENST00000490751 TET3O43151 1660 aa47.94■■■■■ 5.26
LDB1-204ENST00000490751 IQGAP1P46940 1657 aa47.94■■■■■ 5.26
LDB1-204ENST00000490751 NOS1P29475 1434 aa47.91■■■■■ 5.26
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LDB1-204ENST00000490751 GCC2Q8IWJ2 1684 aa47.88■■■■■ 5.26
LDB1-204ENST00000490751 SLIT1O75093 1534 aa47.87■■■■■ 5.25
LDB1-204ENST00000490751 ARHGAP23Q9P227 1491 aa47.87■■■■■ 5.25
LDB1-204ENST00000490751 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
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LDB1-204ENST00000490751 IQGAP3Q86VI3 1631 aa47.81■■■■■ 5.24
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LDB1-204ENST00000490751 LTKP29376 864 aa47.76■■■■■ 5.24
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LDB1-204ENST00000490751 E9PCH4 1651 aa47.73■■■■■ 5.23
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LDB1-204ENST00000490751 EID1Q9Y6B2 187 aa47.71■■■■■ 5.23
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LDB1-204ENST00000490751 UBAP1LF5GYI3 381 aa47.62■■■■■ 5.21
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LDB1-204ENST00000490751 ZFYVE9O95405 1425 aa47.43■■■■■ 5.18
LDB1-204ENST00000490751 HFM1A2PYH4 1435 aa47.42■■■■■ 5.18
LDB1-204ENST00000490751 CHGAP10645 457 aaKnown RBP47.41■■■■■ 5.18
LDB1-204ENST00000490751 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa47.41■■■■■ 5.18
LDB1-204ENST00000490751 RIMS2Q9UQ26 1411 aa47.39■■■■■ 5.18
LDB1-204ENST00000490751 TOM1O60784 492 aa47.36■■■■■ 5.17
LDB1-204ENST00000490751 SLC26A8Q96RN1 970 aa47.35■■■■■ 5.17
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